Zack Galbreath
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01d77ed915
commit
36f32ceda3
@ -1,141 +0,0 @@
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spack:
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view: false
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packages:
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all:
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providers:
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blas:
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- openblas
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mkl:
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- intel-oneapi-mkl
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mpi:
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- openmpi
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- mpich
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variants: +mpi
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tbb:
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require: intel-tbb
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binutils:
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variants: +ld +gold +headers +libiberty ~nls
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version:
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- 2.36.1
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doxygen:
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version:
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- 1.8.20
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elfutils:
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variants: ~nls
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hdf5:
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variants: +fortran +hl +shared
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libfabric:
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variants: fabrics=efa,tcp,udp,sockets,verbs,shm,mrail,rxd,rxm
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libunwind:
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variants: +pic +xz
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mesa:
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variants: ~llvm
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mpich:
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variants: ~wrapperrpath netmod=ofi device=ch4
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ncurses:
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variants: +termlib
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openblas:
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variants: threads=openmp
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openmpi:
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variants: fabrics=ofi +legacylaunchers
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openturns:
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version:
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- '1.18'
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relion:
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variants: ~mklfft
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# texlive:
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# version: [20210325]
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trilinos:
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variants: +amesos +amesos2 +anasazi +aztec +belos +boost +epetra +epetraext
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+ifpack +ifpack2 +intrepid +intrepid2 +isorropia +kokkos +ml +minitensor +muelu
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||||||
+nox +piro +phalanx +rol +rythmos +sacado +stk +shards +shylu +stokhos +stratimikos
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+teko +tempus +tpetra +trilinoscouplings +zoltan +zoltan2 +superlu-dist gotype=long_long
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xz:
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variants: +pic
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definitions:
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- compiler_specs:
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- gcc@11
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# Licensing OK?
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# - intel-oneapi-compilers@2022.1
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# - nvhpc
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- app_specs:
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- bwa
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# Depends on simde which requires newer compiler?
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#- bowtie2
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# Requires x86_64 specific ASM
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#- cistem
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- cromwell
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- fastqc
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- flux-sched
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- flux-core
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- flux-pmix
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- gatk
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- gromacs
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- lammps
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- wrf build_type=dm+sm
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- mfem
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- mpas-model ^parallelio+pnetcdf
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||||||
- nextflow
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- octave
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- openfoam
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- osu-micro-benchmarks
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- parallel
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# - paraview
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- picard
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- quantum-espresso
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- raja
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# Depends on bowtie2 -> simde which requires newer compiler?
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#- rsem
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# Errors on texlive
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#- rstudio
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- salmon
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- samtools
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- seqtk
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- snakemake
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- star
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# Requires gcc@9:
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#- ufs-weather-model
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# requires LLVM which fails without constraint
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#- visit
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- lib_specs:
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- openmpi fabrics=ofi
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- openmpi fabrics=ofi +legacylaunchers
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- openmpi fabrics=auto
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- mpich
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- libfabric
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- compiler:
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- '%gcc@7.3.1'
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- target:
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- target=aarch64
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specs:
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- matrix:
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- - $app_specs
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- - $compiler
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- - $target
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||||||
- matrix:
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- - $lib_specs
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- - $compiler
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||||||
- - $target
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||||||
- matrix:
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- - $compiler_specs
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- - $compiler
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- - $target
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ci:
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pipeline-gen:
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- build-job:
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image: {name: ghcr.io/spack/e4s-amazonlinux-2:v2023-03-09, entrypoint: ['']}
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cdash:
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build-group: AWS Packages
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@ -1,153 +0,0 @@
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spack:
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view: false
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packages:
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all:
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providers:
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blas:
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- openblas
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mkl:
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- intel-oneapi-mkl
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mpi:
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- openmpi
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- mpich
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variants: +mpi
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tbb:
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require: intel-tbb
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binutils:
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variants: +ld +gold +headers +libiberty ~nls
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version:
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- 2.36.1
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doxygen:
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version:
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||||||
- 1.8.20
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elfutils:
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variants: ~nls
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hdf5:
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variants: +fortran +hl +shared
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libfabric:
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||||||
variants: fabrics=efa,tcp,udp,sockets,verbs,shm,mrail,rxd,rxm
|
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libunwind:
|
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||||||
variants: +pic +xz
|
|
||||||
mesa:
|
|
||||||
variants: ~llvm
|
|
||||||
mpich:
|
|
||||||
variants: ~wrapperrpath netmod=ofi device=ch4
|
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||||||
ncurses:
|
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||||||
variants: +termlib
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||||||
openblas:
|
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||||||
variants: threads=openmp
|
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||||||
openmpi:
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||||||
variants: fabrics=ofi +legacylaunchers
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openturns:
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||||||
version:
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||||||
- '1.18'
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relion:
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||||||
variants: ~mklfft
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# texlive:
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# version: [20210325]
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trilinos:
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||||||
variants: +amesos +amesos2 +anasazi +aztec +belos +boost +epetra +epetraext
|
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||||||
+ifpack +ifpack2 +intrepid +intrepid2 +isorropia +kokkos +ml +minitensor +muelu
|
|
||||||
+nox +piro +phalanx +rol +rythmos +sacado +stk +shards +shylu +stokhos +stratimikos
|
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||||||
+teko +tempus +tpetra +trilinoscouplings +zoltan +zoltan2 +superlu-dist gotype=long_long
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||||||
xz:
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||||||
variants: +pic
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||||||
definitions:
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||||||
- compiler_specs:
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||||||
- gcc@11
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# Licensing OK?
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# - intel-oneapi-compilers@2022.1
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# - nvhpc
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- cuda_specs:
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# Disabled for consistency with aarch64
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#- relion +cuda cuda_arch=70
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- raja +cuda cuda_arch=70
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- mfem +cuda cuda_arch=70
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- app_specs:
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- bwa
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# Disabled for consistency with aarch64
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#- bowtie2
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# Disabled for consistency with aarch64
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#- cistem
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||||||
- cromwell
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||||||
- fastqc
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||||||
- flux-sched
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||||||
- flux-core
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||||||
- flux-pmix
|
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||||||
- gatk
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||||||
- gromacs
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||||||
- lammps
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||||||
- wrf build_type=dm+sm
|
|
||||||
- mfem
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||||||
- mpas-model ^parallelio+pnetcdf
|
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||||||
- nextflow
|
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||||||
- octave
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||||||
- openfoam
|
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||||||
- osu-micro-benchmarks
|
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||||||
- parallel
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# - paraview
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- picard
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||||||
- quantum-espresso
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# Build broken for gcc@7.3.1 x86_64_v4 (error: '_mm512_loadu_epi32' was not declared in this scope)
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||||||
#- raja
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||||||
# Disabled for consistency with aarch64
|
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||||||
#- rsem
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# Errors on texlive
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#- rstudio
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||||||
- salmon
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- samtools
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||||||
- seqtk
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||||||
- snakemake
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||||||
- star
|
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||||||
# Requires gcc@9:
|
|
||||||
#- ufs-weather-model
|
|
||||||
# Disabled for consistency with aarch64
|
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#- visit
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- lib_specs:
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- openmpi fabrics=ofi
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- openmpi fabrics=ofi +legacylaunchers
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- openmpi fabrics=auto
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- mpich
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||||||
- libfabric
|
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||||||
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||||||
- compiler:
|
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||||||
- '%gcc@7.3.1'
|
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||||||
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||||||
- target:
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- target=x86_64_v3
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specs:
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- matrix:
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- - $cuda_specs
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- - $compiler
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- - $target
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||||||
|
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||||||
- matrix:
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||||||
- - $app_specs
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||||||
- - $compiler
|
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||||||
- - $target
|
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||||||
|
|
||||||
- matrix:
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|
||||||
- - $lib_specs
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||||||
- - $compiler
|
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||||||
- - $target
|
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||||||
|
|
||||||
- matrix:
|
|
||||||
- - $compiler_specs
|
|
||||||
- - $compiler
|
|
||||||
- - $target
|
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||||||
|
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||||||
ci:
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pipeline-gen:
|
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||||||
- build-job:
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image: {name: ghcr.io/spack/e4s-amazonlinux-2:v2023-03-09, entrypoint: ['']}
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cdash:
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build-group: AWS Packages
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