zhangyiss/spack
1
0
Fork 0
Code Issues Pull Requests Actions Packages Projects Releases Wiki Activity
Files
3e79872ada25171452c64361057c922498699b22
spack/var/spack/repos/builtin/packages
History
Audrey Thoma 3e79872ada sra-toolkit: new package (#5588) 
* sra-toolkit: new package

* adding description and homepage
2017-10-03 14:41:41 -06:00
..
abinit
…
abyss
…
ack
Ack: add version 2.18 (#5445)
2017-09-22 19:30:12 -07:00
activeharmony
…
adept-utils
…
adios
adios: fixed conditional dependencies on libevpath and dataspaces (#5392)
2017-09-19 14:13:26 +02:00
adios2
…
adlbx
…
adol-c
…
albert
…
alglib
…
allinea-forge
…
allinea-reports
…
allpaths-lg
…
alquimia
…
alsa-lib
…
amg2013
…
ampliconnoise
…
amr-exp-parabolic
…
amrex
fixing tag name for development branch (#5496)
2017-09-28 18:12:02 -07:00
andi
…
angsd
…
ant
…
antlr
…
ape
…
apex
…
applewmproto
…
appres
…
apr
…
apr-util
…
archer
…
argtable
…
armadillo
fix armadillo macro expansions (#5268)
2017-09-10 16:04:02 -10:00
arpack-ng
…
asciidoc
…
aspa
…
assimp
add assimp package. link against it in dealii (#5463)
2017-09-25 06:58:13 -06:00
astra
…
astral
…
astyle
astyle: homepage dead, use mirror (#5483)
2017-09-26 13:03:34 -06:00
atk
…
atlas
blas_lapack: add multithreading variant consistent in all implementations. (#5340)
2017-09-23 13:27:42 -07:00
atompaw
…
atop
…
augustus
augustus: url fix (#5311)
2017-09-16 10:20:42 +02:00
autoconf
autoconf, automake: Add missing perl dependency (#5187)
2017-09-26 08:10:22 -06:00
autodock-vina
Autodock vina: spec (#5333)
2017-09-26 14:44:21 -06:00
autogen
…
automaded
…
automake
autoconf, automake: Add missing perl dependency (#5187)
2017-09-26 08:10:22 -06:00
bamtools
…
bamutil
…
bash
…
bash-completion
…
bats
…
bazel
…
bbcp
…
bbmap
bbmap: new package (#5396)
2017-09-20 14:41:25 -07:00
bcftools
…
bcl2fastq2
…
bdftopcf
…
bdw-gc
…
bear
…
beast2
…
bedtools2
…
beforelight
…
benchmark
…
berkeley-db
berkeley-db: initial commit (#5303)
2017-09-11 13:25:36 -07:00
bertini
…
bib2xhtml
…
bigreqsproto
…
binutils
…
bioawk
Bioawk: added new package (#5375)
2017-09-16 09:14:57 +02:00
bison
…
bitmap
…
blast-plus
…
blat
…
blaze
…
bliss
…
blitz
…
bml
Added support for BML+mpi variant (#5563)
2017-10-02 12:51:06 -06:00
boost
Boost: 1.65.1 (#5330)
2017-09-13 22:45:28 +02:00
boostmplcartesianproduct
…
bowtie
…
bowtie2
…
boxlib
…
bpp-core
…
bpp-phyl
…
bpp-seq
…
bpp-suite
…
braker
…
branson
Added spackage for branson (#5520)
2017-09-27 21:50:07 -06:00
brigand
…
bsseeker2
…
bucky
…
busco
…
butter
…
bwa
…
bzip2
dealii: explicitly specify bzip2 libs (#5337)
2017-09-11 20:47:05 -07:00
c-blosc
…
caffe
Missing opencv dependencies (#5285)
2017-09-10 14:38:11 -10:00
cairo
…
caliper
…
callpath
…
cantera
…
canu
…
cap3
…
cares
…
cask
…
catch
…
cbench
…
cblas
…
cbtf
…
cbtf-argonavis
…
cbtf-argonavis-gui
…
cbtf-krell
Add ability to build llvm-openmp-ompt alone, with gnu compilers and use the resulting ompt interface in cbtf-krell and openspeedshop to gather openmp specific performance information. (#5288)
2017-09-26 14:15:37 -06:00
cbtf-lanl
…
ccache
…
cctools
…
cdbfasta
…
cdd
…
cddlib
…
cdhit
…
cdo
…
cereal
fix install method of cereal (#5094)
2017-09-21 07:10:51 -06:00
cfitsio
…
cgal
…
cgm
…
cgns
Update recipe for cgns to avoid build warnings/errors: (#5382)
2017-09-20 18:21:14 -06:00
charm
…
check
…
chlorop
…
chombo
…
cityhash
…
clamr
…
cleaveland4
…
cleverleaf
…
clfft
…
clhep
…
cloc
Provide a new Perl package 'cloc'. (#5525)
2017-09-28 11:30:08 -06:00
cloog
…
cloverleaf
…
cloverleaf3d
…
clustalo
…
clustalw
…
cmake
…
cmocka
…
cmor
…
cnmem
…
cnpy
…
cns-nospec
…
cntk
Cntk: fixed dependency on protobuf fixes #5266 (#5267)
2017-09-16 10:24:40 +02:00
cntk1bitsgd
…
codar-cheetah
…
coevp
Added CoEVP Spackage (#5485)
2017-09-27 21:41:34 -06:00
cohmm
…
coinhsl
…
comd
…
compiz
…
compositeproto
…
conduit
update for conduit 0.3.0 release (#5421)
2017-09-25 12:25:40 -06:00
constype
…
converge
…
coreutils
…
corset
…
cosmomc
…
cosp2
…
cp2k
…
cppad
…
cppcheck
…
cpprestsdk
…
cppunit
…
cppzmq
…
cram
…
cryptopp
…
cscope
…
csdp
…
cub
…
cube
…
cuda
CUDA 9.0.176 (#5562)
2017-10-02 10:47:32 -06:00
cuda-memtest
…
cudnn
…
cufflinks
…
cups
…
curl
…
cvs
…
czmq
…
dakota
…
daligner
…
damageproto
…
damselfly
…
darshan-runtime
…
darshan-util
…
dash
…
datamash
…
dataspaces
…
dbus
…
dealii
add assimp package. link against it in dealii (#5463)
2017-09-25 06:58:13 -06:00
dejagnu
…
dia
…
dialign-tx
…
direnv
…
discovar
…
dmxproto
…
docbook-xml
…
docbook-xsl
…
dos2unix
…
double-conversion
…
doxygen
…
dri2proto
…
dri3proto
…
dtcmp
…
dyninst
…
ea-utils
…
easybuild
…
ebms
…
eccodes
…
editres
…
eigen
…
elemental
blas_lapack: add multithreading variant consistent in all implementations. (#5340)
2017-09-23 13:27:42 -07:00
elfutils
…
elk
…
elpa
…
emacs
emacs: add version 25.3 (security update) (#5447)
2017-09-22 16:34:59 -07:00
emboss
…
encodings
…
environment-modules
Bootstrap environment-modules
2017-09-08 10:15:06 -07:00
es
…
esmf
…
espresso
…
espressopp
…
etsf-io
…
everytrace
…
everytrace-example
…
evieext
…
exabayes
…
exampm
ExaMPM (#5509)
2017-09-27 21:46:32 -06:00
exmcutils
…
exodusii
…
exonerate
…
expat
…
expect
…
extrae
…
exuberant-ctags
…
f90cache
…
falcon
…
farmhash
…
fastjar
…
fastmath
Rm arpack parpack (#5391)
2017-09-20 18:19:04 -06:00
fastphase
…
fastq-screen
fastq-screen: new package (#5431)
2017-09-28 12:48:31 -06:00
fastqc
…
fastx-toolkit
…
fenics
…
ferret
…
ffmpeg
…
fftw
…
fimpute
…
findutils
…
fio
…
fish
…
fixesproto
…
flac
…
flann
flann: fix build for 1.8.1 (#5508)
2017-09-27 14:39:33 -07:00
flash
…
flecsale
…
flecsi
…
flex
…
flint
…
fltk
…
flux
…
fmt
…
foam-extend
…
folly
…
font-adobe-75dpi
…
font-adobe-100dpi
…
font-adobe-utopia-75dpi
…
font-adobe-utopia-100dpi
…
font-adobe-utopia-type1
…
font-alias
…
font-arabic-misc
…
font-bh-75dpi
…
font-bh-100dpi
…
font-bh-lucidatypewriter-75dpi
…
font-bh-lucidatypewriter-100dpi
…
font-bh-ttf
…
font-bh-type1
…
font-bitstream-75dpi
…
font-bitstream-100dpi
…
font-bitstream-speedo
…
font-bitstream-type1
…
font-cronyx-cyrillic
…
font-cursor-misc
…
font-daewoo-misc
…
font-dec-misc
…
font-ibm-type1
…
font-isas-misc
…
font-jis-misc
…
font-micro-misc
…
font-misc-cyrillic
…
font-misc-ethiopic
…
font-misc-meltho
…
font-misc-misc
…
font-mutt-misc
…
font-schumacher-misc
…
font-screen-cyrillic
…
font-sony-misc
…
font-sun-misc
…
font-util
…
font-winitzki-cyrillic
…
font-xfree86-type1
…
fontcacheproto
…
fontconfig
…
fontsproto
…
fonttosfnt
…
freebayes
…
freetype
…
fseq
…
fslsfonts
…
fstobdf
…
funhpc
…
gapcloser
…
gapfiller
…
gasnet
…
gaussian
…
gawk
…
gblocks
…
gcc
…
gccmakedep
…
gccxml
…
gconf
…
gdal
…
gdb
…
gdbm
…
gdk-pixbuf
…
geant4
…
gearshifft
…
gemmlowp
…
genemark-et
…
genometools
…
geos
…
gettext
…
gflags
…
ghostscript
…
ghostscript-fonts
…
giflib
…
git
Update git to @2.14.1, requires pcre+jit variant (#5430)
2017-09-22 16:43:45 -07:00
git-lfs
git-lfs: add 2.2.1 and 2.3.0 (#5429)
2017-09-22 16:36:57 -07:00
gl2ps
…
glew
…
glib
Missing perl dependencies (#5204)
2017-09-26 07:27:28 -06:00
glm
…
global
…
globalarrays
…
globus-toolkit
…
glog
Change glog from Autotools to CMakePackage (#5323)
2017-09-10 13:22:47 -10:00
glpk
…
glproto
…
gmake
…
gmap-gsnap
…
gmime
…
gmp
…
gmsh
…
gnat
…
gnu-prolog
…
gnupg
…
gnuplot
…
gnutls
…
go
…
go-bootstrap
…
gobject-introspection
…
googletest
add variant gmock to googletest (#5278)
2017-09-18 19:28:33 -07:00
gource
…
gperf
…
gperftools
…
grackle
…
gradle
…
grandr
…
graphlib
…
graphmap
…
graphviz
…
grib-api
…
groff
…
gromacs
gromacs: added 2016.4 (#5376)
2017-09-16 09:12:02 +02:00
gsl
…
gtkorvo-atl
…
gtkorvo-cercs-env
…
gtkorvo-dill
…
gtkorvo-enet
…
gtkplus
…
gts
…
guile
…
h5hut
…
h5part
…
h5utils
…
h5z-zfp
…
hacckernels
Added hacckernels package (#5533)
2017-09-28 12:46:26 -06:00
hadoop
…
hapcut2
…
haploview
…
harfbuzz
…
harminv
…
hdf
…
hdf5
hdf5: fix macOS build by not using numactl (#5458)
2017-09-23 22:34:00 -06:00
hdf5-blosc
…
help2man
…
hepmc
…
heppdt
…
highfive
…
highwayhash
…
hisat2
hisat2: new package (#5488)
2017-10-02 10:27:06 -07:00
hmmer
…
hoomd-blue
…
hpccg
…
hpctoolkit
Update hpctoolkit and externals to latest release
2017-09-15 12:58:33 -07:00
hpctoolkit-externals
Update hpctoolkit and externals to latest release
2017-09-15 12:58:33 -07:00
hpl
…
hpx
…
hpx5
…
hsakmt
…
hstr
…
htop
…
htslib
…
httpie
Add info for httpie@0.9.9 (#5451)
2017-09-23 00:40:22 +00:00
hub
…
hunspell
…
hwloc
…
hybpiper
…
hydra
…
hypre
…
ibmisc
…
iceauth
…
icedtea
…
icet
…
ico
…
icu4c
…
id3lib
…
idba
…
igraph
…
ilmbase
…
image-magick
…
imake
…
impute2
…
infernal
…
inputproto
…
intel
added Intel 2018 tools (#5404)
2017-09-20 18:15:20 -06:00
intel-daal
add Intel 2018 libraries (#5354)
2017-09-16 10:10:08 +02:00
intel-gpu-tools
…
intel-ipp
add Intel 2018 libraries (#5354)
2017-09-16 10:10:08 +02:00
intel-mkl
blas_lapack: add multithreading variant consistent in all implementations. (#5340)
2017-09-23 13:27:42 -07:00
intel-mpi
add Intel 2018 libraries (#5354)
2017-09-16 10:10:08 +02:00
intel-parallel-studio
blas_lapack: add multithreading variant consistent in all implementations. (#5340)
2017-09-23 13:27:42 -07:00
intel-tbb
tbb: add 2018 (#5359)
2017-09-17 11:32:19 -07:00
intltool
…
ior
Chnage IOR to AutotoolsPackage; remove hard-coded mpicc path (#5318)
2017-09-10 13:17:54 -10:00
iozone
…
ipopt
…
isaac
…
isaac-server
…
isl
…
itstool
…
itsx
…
jags
…
jansson
…
jasper
…
jdk
…
jemalloc
…
jmol
…
jq
…
json-c
…
jsoncpp
…
judy
…
julia
…
kahip
…
kaldi
…
kallisto
…
kbproto
…
kdiff3
…
kealib
…
kentutils
…
kmergenie
…
kokkos
…
kripke
…
lammps
lammps: add user-omp package (#5486)
2017-09-27 12:46:58 -07:00
last
…
latte
latte: add v1.0.1 (#5403)
2017-09-20 19:02:45 -07:00
launchmon
…
lbann
…
lbxproxy
…
lcals
…
lcms
…
ldc
Added 'ldc' compiler for D language based on LLVM (#5279)
2017-09-11 21:54:38 +02:00
ldc-bootstrap
Added 'ldc' compiler for D language based on LLVM (#5279)
2017-09-11 21:54:38 +02:00
legion
…
leveldb
…
lftp
Add info for lftp@4.8.1 (#5452)
2017-09-23 00:39:49 +00:00
libaec
…
libaio
…
libapplewm
…
libarchive
…
libassuan
…
libatomic-ops
…
libbeagle
…
libbsd
…
libbson
libbson, libmongoc: Update to 1.8.0 (#5478)
2017-09-27 10:19:10 -06:00
libcanberra
…
libcap
…
libcerf
…
libcircle
…
libconfig
…
libctl
…
libdivsufsort
…
libdmx
…
libdrm
…
libdwarf
…
libedit
…
libelf
…
libemos
…
libepoxy
…
libevent
…
libevpath
…
libfabric
…
libffi
…
libffs
…
libfontenc
…
libfs
…
libgcrypt
…
libgd
…
libgit2
…
libgpg-error
…
libgpuarray
Libgpuarray requires CMake 3.0 or higher (#5326)
2017-09-10 10:06:13 +02:00
libgtextutils
…
libharu
…
libhio
…
libice
…
libiconv
…
libint
…
libjpeg
…
libjpeg-turbo
…
libksba
…
liblbxutil
…
libmatheval
…
libmesh
…
libmng
…
libmongoc
libbson, libmongoc: Update to 1.8.0 (#5478)
2017-09-27 10:19:10 -06:00
libmonitor
…
libnbc
…
libogg
…
liboldx
…
libpciaccess
…
libpfm4
…
libpipeline
…
libpng
…
libpsl
Add test deptype (#5132)
2017-09-29 22:08:15 -07:00
libpthread-stubs
…
libquo
…
libsigsegv
…
libsm
…
libsodium
libsodium: update URLs (#5355)
2017-09-14 08:16:54 -05:00
libspatialindex
…
libsplash
…
libssh2
…
libsvm
…
libszip
…
libtermkey
…
libtiff
…
libtool
…
libunistring
…
libunwind
…
libuuid
…
libuv
…
libvorbis
…
libvterm
…
libwebsockets
…
libwindowswm
…
libx11
Missing perl dependencies (#5204)
2017-09-26 07:27:28 -06:00
libxau
…
libxaw
…
libxaw3d
…
libxc
…
libxcb
…
libxcomposite
…
libxcursor
…
libxdamage
…
libxdmcp
…
libxevie
…
libxext
…
libxfixes
…
libxfont
…
libxfont2
…
libxfontcache
…
libxft
…
libxi
…
libxinerama
…
libxkbfile
…
libxkbui
…
libxml2
…
libxmu
…
libxp
…
libxpm
…
libxpresent
…
libxprintapputil
…
libxprintutil
…
libxrandr
…
libxrender
…
libxres
…
libxscrnsaver
…
libxshmfence
…
libxslt
…
libxsmm
…
libxstream
…
libxt
…
libxtrap
…
libxtst
…
libxv
…
libxvmc
…
libxxf86dga
…
libxxf86misc
…
libxxf86vm
…
libyogrt
…
libzip
…
likwid
Missing perl dependencies (#5204)
2017-09-26 07:27:28 -06:00
linkphase3
linkphase3: new package (#5493)
2017-10-02 12:36:39 -06:00
linux-headers
…
listres
…
llvm
llvm: patch lldb for gcc-7 (#5239)
2017-09-24 10:24:36 +02:00
llvm-lld
…
llvm-openmp-ompt
Add ability to build llvm-openmp-ompt alone, with gnu compilers and use the resulting ompt interface in cbtf-krell and openspeedshop to gather openmp specific performance information. (#5288)
2017-09-26 14:15:37 -06:00
lmdb
…
lmod
Add info for lmod@7.7 and lmod@7.6.14 (#5450)
2017-09-25 07:31:43 -06:00
lndir
…
log4cxx
…
lrslib
…
lrzip
…
lua
…
lua-bitlib
…
lua-jit
…
lua-lpeg
…
lua-luafilesystem
…
lua-luaposix
…
lua-mpack
…
luit
…
lulesh
…
lwgrp
…
lwm2
…
lz4
…
lzma
…
lzo
…
m4
…
mad-numdiff
…
mafft
…
magics
…
magma
…
makedepend
…
mallocmc
…
man-db
…
mariadb
orthomcl: new package (#5345)
2017-09-20 15:12:52 -07:00
masa
Masa requires python if +python. (#5547)
2017-09-29 16:14:12 -06:00
matio
…
matlab
…
maven
…
maverick
…
mawk
…
mbedtls
…
mcl
…
mdtest
…
meep
…
memaxes
…
meme
…
mercurial
…
mesa
mesa: merge multiple branches into one (#5170)
2017-09-18 11:10:54 -07:00
mesa-glu
…
meshkit
…
meson
…
mesquite
…
metaphysicl
Add metaphysicl package (#5539)
2017-09-28 18:02:07 -07:00
metis
…
mfem
…
microbiomeutil
…
miniaero
…
miniamr
…
miniconda2
…
miniconda3
…
minife
…
minighost
…
minigmg
…
minimd
…
minismac2d
…
minixyce
…
mirdeep
mirdeep: new package (#5302)
2017-09-20 15:48:20 -07:00
mitofates
…
mitos
…
mkfontdir
…
mkfontscale
…
mlhka
…
moab
…
molcas
…
mono
Add info for mono@5.4.0.167 (#5405)
2017-09-20 18:44:53 -06:00
mosh
New version for mosh1.3.2 (#5448)
2017-09-24 15:12:35 -06:00
mothur
…
mozjs
…
mpc
…
mpe2
…
mpest
…
mpfr
Tell configure about gmp (#5585)
2017-10-03 14:40:14 -06:00
mpibash
…
mpiblast
…
mpich
Additional MPICH configs (#5259)
2017-09-27 10:50:05 -07:00
mpifileutils
…
mpileaks
…
mpip
…
mpir
…
mpix-launch-swift
…
mrbayes
…
mrnet
…
mrtrix3
mrtrix3: new package (#5568)
2017-10-02 15:56:15 -06:00
msgpack-c
…
multiverso
…
mummer
…
mumps
…
munge
…
muparser
…
muscle
…
muse
…
muster
…
mvapich2
…
mxml
…
nag
…
nalu
Adding new Trilinos version and updating Nalu to utilize it. (#5552)
2017-09-29 15:31:15 -06:00
namd
…
nano
…
nanoflann
…
nasm
…
nauty
Patches are hashed with specs, and can be associated with dependencies.
2017-09-30 02:06:59 -07:00
nccl
…
nccmp
…
ncdu
…
ncftp
…
ncl
ncl: Add tcsh dependency (#5195)
2017-09-28 12:51:04 -06:00
nco
…
ncurses
…
ncview
…
ndiff
…
nekbone
…
neovim
…
netcdf
…
netcdf-cxx
…
netcdf-cxx4
…
netcdf-fortran
…
netgauge
…
netgen
…
netlib-lapack
…
netlib-scalapack
…
nettle
…
nextflow
…
nfft
…
nginx
…
ngmlr
…
ninja
…
ninja-fortran
…
nmap
…
node-js
…
notmuch
…
npb
…
npm
…
npth
…
nspr
…
numactl
New Pcakage: numactl (#5371)
2017-09-16 13:00:32 -07:00
numdiff
…
nut
…
nwchem
Patches are hashed with specs, and can be associated with dependencies.
2017-09-30 02:06:59 -07:00
ocaml
…
oce
…
oclock
…
octave
…
octave-splines
…
octopus
…
of-adios-write
…
ompss
…
ompt-openmp
…
oniguruma
…
ont-albacore
…
opari2
…
openbabel
…
openblas
blas_lapack: add multithreading variant consistent in all implementations. (#5340)
2017-09-23 13:27:42 -07:00
opencoarrays
…
opencv
Opencv: fix dependencies and variants (#5232)
2017-09-20 21:37:52 -07:00
openexr
…
openfoam-com
Restrict openfoam to using openmpi+thread_multiple (partially resolves #5428) (#5479)
2017-09-28 14:42:14 -06:00
openfoam-org
…
openfst
…
openjpeg
…
openmc
…
openmpi
OpenMPI: add 2.1.2 bug fix release (#5418)
2017-09-21 13:26:23 -07:00
openscenegraph
…
openspeedshop
…
openssh
…
openssl
…
opium
…
opus
…
orfm
…
orthomcl
orthomcl: new package (#5345)
2017-09-20 15:12:52 -07:00
osu-micro-benchmarks
…
otf
…
otf2
…
p4est
…
p7zip
added p7zip package (#5394)
2017-09-19 22:51:32 +02:00
pacbio-daligner
…
pacbio-damasker
…
pacbio-dazz-db
…
pacbio-dextractor
…
pagit
…
pagmo
…
paml
…
panda
…
pango
…
papi
…
paradiseo
…
parallel
…
parallel-netcdf
…
paraver
…
paraview
- build paraview without qt when osmesa is specified. (#5480)
2017-09-27 22:32:10 -06:00
parmetis
…
parmgridgen
…
parsimonator
…
parsplice
parsplice: add version 1.1 (#5461)
2017-09-23 20:28:40 -07:00
partitionfinder
…
patch
…
patchelf
…
pathfinder
…
pax-utils
…
pbmpi
…
pcma
…
pcre
Update git to @2.14.1, requires pcre+jit variant (#5430)
2017-09-22 16:43:45 -07:00
pcre2
…
pdsh
…
pdt
Improve PDToolkit support for different compilers (#5322)
2017-09-10 13:16:49 -10:00
pegtl
…
pennant
…
perl
…
perl-capture-tiny
fastq-screen: new package (#5431)
2017-09-28 12:48:31 -06:00
perl-dbfile
…
perl-dbi
…
perl-devel-cycle
mirdeep: new package (#5302)
2017-09-20 15:48:20 -07:00
perl-extutils-makemaker
…
perl-extutils-pkgconfig
fastq-screen: new package (#5431)
2017-09-28 12:48:31 -06:00
perl-font-ttf
mirdeep: new package (#5302)
2017-09-20 15:48:20 -07:00
perl-gd
fastq-screen: new package (#5431)
2017-09-28 12:48:31 -06:00
perl-gd-graph
fastq-screen: new package (#5431)
2017-09-28 12:48:31 -06:00
perl-gd-text
fastq-screen: new package (#5431)
2017-09-28 12:48:31 -06:00
perl-intervaltree
…
perl-math-cdf
…
perl-module-build
…
perl-padwalker
mirdeep: new package (#5302)
2017-09-20 15:48:20 -07:00
perl-pdf-api2
mirdeep: new package (#5302)
2017-09-20 15:48:20 -07:00
perl-star-fusion
…
perl-sub-uplevel
mirdeep: new package (#5302)
2017-09-20 15:48:20 -07:00
perl-term-readkey
…
perl-test-exception
mirdeep: new package (#5302)
2017-09-20 15:48:20 -07:00
perl-test-memory-cycle
mirdeep: new package (#5302)
2017-09-20 15:48:20 -07:00
perl-uri-escape
…
perl-xml-parser
…
petsc
…
pexsi
…
pfft
…
pflotran
…
pgdspider
…
pgi
…
phasta
…
phylip
…
picard
…
pidx
…
pigz
…
piranha
…
pixman
…
pkg-config
…
pkgconf
…
planck-likelihood
…
plink
…
plumed
plumed: fixed possible linking issue (#5425)
2017-09-22 21:14:53 +02:00
pmgr-collective
…
pmix
PMIx: add PMIx package to Spack (#5426)
2017-09-22 11:27:28 -06:00
pnfft
…
pngwriter
…
poamsa
…
pocl
…
polymake
…
porta
…
portage
…
postgresql
…
ppl
…
prank
…
presentproto
…
preseq
…
price
…
primer3
…
printproto
…
probconsrna
…
proj
…
protobuf
Fix Protobuf URLs (#5373)
2017-09-25 10:47:55 -07:00
proxymngr
…
pruners-ninja
…
psi4
…
pstreams
…
pugixml
…
pumi
…
pvm
…
py-3to2
…
py-4suite-xml
…
py-abipy
…
py-alabaster
…
py-apache-libcloud
…
py-apipkg
…
py-appdirs
…
py-appnope
…
py-apscheduler
…
py-argcomplete
…
py-argparse
…
py-ase
…
py-asn1crypto
…
py-astroid
…
py-astropy
…
py-attrs
…
py-autopep8
…
py-babel
…
py-backports-abc
…
py-backports-shutil-get-terminal-size
…
py-backports-ssl-match-hostname
…
py-basemap
…
py-beautifulsoup4
…
py-binwalk
…
py-biom-format
…
py-biopython
…
py-bleach
…
py-blessings
…
py-bokeh
…
py-boltons
…
py-bottleneck
…
py-brian
…
py-brian2
…
py-bsddb3
Feature/methycode (#5374)
2017-09-16 12:58:04 -07:00
py-cclib
…
py-cdat-lite
…
py-cdo
…
py-certifi
…
py-cffi
…
py-chardet
…
py-click
…
py-colorama
…
py-colormath
…
py-configparser
…
py-counter
…
py-coverage
…
py-cpuinfo
…
py-cryptography
…
py-csvkit
Version fixes for py-csvkit (#5393)
2017-09-22 10:06:15 -07:00
py-current
…
py-cutadapt
…
py-cycler
…
py-cython
…
py-dask
…
py-dateutil
Version fixes for py-csvkit (#5393)
2017-09-22 10:06:15 -07:00
py-dbf
Version fixes for py-csvkit (#5393)
2017-09-22 10:06:15 -07:00
py-decorator
…
py-deeptools
…
py-dev
…
py-dill
…
py-docutils
…
py-doxypy
…
py-doxypypy
…
py-dryscrape
…
py-dxchange
…
py-dxfile
…
py-easybuild-easyblocks
…
py-easybuild-easyconfigs
…
py-easybuild-framework
…
py-edffile
…
py-elasticsearch
…
py-elephant
…
py-emcee
…
py-entrypoints
…
py-enum34
…
py-epydoc
…
py-et-xmlfile
…
py-execnet
…
py-fastaindex
…
py-fasteners
…
py-faststructure
…
py-fiscalyear
…
py-flake8
patch py-mccabe and py-flake8 to not require pytest-runner for install (#5427)
2017-09-25 12:46:47 -07:00
py-flask
…
py-flexx
…
py-funcsigs
…
py-functools32
…
py-future
…
py-futures
…
py-genders
…
py-genshi
…
py-git2
…
py-git-review
…
py-gnuplot
…
py-griddataformats
…
py-guidata
…
py-guiqwt
…
py-h5py
…
py-html2text
…
py-html5lib
…
py-httpbin
…
py-hypothesis
…
py-idna
…
py-igraph
…
py-imagesize
…
py-iminuit
…
py-importlib
…
py-ipaddress
…
py-ipdb
…
py-ipykernel
…
py-ipython
…
py-ipython-genutils
…
py-ipywidgets
…
py-itsdangerous
…
py-jdcal
…
py-jedi
…
py-jinja2
…
py-joblib
…
py-jpype
…
py-jsonschema
…
py-junit-xml
…
py-jupyter-client
…
py-jupyter-console
…
py-jupyter-core
…
py-jupyter-notebook
…
py-keras
…
py-latexcodec
…
py-lazy
…
py-lazyarray
…
py-libconf
…
py-line-profiler
add package py-line-profiler (#5291)
2017-09-10 14:35:17 -10:00
py-lit
…
py-lmfit
…
py-lockfile
…
py-logilab-common
…
py-lxml
…
py-lzstring
…
py-macholib
…
py-machotools
…
py-macs2
…
py-mako
…
py-markdown
…
py-markupsafe
…
py-matplotlib
Fix matplotlib build issue with intel compiler (#5321)
2017-09-10 13:15:12 -10:00
py-mccabe
patch py-mccabe and py-flake8 to not require pytest-runner for install (#5427)
2017-09-25 12:46:47 -07:00
py-mdanalysis
…
py-meep
…
py-memory-profiler
Add package py-memory-profiler (#5413)
2017-09-21 20:00:09 -06:00
py-methylcode
Feature/methycode (#5374)
2017-09-16 12:58:04 -07:00
py-misopy
…
py-mistune
…
py-mock
…
py-mongo
…
py-monotonic
…
py-monty
…
py-mpi4py
…
py-mpmath
…
py-multiprocess
…
py-multiqc
…
py-mx
…
py-myhdl
…
py-mysqldb1
…
py-nbconvert
…
py-nbformat
…
py-neo
…
py-nestle
…
py-netcdf4
…
py-netifaces
…
py-networkx
…
py-nose
…
py-nosexcover
…
py-numexpr
…
py-numpy
…
py-numpydoc
…
py-olefile
…
py-ont-fast5-api
…
py-openpyxl
Version fixes for py-csvkit (#5393)
2017-09-22 10:06:15 -07:00
py-ordereddict
…
py-oset
…
py-packaging
…
py-palettable
…
py-pandas
…
py-paramiko
…
py-pathlib2
…
py-pathos
…
py-pathspec
…
py-patsy
…
py-pbr
…
py-periodictable
…
py-petsc4py
…
py-pexpect
…
py-phonopy
…
py-pickleshare
…
py-pil
…
py-pillow
…
py-pip
…
py-pipits
…
py-pkgconfig
…
py-ply
…
py-pmw
…
py-pox
…
py-ppft
…
py-prettytable
…
py-proj
…
py-prompt-toolkit
…
py-protobuf
…
py-psutil
…
py-ptyprocess
…
py-pudb
…
py-py
…
py-py2bit
…
py-py2cairo
…
py-py2neo
…
py-py4j
…
py-pyasn1
…
py-pybigwig
…
py-pybind11
add new version to package py-pybind11
2017-09-15 10:13:47 -07:00
py-pybtex
…
py-pybtex-docutils
…
py-pychecker
…
py-pycodestyle
…
py-pycparser
…
py-pycrypto
…
py-pycurl
…
py-pydatalog
…
py-pydispatcher
…
py-pydot
…
py-pyelftools
…
py-pyfasta
Feature/methycode (#5374)
2017-09-16 12:58:04 -07:00
py-pyfftw
…
py-pyflakes
…
py-pygments
…
py-pygobject
…
py-pygtk
…
py-pylint
…
py-pymatgen
…
py-pyminifier
…
py-pympler
…
py-pynn
…
py-pypar
…
py-pyparsing
…
py-pypeflow
…
py-pyprof2html
…
py-pyqt
…
py-pyrad
…
py-pysam
…
py-pyscaf
…
py-pyserial
…
py-pyside
…
py-pysocks
…
py-pytables
…
py-pytest
…
py-pytest-cov
…
py-pytest-flake8
…
py-pytest-httpbin
…
py-pytest-mock
…
py-pytest-runner
…
py-pytest-xdist
…
py-python-daemon
…
py-python-gitlab
…
py-pythonqwt
…
py-pytz
…
py-pywavelets
…
py-pyyaml
…
py-qtawesome
…
py-qtconsole
…
py-qtpy
…
py-quantities
pr-quantities: add version & py-numpy conflict (#5307)
2017-09-19 13:10:13 -07:00
py-radical-utils
…
py-ranger
…
py-readme-renderer
…
py-regex
…
py-requests
…
py-restview
…
py-rope
…
py-rpy2
…
py-rsa
…
py-rtree
…
py-saga-python
…
py-scientificpython
…
py-scikit-image
…
py-scikit-learn
…
py-scipy
…
py-seaborn
…
py-setuptools
…
py-sh
…
py-shiboken
…
py-simplegeneric
…
py-simplejson
…
py-singledispatch
…
py-sip
…
py-six
…
py-slepc4py
…
py-sncosmo
…
py-snowballstemmer
…
py-spectra
…
py-spefile
…
py-spglib
…
py-sphinx
…
py-sphinx-bootstrap-theme
…
py-sphinx-rtd-theme
…
py-sphinxcontrib-bibtex
…
py-sphinxcontrib-programoutput
…
py-sphinxcontrib-websupport
…
py-spyder
…
py-spykeutils
…
py-sqlalchemy
…
py-statsmodels
…
py-storm
…
py-subprocess32
…
py-symengine
…
py-symfit
…
py-sympy
…
py-tabulate
…
py-tappy
…
py-terminado
…
py-theano
…
py-tifffile
…
py-tomopy
…
py-tornado
…
py-tqdm
…
py-traitlets
…
py-tuiview
…
py-twisted
…
py-typing
…
py-tzlocal
…
py-unittest2
…
py-unittest2py3k
…
py-urllib3
…
py-urwid
…
py-vcversioner
…
py-virtualenv
…
py-vsc-base
…
py-vsc-install
…
py-wcsaxes
…
py-wcwidth
…
py-webkit-server
…
py-werkzeug
…
py-wheel
…
py-widgetsnbextension
…
py-wrapt
…
py-xarray
…
py-xlrd
…
py-xmlrunner
…
py-xopen
…
py-xpyb
…
py-xvfbwrapper
…
py-yapf
…
py-yt
…
py-zmq
…
python
Update pic/shared variants for hdf5, python, silo (#5423)
2017-09-21 18:14:31 -07:00
qbank
…
qbox
…
qhull
…
qmd-progress
qmd-progress: add shared variant (#5381)
2017-09-18 15:36:42 -07:00
qrupdate
…
qt
…
qt-creator
added qt creator version 4.4.0 (#5518)
2017-09-27 21:49:33 -06:00
qtgraph
…
qthreads
…
quinoa
…
qwt
…
r
…
r-a4classif
r-a4classif: new package. (#5557)
2017-09-29 16:06:27 -06:00
r-a4core
r-a4core: new package. (#5512)
2017-09-27 21:47:12 -06:00
r-a4preproc
r-a4preproc: Create new package. (#5499)
2017-09-29 15:27:20 -06:00
r-a4reporting
r-a4reporting: new package. (#5575)
2017-10-02 15:54:44 -06:00
r-abind
…
r-ada
…
r-adabag
…
r-ade4
…
r-adegenet
…
r-affy
r-affy: created new package (#5471)
2017-09-25 16:57:56 -06:00
r-affyio
r-affyio: created new package (#5433)
2017-09-23 14:58:06 +00:00
r-annaffy
r-annaffy: new package. (#5414)
2017-09-28 12:49:31 -06:00
r-annotate
r-annotate: new package. (#5490)
2017-09-26 15:39:34 -06:00
r-annotationdbi
r-annotationdbi: new package (#5408)
2017-09-25 16:37:31 -06:00
r-ape
…
r-assertthat
r-assertthat: update version to 0.2.0 (#5435)
2017-09-23 14:58:53 +00:00
r-base64enc
…
r-bh
r-bh: update version. (#5442)
2017-09-23 15:01:35 +00:00
r-biobase
r-biobase: new package (#5398)
2017-09-20 19:00:56 -07:00
r-biocgenerics
r-biobase: new package (#5398)
2017-09-20 19:00:56 -07:00
r-biocinstaller
r-biocinstaller: added version 1.26.1 (#5406)
2017-09-21 08:42:32 +02:00
r-biomart
r-biomart: created new package (#5554)
2017-09-29 15:33:40 -06:00
r-biostrings
r-biostrings: created new package (#5498)
2017-09-28 18:11:28 -07:00
r-bit
r-bit: new package. (#5436)
2017-09-23 14:59:09 +00:00
r-bit64
r-bit64: new package. (#5437)
2017-09-25 16:38:18 -06:00
r-bitops
…
r-blob
r-blob: new package. (#5438)
2017-09-25 14:41:18 -06:00
r-boot
…
r-brew
…
r-c50
…
r-car
…
r-caret
…
r-catools
…
r-checkpoint
…
r-chron
…
r-class
…
r-cluster
…
r-coda
…
r-codetools
…
r-coin
…
r-colorspace
…
r-corpcor
…
r-corrplot
…
r-crayon
…
r-cubature
…
r-cubist
…
r-curl
…
r-data-table
…
r-dbi
r-dbi: updated to version 0.7 (#5537)
2017-09-28 22:14:56 -06:00
r-deldir
…
r-dendextend
…
r-deoptim
…
r-deoptimr
…
r-devtools
…
r-diagrammer
…
r-dichromat
…
r-digest
…
r-diptest
…
r-domc
…
r-doparallel
…
r-downloader
r-downloader: created new package (#5556)
2017-09-29 16:05:30 -06:00
r-dplyr
r-dplyr: Update version to 0.7.3 (#5531)
2017-09-28 13:09:30 -06:00
r-dt
…
r-dygraphs
…
r-e1071
…
r-ellipse
…
r-ergm
…
r-evaluate
…
r-expm
…
r-factoextra
…
r-factominer
…
r-filehash
…
r-flashclust
…
r-flexmix
…
r-foreach
…
r-foreign
…
r-formatr
…
r-formula
…
r-fpc
…
r-gbm
r-gbm: new package. (#5548)
2017-09-29 15:29:11 -06:00
r-gcrma
r-gcrma: created new package (#5500)
2017-09-28 18:11:02 -07:00
r-gdata
r-gdata: Update version to 2.18.0 (#5495)
2017-09-28 18:13:06 -07:00
r-genefilter
r-genefilter: New package. (#5467)
2017-09-25 16:57:17 -06:00
r-geosphere
…
r-ggmap
…
r-ggplot2
…
r-ggpubr
…
r-ggrepel
…
r-ggsci
…
r-ggvis
r-ggvis: Update version to 0.4.3 (#5532)
2017-09-28 13:13:47 -06:00
r-gistr
…
r-git2r
…
r-glmnet
r-glmnet: update version. (#5470)
2017-09-25 16:39:41 -06:00
r-gmodels
…
r-gmp
…
r-go-db
r-annaffy: new package. (#5414)
2017-09-28 12:49:31 -06:00
r-googlevis
…
r-gplots
r-gplots: Create New Package. (#5494)
2017-09-27 10:20:17 -06:00
r-gridbase
…
r-gridextra
…
r-gtable
…
r-gtools
…
r-hexbin
…
r-highr
…
r-htmltools
r-htmltools: Update version to 0.3.6 (#5528)
2017-09-28 11:31:16 -06:00
r-htmlwidgets
r-htmlwidgets: Update version to 0.8. (#5551)
2017-09-29 14:28:48 -07:00
r-httpuv
r-httpuv: Update version to 1.3.5 (#5527)
2017-09-28 11:30:57 -06:00
r-httr
…
r-hwriter
r-hwriter: new package. (#5549)
2017-09-29 15:29:26 -06:00
r-igraph
…
r-influencer
…
r-inline
…
r-ipred
…
r-iranges
r-annotationdbi: new package (#5408)
2017-09-25 16:37:31 -06:00
r-irdisplay
…
r-irkernel
…
r-irlba
…
r-iterators
…
r-jpeg
…
r-jsonlite
r-jsonlite: Update version to 1.5 (#5524)
2017-09-28 11:28:49 -06:00
r-kegg-db
r-annaffy: new package. (#5414)
2017-09-28 12:49:31 -06:00
r-kernlab
…
r-kernsmooth
…
r-kknn
…
r-knitr
…
r-labeling
…
r-laplacesdemon
…
r-lattice
r-glmnet: update version. (#5470)
2017-09-25 16:39:41 -06:00
r-lava
…
r-lazyeval
…
r-leaflet
…
r-leaps
…
r-learnbayes
…
r-limma
r-limma: added version 3.32.7 (#5558)
2017-09-29 16:29:41 -06:00
r-lme4
…
r-lmtest
…
r-locfit
r-locfit: created new package (#5572)
2017-10-02 15:54:26 -06:00
r-lpsolve
…
r-lubridate
…
r-magic
…
r-magrittr
…
r-mapproj
…
r-maps
…
r-maptools
…
r-markdown
…
r-mass
…
r-matrix
r-glmnet: update version. (#5470)
2017-09-25 16:39:41 -06:00
r-matrixmodels
…
r-mclust
…
r-mda
…
r-memoise
r-memoise: update version. (#5440)
2017-09-23 15:00:50 +00:00
r-mgcv
…
r-mime
…
r-minqa
…
r-mlbench
…
r-mlinterfaces
r-mlinterfaces: new package. (#5555)
2017-09-29 15:34:44 -06:00
r-modelmetrics
…
r-modeltools
…
r-mpm
r-mpm: new package. (#5416)
2017-09-21 13:36:51 -07:00
r-multcomp
…
r-multtest
r-multtest: new package. (#5469)
2017-09-25 16:45:21 -06:00
r-munsell
…
r-mvtnorm
…
r-ncdf4
…
r-network
…
r-networkd3
…
r-nlme
…
r-nloptr
…
r-nmf
…
r-nnet
…
r-np
…
r-numderiv
…
r-openssl
…
r-packrat
…
r-pacman
…
r-pamr
r-pamr: new package (#5514)
2017-09-27 21:48:04 -06:00
r-party
…
r-partykit
…
r-pbdzmq
…
r-pbkrtest
…
r-permute
…
r-pkgconfig
r-pkgconfig: new package. (#5441)
2017-09-25 16:38:45 -06:00
r-pkgmaker
…
r-plogr
r-plogr: new package. (#5443)
2017-09-25 16:42:03 -06:00
r-plotrix
…
r-pls
…
r-plyr
…
r-png
…
r-prabclus
…
r-praise
…
r-preprocesscore
r-preprocesscore: created new package (#5434)
2017-09-23 14:58:24 +00:00
r-prodlim
…
r-proto
…
r-pryr
…
r-quadprog
…
r-quantmod
…
r-quantreg
…
r-r6
r-r6: Update version to 2.2.2 (#5529)
2017-09-28 12:46:11 -06:00
r-randomforest
…
r-raster
…
r-rbokeh
…
r-rcolorbrewer
…
r-rcpp
r-rcpp: Update version to 0.12.13 (#5526)
2017-09-28 11:30:25 -06:00
r-rcppeigen
…
r-rcurl
r-rcurl: created new package (#5492)
2017-09-26 17:49:54 -06:00
r-rda
r-rda: new package. (#5523)
2017-09-28 11:28:29 -06:00
r-registry
…
r-repr
…
r-reshape2
…
r-rgl
…
r-rgooglemaps
…
r-rinside
…
r-rjava
…
r-rjson
…
r-rjsonio
…
r-rlang
r-rlang: created new package (#5535)
2017-09-28 16:07:13 -06:00
r-rmarkdown
…
r-rminer
…
r-rmpfr
…
r-rmpi
Modulefiles generated with a template engine (#3183)
2017-09-19 12:34:20 -07:00
r-rmysql
…
r-rngtools
…
r-robustbase
…
r-rocr
r-rocr: new package. (#5513)
2017-09-27 21:47:47 -06:00
r-rodbc
…
r-roxygen2
…
r-rpart
…
r-rpart-plot
…
r-rpostgresql
…
r-rsnns
…
r-rsqlite
r-rsqlite: Update version to 2.0. (#5444)
2017-09-23 15:02:27 +00:00
r-rstan
…
r-rstudioapi
…
r-rzmq
…
r-s4vectors
r-s4vectors: created new package (#5419)
2017-09-21 19:57:02 -06:00
r-sandwich
…
r-scales
…
r-scatterplot3d
…
r-segmented
…
r-seqinr
…
r-sfsmisc
r-sfsmisc: new package. (#5516)
2017-09-27 22:16:02 -06:00
r-shiny
r-shiny: update version to 1.0.5 (#5530)
2017-09-28 11:31:27 -06:00
r-simpleaffy
r-simpleaffy: created new package (#5510)
2017-09-27 21:46:53 -06:00
r-snow
…
r-sp
…
r-sparsem
…
r-spdep
…
r-stanheaders
…
r-statnet-common
…
r-stringi
…
r-stringr
…
r-strucchange
…
r-survey
…
r-survival
r-survival: updated to version 2.41-3 (#5409)
2017-09-20 18:42:16 -06:00
r-tarifx
…
r-testit
…
r-testthat
…
r-th-data
…
r-threejs
r-threejs: Correct url. (#5553)
2017-09-29 15:33:05 -06:00
r-tibble
r-tibble: update version. (#5439)
2017-09-23 15:00:02 +00:00
r-tidyr
…
r-trimcluster
…
r-trust
…
r-ttr
…
r-uuid
…
r-varselrf
r-varselrf: new package. (#5515)
2017-09-27 21:48:22 -06:00
r-vcd
…
r-vegan
…
r-viridis
…
r-viridislite
…
r-visnetwork
…
r-whisker
…
r-withr
…
r-xgboost
…
r-xlconnect
…
r-xlconnectjars
…
r-xlsx
…
r-xlsxjars
…
r-xml
r-xml: updated url and added version 3.98-1.9 (#5466)
2017-09-25 16:46:01 -06:00
r-xtable
…
r-xts
…
r-xvector
r-xvector: created new package (#5432)
2017-09-23 14:57:31 +00:00
r-yaml
r-yaml: Correct url (#5550)
2017-09-29 16:05:55 -06:00
r-yaqcaffy
r-yaqcaffy: created new package (#5538)
2017-09-28 18:02:58 -07:00
r-zlibbioc
r-zlibbioc: new package (#5399)
2017-09-21 08:43:33 +02:00
r-zoo
…
raft
…
raja
…
randfold
mirdeep: new package (#5302)
2017-09-20 15:48:20 -07:00
random123
…
randrproto
…
ravel
…
raxml
…
ray
…
rdp-classifier
…
readline
…
recordproto
…
redundans
…
relion
…
rempi
…
rename
…
rendercheck
…
renderproto
…
resourceproto
…
revbayes
…
rgb
…
rhash
…
rockstar
…
root
…
rose
…
rr
…
rsbench
…
rsem
…
rstart
…
rsync
…
rtags
…
rtax
…
ruby
…
rust
…
rust-bindgen
…
sabre
…
salmon
…
sambamba
[WIP]: Sambamba new package (#5304)
2017-09-20 18:23:49 -06:00
samrai
…
samtools
…
sas
…
satsuma2
…
savanna
…
saws
…
sbt
…
scala
…
scalasca
…
scons
…
scorec-core
…
scorep
Improve scorep package with different compilers and mpi providers (#5386)
2017-09-18 13:35:42 -07:00
scotch
…
scr
…
screen
…
scripts
…
scrnsaverproto
…
sctk
…
sdl2
…
sdl2-image
…
sed
…
seqprep
…
seqtk
…
serf
…
sessreg
…
setxkbmap
…
sga
…
shapeit
…
shared-mime-info
Missing perl dependencies (#5204)
2017-09-26 07:27:28 -06:00
shiny-server
…
shortstack
…
showfont
…
sickle
…
signalp
…
silo
Update pic/shared variants for hdf5, python, silo (#5423)
2017-09-21 18:14:31 -07:00
simplemoc
…
simul
…
simulationio
…
singularity
…
slepc
…
slurm
…
smalt
…
smc
…
smproxy
…
snakemake
…
snap
…
snap-berkeley
…
snappy
snappy: Build shared library by default (#5534)
2017-09-28 14:18:50 -06:00
snbone
…
sniffles
…
snptest
…
soap2
…
soapindel
…
soapsnp
…
somatic-sniper
…
sortmerna
…
sowing
…
sox
…
spades
…
spark
…
sparsehash
…
sparta
…
spdlog
…
spectrum-mpi
…
speex
…
sph2pipe
…
spherepack
…
spindle
…
spot
…
sqlite
…
squid
mirdeep: new package (#5302)
2017-09-20 15:48:20 -07:00
sra-toolkit
sra-toolkit: new package (#5588)
2017-10-03 14:41:41 -06:00
sspace-longread
…
sspace-standard
…
sst-dumpi
…
sst-macro
…
stacks
…
staden-io-lib
…
star
…
star-ccm-plus
…
stat
…
stc
…
stream
…
stress
…
stringtie
…
structure
…
sublime-text
…
subread
…
subversion
…
suite-sparse
…
sumaclust
…
sundials
…
superlu
…
superlu-dist
superlu-dist: fix has after 09/17/2017 update (#5457)
2017-09-23 12:50:02 +00:00
superlu-mt
…
swarm
…
swiftsim
…
swig
…
symengine
…
sympol
…
sz
SZ: add version 1.4.11 (#5517)
2017-09-27 16:30:43 -07:00
tabix
…
talloc
…
tar
…
targetp
targetp: new package (#5334)
2017-09-19 13:58:07 -07:00
task
…
taskd
…
tau
…
tcl
…
tcoffee
…
tcsh
Patches are hashed with specs, and can be associated with dependencies.
2017-09-30 02:06:59 -07:00
tealeaf
…
tetgen
…
tethex
…
texinfo
…
texlive
Use trusted/historic site for texlive installer (#5347)
2017-09-21 07:22:09 -06:00
the-platinum-searcher
…
the-silver-searcher
…
thrift
…
tig
…
tinyxml
…
tinyxml2
…
tk
…
tmalign
…
tmhmm
tmhmm: new package (#5335)
2017-09-20 14:45:13 -07:00
tmux
tmux: add version 2.5 (#5449)
2017-09-22 19:30:47 -07:00
tmuxinator
…
tophat
…
tppred
…
transabyss
…
transdecoder
…
transposome
…
transset
…
trapproto
…
tree
…
triangle
…
trilinos
Adding new Trilinos version and updating Nalu to utilize it. (#5552)
2017-09-29 15:31:15 -06:00
trimgalore
…
trimmomatic
…
turbine
…
turbomole
…
tut
Modulefiles generated with a template engine (#3183)
2017-09-19 12:34:20 -07:00
twm
…
tycho2
tycho2: initial commit (#5196)
2017-09-28 14:48:54 -07:00
uberftp
…
udunits2
…
uncrustify
…
unibilium
…
unison
…
units
…
unixodbc
…
usearch
…
util-linux
…
util-macros
…
uuid
…
valgrind
…
vampirtrace
…
varscan
…
vc
…
vcftools
…
vcsh
…
vdt
…
vecgeom
…
veclibfort
…
vegas2
…
velvet
…
videoproto
…
viennarna
'with_or_without' accepts bool variants
2017-09-11 16:20:49 -07:00
viewres
…
vim
…
virtualgl
…
visit
…
vizglow
…
vmatch
…
voropp
…
votca-csg
added votca-1.4.1 modules (#5276)
2017-09-11 13:28:53 -07:00
votca-ctp
…
votca-moo
…
votca-tools
added votca-1.4.1 modules (#5276)
2017-09-11 13:28:53 -07:00
votca-xtp
added votca-1.4.1 modules (#5276)
2017-09-11 13:28:53 -07:00
vpfft
…
vpic
…
vsearch
…
vtk
…
wannier90
…
wget
…
windowswmproto
…
wt
…
wx
…
wxpropgrid
…
x11perf
…
xapian-core
…
xauth
…
xbacklight
…
xbiff
…
xbitmaps
…
xcalc
…
xcb-demo
…
xcb-proto
…
xcb-util
…
xcb-util-cursor
…
xcb-util-errors
…
xcb-util-image
…
xcb-util-keysyms
…
xcb-util-renderutil
…
xcb-util-wm
…
xclipboard
…
xclock
…
xcmiscproto
…
xcmsdb
…
xcompmgr
…
xconsole
…
xcursor-themes
…
xcursorgen
…
xdbedizzy
…
xditview
…
xdm
…
xdpyinfo
…
xdriinfo
…
xedit
…
xerces-c
…
xev
…
xextproto
…
xeyes
…
xf86bigfontproto
…
xf86dga
…
xf86dgaproto
…
xf86driproto
…
xf86miscproto
…
xf86rushproto
…
xf86vidmodeproto
…
xfd
…
xfindproxy
…
xfontsel
…
xfs
…
xfsinfo
…
xfwp
…
xgamma
…
xgc
…
xhost
…
xineramaproto
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