zhangyiss/spack
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0
Fork 0
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Files
3f04ebf6007fd55babe7b89bce77016d728ebdf2
spack/var/spack/repos/builtin/packages
History
Geoffrey Lentner 3f04ebf600 hadoop package: fix url and checksum (#9263)
2018-09-18 18:49:52 -07:00
..
abinit
…
abyss
…
accfft
…
ack
…
activeharmony
…
adept-utils
…
adios
…
adios2
…
adlbx
…
adol-c
…
aegean
…
aida
…
albany
…
albert
…
alglib
…
allinea-forge
…
allinea-reports
…
allpaths-lg
…
alquimia
…
alsa-lib
…
amg
AMG: update version (#9228)
2018-09-12 14:11:05 -06:00
amg2013
…
amp
…
ampliconnoise
…
amrex
…
amrvis
Updating amrvis to allow building with profiling support. (#9204)
2018-09-14 17:16:35 -07:00
andi
…
angsd
…
ant
…
antlr
…
ants
…
ape
…
aperture-photometry
…
apex
…
apple-libunwind
apple-libunwind: update path to library (#9265)
2018-09-18 18:48:53 -07:00
applewmproto
…
appres
…
apr
…
apr-util
…
aragorn
…
archer
…
argobots
argobots: new package starting at 1.0b1 (#9238)
2018-09-14 15:48:40 -07:00
argp-standalone
…
argtable
…
arlecore
…
armadillo
…
arpack-ng
…
arrow
…
ascent
…
asciidoc
…
aspa
…
aspcud
…
aspect
…
aspell
…
aspell6-de
…
aspell6-en
…
aspell6-es
…
aspera-cli
…
assimp
assimp: fix compile issues with intel compilers on knl/linux [a depen… (#9191)
2018-09-08 16:18:37 -05:00
astra
…
astral
…
astyle
…
at-spi2-atk
…
at-spi2-core
…
atk
…
atlas
…
atom-dft
…
atompaw
…
atop
…
augustus
…
autoconf
…
autodock-vina
…
autogen
…
automaded
…
automake
…
axel
…
axl
…
bamdst
…
bamtools
…
bamutil
…
barrnap
…
bash
…
bash-completion
…
bats
…
bazel
…
bbcp
…
bbmap
…
bc
…
bcftools
…
bcl2fastq2
…
bdftopcf
…
bdw-gc
…
bear
…
beast1
…
beast2
…
bedops
…
bedtools2
…
beforelight
…
benchmark
…
berkeley-db
…
bertini
…
bib2xhtml
…
bigreqsproto
…
binutils
…
bioawk
…
biopieces
…
bismark
…
bison
…
bitmap
…
blasr
…
blasr-libcpp
…
blast-plus
…
blat
…
blaze
…
blis
…
bliss
…
blitz
…
bmake
…
bml
…
bohrium
…
bolt
bolt: new package starting at 1.0b1 (#9253)
2018-09-14 15:49:36 -07:00
bookleaf-cpp
…
boost
…
boostmplcartesianproduct
…
bowtie
…
bowtie2
…
boxlib
…
bpp-core
…
bpp-phyl
…
bpp-seq
…
bpp-suite
…
bracken
…
braker
…
branson
…
breakdancer
breakdancer: fix several issues (#9251)
2018-09-14 20:11:34 -07:00
breseq
…
brigand
…
bsseeker2
…
bucky
…
bumpversion
…
busco
…
butter
…
bwa
…
bwtool
…
byobu
…
bzip2
…
c-blosc
…
c-lime
…
caffe
…
cairo
…
cairomm
…
caliper
…
callpath
…
camellia
…
candle-benchmarks
Packages/candle benchmarks (#9266)
2018-09-18 13:02:03 -06:00
cantera
…
canu
…
cap3
…
cares
…
cask
…
casper
…
catalyst
…
catch
…
cbench
…
cblas
…
cbtf
…
cbtf-argonavis
…
cbtf-argonavis-gui
…
cbtf-krell
…
cbtf-lanl
…
ccache
…
cctools
…
cdbfasta
…
cdd
…
cddlib
…
cdhit
…
cdo
…
ceed
…
cereal
…
ceres-solver
…
cfitsio
…
cgal
…
cgm
…
cgns
…
channelflow
…
charliecloud
…
charmpp
Charmpp: rename charm to charmpp according to ++ conventions (#9216)
2018-09-14 17:01:07 -07:00
chatterbug
…
check
…
chlorop
…
chombo
…
cistem
…
cityhash
…
clamr
…
clapack
…
cleaveland4
…
cleverleaf
…
clfft
…
clhep
…
clingo
…
cloc
…
cloog
…
cloverleaf
…
cloverleaf3d
…
clustalo
…
clustalw
…
cmake
cmake: add version 3.12.2 (#9248)
2018-09-14 09:36:39 -07:00
cmocka
…
cmor
…
cnmem
…
cnpy
…
cntk
…
cntk1bitsgd
…
codar-cheetah
…
codes
…
coevp
…
cohmm
…
coinhsl
coinhsl: add @2015.06.23, explain versions, SHA256 (#9258)
2018-09-16 15:03:26 -05:00
colm
…
colordiff
…
comd
ecp-proxy-apps: update dependencies for release 1.0 and 1.1 (#9217)
2018-09-11 15:10:49 -06:00
commons-lang
…
commons-lang3
…
commons-logging
…
compiz
…
compositeproto
…
conduit
…
constype
…
converge
…
coreutils
…
corset
…
cosmomc
…
cosp2
…
cp2k
…
cppad
…
cppcheck
…
cppgsl
…
cpprestsdk
…
cppunit
…
cppzmq
…
cpu-features
…
cpuinfo
…
cram
…
cryptopp
…
cscope
…
csdp
…
ctffind
…
cub
…
cube
…
cubelib
…
cubew
…
cuda
…
cuda-memtest
…
cudnn
…
cufflinks
…
cups
…
curl
…
cvs
…
czmq
…
dakota
…
daligner
…
damageproto
…
damselfly
…
darshan-runtime
…
darshan-util
…
dash
…
datamash
…
dataspaces
…
davix
…
dbus
…
dealii
…
dealii-parameter-gui
…
deconseq-standalone
…
dejagnu
…
delly2
…
denovogear
…
dia
…
dialign-tx
…
diamond
…
diffsplice
…
direnv
…
discovar
…
discovardenovo
…
dislin
…
dlpack
…
dmd
…
dmlc-core
…
dmtcp
…
dmxproto
…
docbook-xml
…
docbook-xsl
…
dos2unix
…
dotnet-core-sdk
changed to new install_tree formalism (#9181)
2018-09-15 09:40:50 -05:00
double-conversion
…
doxygen
…
dri2proto
…
dri3proto
…
dsdp
…
dsrc
…
dtcmp
…
dyninst
…
ea-utils
…
easybuild
…
ebms
…
eccodes
…
eclipse-gcj-parser
…
ecp-proxy-apps
Packages/candle benchmarks (#9266)
2018-09-18 13:02:03 -06:00
ed
…
editres
…
eigen
add eigen@3.3.5 (#9212)
2018-09-14 17:14:46 -07:00
elasticsearch
Added Kibana package, added Elasticsearch to 6.4.0 (#9239)
2018-09-14 10:50:20 -07:00
elemental
…
elfutils
…
elk
…
elpa
…
emacs
…
emboss
…
encodings
…
environment-modules
…
eospac
…
er
…
es
…
esmf
…
essl
…
ethminer
…
etsf-io
…
everytrace
…
everytrace-example
…
evieext
…
exabayes
…
examinimd
…
exampm
…
exasp2
…
exmcutils
…
exodusii
…
exonerate
…
expat
…
expect
…
express
…
extrae
…
exuberant-ctags
…
f90cache
…
fabtests
…
falcon
…
farmhash
…
fast-gbs
…
fast-global-file-status
…
fasta
…
fastjar
…
fastmath
…
fastme
…
fastphase
…
fastq-screen
…
fastqc
…
fastqvalidator
…
fasttree
…
fastx-toolkit
…
fenics
…
fermi
…
fermikit
…
fermisciencetools
…
ferret
…
ffmpeg
…
fftw
…
fimpute
…
findutils
…
fio
…
fish
…
fixesproto
…
flac
…
flang
…
flann
patch flann // gcc // cmake@3.11+ (#9214)
2018-09-14 17:01:58 -07:00
flash
…
flatbuffers
…
flecsale
…
flecsi
…
flex
…
flint
…
flit
…
fltk
…
flux-core
…
flux-sched
…
fluxbox
…
fmt
…
foam-extend
…
folly
…
font-adobe-75dpi
…
font-adobe-100dpi
…
font-adobe-utopia-75dpi
…
font-adobe-utopia-100dpi
…
font-adobe-utopia-type1
…
font-alias
…
font-arabic-misc
…
font-bh-75dpi
…
font-bh-100dpi
…
font-bh-lucidatypewriter-75dpi
…
font-bh-lucidatypewriter-100dpi
…
font-bh-ttf
…
font-bh-type1
…
font-bitstream-75dpi
…
font-bitstream-100dpi
…
font-bitstream-speedo
…
font-bitstream-type1
…
font-cronyx-cyrillic
…
font-cursor-misc
…
font-daewoo-misc
…
font-dec-misc
…
font-ibm-type1
…
font-isas-misc
…
font-jis-misc
…
font-micro-misc
…
font-misc-cyrillic
…
font-misc-ethiopic
…
font-misc-meltho
…
font-misc-misc
…
font-mutt-misc
…
font-schumacher-misc
…
font-screen-cyrillic
…
font-sony-misc
…
font-sun-misc
…
font-util
…
font-winitzki-cyrillic
…
font-xfree86-type1
…
fontcacheproto
…
fontconfig
…
fontsproto
…
fonttosfnt
…
fp16
…
fpc
…
fr-hit
…
freebayes
…
freeglut
…
freetype
…
fseq
…
fsl
…
fslsfonts
…
fstobdf
…
ftgl
…
funhpc
…
fyba
…
gapbs
…
gapcloser
…
gapfiller
…
gasnet
…
gatk
gatk: new version (#9202)
2018-09-14 13:55:52 -07:00
gaussian
…
gawk
…
gblocks
…
gcc
…
gccmakedep
…
gccxml
…
gconf
…
gcta
…
gdal
…
gdb
gdb: add lzma support by default (#9247)
2018-09-15 09:06:16 -05:00
gdbm
…
gdk-pixbuf
…
gdl
…
geant4
…
gearshifft
…
gemmlowp
…
genemark-et
…
genomefinisher
…
genometools
…
geopm
…
geos
…
gettext
…
gflags
…
ghost
…
ghostscript
…
ghostscript-fonts
…
giflib
…
git
…
git-imerge
…
git-lfs
…
gl2ps
…
glew
…
glfmultiples
…
glib
…
glibmm
…
glimmer
…
glm
…
global
…
globalarrays
…
globus-toolkit
…
glog
…
gloo
…
glpk
…
glproto
…
glvis
…
gmake
…
gmap-gsnap
…
gmime
…
gmodel
…
gmp
…
gmsh
…
gnat
…
gnu-prolog
…
gnupg
…
gnuplot
…
gnutls
…
go
…
go-bootstrap
…
gobject-introspection
…
googletest
…
gotcha
…
gource
…
gperf
…
gperftools
…
gplates
…
grackle
…
gradle
…
grandr
…
graph500
…
graphicsmagick
…
graphlib
…
graphmap
…
graphviz
…
grass
…
grib-api
…
grnboost
…
groff
…
gromacs
…
gsl
…
gslib
…
gtkmm
…
gtkorvo-atl
…
gtkorvo-cercs-env
…
gtkorvo-dill
…
gtkorvo-enet
…
gtkplus
…
gts
…
guidance
…
guile
…
gurobi
…
h5hut
…
h5part
…
h5utils
…
h5z-zfp
…
hacckernels
…
hadoop
hadoop package: fix url and checksum (#9263)
2018-09-18 18:49:52 -07:00
halc
…
hapcut2
…
hapdip
…
haploview
…
harfbuzz
…
harminv
…
hdf
…
hdf5
…
hdf5-blosc
…
help2man
…
hepmc
…
heppdt
…
hic-pro
…
highfive
…
highwayhash
…
hiop
…
hisat2
…
hisea
…
hmmer
…
hoomd-blue
…
hpccg
…
hpctoolkit
…
hpctoolkit-externals
…
hpgmg
…
hpl
…
hpx
…
hpx5
…
hsakmt
…
hstr
…
htop
…
htslib
…
httpie
…
hub
…
hunspell
…
hwloc
Hwloc add update 2.0.2 (#9244)
2018-09-14 10:48:38 -07:00
hybpiper
…
hydra
…
hydrogen
…
hypre
hypre: patch +shared@2.13.0: on darwin (#9220)
2018-09-14 17:14:30 -07:00
i3
…
ibmisc
…
iceauth
…
icedtea
…
icet
…
ico
…
icu4c
…
id3lib
…
idba
…
igraph
…
igv
…
igvtools
…
ilmbase
…
image-magick
…
imake
…
imp
…
impute2
…
infernal
…
inputproto
…
intel
…
intel-daal
…
intel-gpu-tools
…
intel-ipp
…
intel-mkl
…
intel-mkl-dnn
…
intel-mpi
…
intel-parallel-studio
…
intel-tbb
…
intel-xed
…
intltool
…
ior
…
iozone
…
iperf2
…
iperf3
…
ipopt
ipopt: add debug variant (#9223)
2018-09-14 15:53:25 -07:00
isaac
…
isaac-server
…
isl
…
itstool
…
itsx
…
jackcess
…
jags
…
jansson
…
jasper
…
jbigkit
…
jchronoss
…
jdk
jdk: added 10.0.2_13 (#9203)
2018-09-14 17:17:32 -07:00
jellyfish
…
jemalloc
…
jmol
…
jq
…
json-c
…
json-cwx
…
json-glib
…
jsoncpp
…
judy
…
julia
…
k8
…
kahip
…
kaiju
…
kaks-calculator
…
kaldi
…
kallisto
…
kbproto
…
kdiff3
…
kealib
…
kentutils
…
kibana
Added Kibana package, added Elasticsearch to 6.4.0 (#9239)
2018-09-14 10:50:20 -07:00
kim-api
…
kmergenie
…
kokkos
…
kraken
…
krb5
…
krims
…
kripke
…
kvasir-mpl
…
kvtree
…
laghos
…
lammps
…
last
…
latte
…
launchmon
…
lazyten
…
lbann
…
lbxproxy
…
lcals
…
lcms
…
ldc
…
ldc-bootstrap
…
legion
…
leveldb
…
lftp
…
libaec
…
libaio
…
libapplewm
…
libarchive
…
libassuan
…
libatomic-ops
…
libbeagle
…
libbeato
…
libbsd
…
libbson
…
libcanberra
…
libcap
…
libceed
…
libcerf
…
libcheck
…
libcint
…
libcircle
…
libconfig
…
libcroco
…
libctl
…
libdivsufsort
…
libdmx
…
libdrm
…
libdwarf
…
libedit
…
libelf
…
libemos
…
libepoxy
…
libev
…
libevent
…
libevpath
…
libfabric
…
libffi
Build Python 3.7 with external libffi. (#9245)
2018-09-14 17:07:13 -07:00
libffs
…
libfontenc
…
libfs
…
libgcrypt
…
libgd
…
libgeotiff
…
libgit2
…
libgpg-error
…
libgpuarray
…
libgridxc
…
libgtextutils
…
libharu
…
libhio
libhio: add patch for 1.4.1.2 release (#9270)
2018-09-18 17:26:34 -06:00
libiberty
…
libice
…
libiconv
…
libint
…
libjpeg
…
libjpeg-turbo
…
libksba
…
liblbxutil
…
liblockfile
…
libmatheval
…
libmaxminddb
…
libmesh
libMesh: New variant and updated recent versions. (#9186)
2018-09-07 21:13:34 -07:00
libmng
…
libmongoc
…
libmonitor
…
libnbc
…
libnl
…
libnova
…
libogg
…
liboldx
…
libpcap
…
libpciaccess
…
libpfm4
…
libpipeline
…
libpng
…
libpsl
…
libpthread-stubs
…
libquo
…
librom
…
libshm
…
libsigcpp
…
libsigsegv
…
libsm
…
libsodium
…
libspatialindex
…
libsplash
…
libssh
…
libssh2
…
libsvm
…
libszip
…
libtermkey
…
libtiff
…
libtool
…
libunistring
…
libunwind
…
libuuid
…
libuv
…
libvorbis
…
libvterm
…
libwebsockets
…
libwindowswm
…
libx11
…
libxau
…
libxaw
…
libxaw3d
…
libxc
…
libxcb
…
libxcomposite
…
libxcursor
…
libxdamage
…
libxdmcp
…
libxevie
…
libxext
…
libxfixes
…
libxfont
…
libxfont2
…
libxfontcache
…
libxft
…
libxi
…
libxinerama
…
libxkbcommon
…
libxkbfile
…
libxkbui
…
libxml2
…
libxmu
…
libxp
…
libxpm
…
libxpresent
…
libxprintapputil
…
libxprintutil
…
libxrandr
…
libxrender
…
libxres
…
libxscrnsaver
…
libxshmfence
…
libxslt
…
libxsmm
…
libxstream
…
libxt
…
libxtrap
…
libxtst
…
libxv
…
libxvmc
…
libxxf86dga
…
libxxf86misc
…
libxxf86vm
…
libyogrt
…
libzip
…
likwid
…
linkphase3
…
linux-headers
…
listres
…
llvm
…
llvm-openmp-ompt
…
lmdb
…
lmod
…
lndir
…
log4cplus
…
log4cxx
…
loki
…
lordec
…
lrslib
…
lrzip
…
lsof
…
ltrace
…
lua
…
lua-bitlib
…
lua-jit
…
lua-lpeg
…
lua-luafilesystem
…
lua-luaposix
…
lua-mpack
…
luit
…
lulesh
…
lumpy-sv
…
lwgrp
…
lwm2
…
lz4
…
lzma
…
lzo
…
m4
…
macsio
…
mad-numdiff
…
mafft
…
magics
…
magma
…
makedepend
…
mallocmc
…
man-db
…
manta
…
maq
…
mariadb
…
masa
…
masurca
…
matio
…
matlab
…
maven
…
maverick
…
mawk
…
mbedtls
…
mc
…
mcl
…
mdtest
…
med
…
meep
…
mefit
…
megahit
…
memaxes
…
meme
…
memkind
…
meraculous
…
mercurial
…
mesa
…
mesa-glu
…
meshkit
…
meson
…
mesquite
…
metabat
…
metaphysicl
…
metasv
metasv: add required dependencies (#9254)
2018-09-14 15:49:11 -07:00
metis
…
mfem
…
microbiomeutil
…
minced
…
mindthegap
…
miniaero
…
miniamr
miniamr: added v1.4.1 (#9225)
2018-09-14 16:56:59 -07:00
miniasm
…
miniconda2
…
miniconda3
…
minife
…
minighost
…
minigmg
…
minimap2
…
minimd
…
miniqmc
miniQMC: add newer releases and ecp-proxy-app tag (#9233)
2018-09-14 15:54:21 -07:00
minisign
…
minismac2d
…
minitri
…
minixyce
…
minuit
…
mira
…
mirdeep2
…
mitofates
…
mitos
…
mkfontdir
…
mkfontscale
…
mlhka
…
moab
…
modern-wheel
…
mofem-cephas
…
mofem-fracture-module
…
mofem-minimal-surface-equation
…
mofem-users-modules
…
molcas
…
mono
…
mosh
…
mothur
…
motif
…
motioncor2
motioncor2 - added version 1.1.0 and removed old, unlisted versions (#9229)
2018-09-14 13:57:22 -07:00
mount-point-attributes
…
mozjs
…
mpark-variant
…
mpc
…
mpe2
…
mpest
…
mpfr
…
mpibash
…
mpiblast
…
mpich
…
mpifileutils
…
mpilander
…
mpileaks
…
mpip
…
mpir
…
mpix-launch-swift
…
mrbayes
…
mrnet
…
mrtrix3
…
mscgen
…
msgpack-c
…
mshadow
…
multitail
…
multiverso
…
mummer
…
mumps
…
munge
…
muparser
…
muscle
…
muse
…
muster
…
mvapich2
…
mxml
…
mxnet
mxnet: added 1.3.0 (#9236)
2018-09-14 11:01:30 -07:00
nag
…
nalu
…
nalu-wind
…
namd
Charmpp: rename charm to charmpp according to ++ conventions (#9216)
2018-09-14 17:01:07 -07:00
nano
…
nanoflann
…
nanopb
…
nasm
…
nauty
…
ncbi-magicblast
…
ncbi-rmblastn
…
ncbi-toolkit
…
nccl
…
nccmp
…
ncdu
…
ncftp
…
ncl
…
nco
…
ncurses
…
ncview
…
ndiff
…
nek5000
…
nekbone
…
nekcem
…
nektar
…
neovim
…
nest
…
netcdf
…
netcdf-cxx
…
netcdf-cxx4
…
netcdf-fortran
…
netgauge
…
netgen
…
netlib-lapack
…
netlib-scalapack
…
netlib-xblas
…
nettle
…
neuron
…
nextflow
…
nfft
…
nghttp2
…
nginx
…
ngmlr
…
ninja
…
ninja-fortran
…
nlohmann-json
…
nlopt
…
nmap
…
nnvm
…
node-js
…
notmuch
…
npb
…
npm
…
npth
…
nspr
…
numactl
…
numdiff
…
nut
…
nwchem
…
ocaml
…
occa
…
oce
…
oclint
…
oclock
…
octave
…
octave-optim
…
octave-splines
…
octave-struct
…
octopus
…
of-adios-write
…
of-precice
…
omega-h
…
ompss
…
ompt-openmp
…
oniguruma
…
ont-albacore
…
opa-psm2
…
opam
…
opari2
…
openbabel
…
openblas
…
opencoarrays
OpenCoarrays: update v2.2.0 (#9215)
2018-09-14 16:59:19 -07:00
opencv
add opencv@3.4.3 (#9213)
2018-09-14 17:05:05 -07:00
openexr
…
openfast
…
openfoam-com
…
openfoam-org
…
openfst
…
opengl
…
openglu
…
openjpeg
…
openmc
…
openmpi
…
opennurbs
…
openpmd-api
…
openscenegraph
…
openslide
…
openspeedshop
…
openspeedshop-utils
…
openssh
…
openssl
Build Python 3.7 with external libffi. (#9245)
2018-09-14 17:07:13 -07:00
opium
…
optional-lite
…
opus
…
orfm
…
orthofinder
…
orthomcl
…
osu-micro-benchmarks
…
otf
…
otf2
…
p4est
…
p7zip
…
pacbio-daligner
…
pacbio-damasker
…
pacbio-dazz-db
…
pacbio-dextractor
…
pagit
…
pagmo
…
paml
…
panda
…
pandaseq
…
pango
…
pangomm
…
papi
…
papyrus
…
paradiseo
…
parallel
…
parallel-netcdf
…
paraver
…
paraview
…
parmetis
…
parmgridgen
…
parquet
…
parsimonator
…
parsplice
…
partitionfinder
…
patch
…
patchelf
…
pathfinder
…
pax-utils
…
pbbam
…
pbmpi
…
pcma
…
pcre
…
pcre2
…
pdf2svg
…
pdftk
…
pdsh
…
pdt
…
pegtl
…
pennant
…
percept
…
perl
…
perl-algorithm-diff
…
perl-app-cmd
…
perl-array-utils
…
perl-b-hooks-endofscope
…
perl-bio-perl
…
perl-bit-vector
…
perl-cairo
…
perl-capture-tiny
…
perl-carp-clan
…
perl-class-data-inheritable
…
perl-class-inspector
…
perl-class-load
…
perl-class-load-xs
…
perl-compress-raw-bzip2
…
perl-compress-raw-zlib
…
perl-contextual-return
…
perl-cpan-meta-check
…
perl-data-optlist
…
perl-data-stag
…
perl-dbd-mysql
…
perl-dbfile
…
perl-dbi
…
perl-devel-cycle
…
perl-devel-globaldestruction
…
perl-devel-overloadinfo
…
perl-devel-stacktrace
…
perl-digest-md5
…
perl-dist-checkconflicts
…
perl-encode-locale
…
perl-eval-closure
…
perl-exception-class
…
perl-exporter-tiny
…
perl-extutils-depends
…
perl-extutils-makemaker
…
perl-extutils-pkgconfig
…
perl-file-copy-recursive
…
perl-file-listing
…
perl-file-pushd
…
perl-file-sharedir-install
…
perl-file-slurp-tiny
…
perl-file-slurper
…
perl-file-which
…
perl-font-ttf
…
perl-gd
…
perl-gd-graph
…
perl-gd-text
…
perl-gdgraph-histogram
perl-gdgraph-histogram: new package (#9250)
2018-09-14 15:50:18 -07:00
perl-graph
…
perl-graph-readwrite
…
perl-html-parser
…
perl-html-tagset
…
perl-http-cookies
…
perl-http-daemon
…
perl-http-date
…
perl-http-message
…
perl-http-negotiate
…
perl-inline
…
perl-inline-c
…
perl-intervaltree
…
perl-io-compress
…
perl-io-html
…
perl-io-sessiondata
…
perl-io-socket-ssl
…
perl-io-string
…
perl-json
…
perl-libwww-perl
…
perl-list-moreutils
…
perl-log-log4perl
…
perl-lwp
…
perl-lwp-mediatypes
…
perl-lwp-protocol-https
…
perl-math-cdf
…
perl-math-cephes
…
perl-math-matrixreal
…
perl-module-build
…
perl-module-implementation
…
perl-module-runtime
…
perl-module-runtime-conflicts
…
perl-moose
…
perl-mozilla-ca
…
perl-mro-compat
…
perl-namespace-clean
…
perl-net-http
…
perl-net-scp-expect
…
perl-net-ssleay
…
perl-package-deprecationmanager
…
perl-package-stash
…
perl-package-stash-xs
…
perl-padwalker
…
perl-parallel-forkmanager
…
perl-params-util
…
perl-parse-recdescent
…
perl-pdf-api2
…
perl-pegex
…
perl-perl6-slurp
…
perl-perlio-gzip
…
perl-perlio-utf8-strict
…
perl-soap-lite
…
perl-star-fusion
…
perl-statistics-descriptive
…
perl-statistics-pca
…
perl-sub-exporter
…
perl-sub-exporter-progressive
…
perl-sub-identify
…
perl-sub-install
…
perl-sub-name
…
perl-sub-uplevel
…
perl-svg
…
perl-swissknife
…
perl-task-weaken
…
perl-term-readkey
…
perl-test-cleannamespaces
…
perl-test-deep
…
perl-test-differences
…
perl-test-exception
…
perl-test-fatal
…
perl-test-memory-cycle
…
perl-test-most
…
perl-test-needs
…
perl-test-requires
…
perl-test-requiresinternet
…
perl-test-warn
…
perl-test-warnings
…
perl-text-csv
…
perl-text-diff
…
perl-text-simpletable
…
perl-text-soundex
…
perl-text-unidecode
…
perl-time-hires
…
perl-time-piece
…
perl-try-tiny
…
perl-uri
…
perl-uri-escape
…
perl-version
…
perl-want
…
perl-www-robotrules
…
perl-xml-libxml
…
perl-xml-parser
…
perl-xml-parser-lite
…
perl-xml-simple
…
perl-yaml-libyaml
…
petsc
petsc: fix compilation with intel (#9198)
2018-09-12 11:18:41 -07:00
pexsi
…
pfft
…
pflotran
…
pfunit
…
pgdspider
…
pgi
…
pgmath
…
phantompeakqualtools
…
phast
…
phasta
…
phist
…
phylip
…
picard
…
pidx
…
pigz
…
pilon
…
pindel
…
piranha
…
pism
…
pixman
…
pkg-config
…
pkgconf
…
planck-likelihood
…
plasma
…
platypus
…
plink
…
plplot
…
plumed
plumed: updating plumed to latest version (#9227)
2018-09-14 17:13:22 -07:00
pmgr-collective
…
pmix
…
pnfft
…
pngwriter
…
pnmpi
…
poamsa
…
pocl
…
polymake
…
poppler
…
poppler-data
…
porta
…
portage
…
portcullis
portcullis: new package starting at 1.1.2 (#9218)
2018-09-14 15:55:58 -07:00
postgresql
…
ppl
…
prank
…
precice
…
presentproto
…
preseq
…
price
…
primer3
…
prinseq-lite
…
printproto
…
prng
…
probconsrna
…
prodigal
…
proj
…
protobuf
…
proxymngr
…
pruners-ninja
…
ps-lite
…
psi4
…
pslib
…
psm
…
psmc
…
pstreams
…
pugixml
…
pumi
…
pv
…
pvm
…
pxz
…
py-3to2
…
py-4suite-xml
…
py-abipy
…
py-adios
…
py-affine
…
py-alabaster
…
py-apache-libcloud
…
py-apipkg
…
py-appdirs
…
py-appnope
…
py-apscheduler
…
py-argcomplete
…
py-argparse
…
py-ase
…
py-asn1crypto
…
py-astroid
…
py-astropy
…
py-atomicwrites
…
py-attrs
…
py-autopep8
…
py-avro
…
py-avro-json-serializer
…
py-babel
…
py-backcall
…
py-backports-abc
…
py-backports-functools-lru-cache
…
py-backports-shutil-get-terminal-size
…
py-backports-ssl-match-hostname
…
py-basemap
…
py-bcbio-gff
…
py-beautifulsoup4
…
py-binwalk
…
py-biom-format
…
py-biopython
…
py-bitarray
…
py-bitstring
…
py-bleach
…
py-blessings
…
py-bokeh
…
py-boltons
…
py-bottleneck
…
py-breakseq2
…
py-brian
…
py-brian2
…
py-bsddb3
…
py-bx-python
…
py-cartopy
…
py-cclib
…
py-cdat-lite
…
py-cdo
…
py-certifi
…
py-cffi
…
py-chardet
…
py-checkm-genome
…
py-cheetah
…
py-click
…
py-cligj
…
py-cloudpickle
…
py-cnvkit
…
py-cogent
…
py-colorama
…
py-colormath
py-colormath: new version, requires newer networkx (#9237)
2018-09-14 10:35:45 -07:00
py-configparser
…
py-counter
…
py-coverage
…
py-cpuinfo
…
py-crispresso
…
py-crossmap
…
py-cryptography
…
py-csvkit
…
py-current
…
py-cutadapt
…
py-cvxopt
…
py-cycler
…
py-cython
…
py-dask
…
py-dateutil
…
py-dbf
…
py-decorator
py-decorator: new version (#9240)
2018-09-14 15:51:43 -07:00
py-deeptools
…
py-dendropy
…
py-dill
…
py-discover
…
py-dlcpar
…
py-docopt
…
py-docutils
…
py-doxypy
…
py-doxypypy
…
py-dryscrape
…
py-dxchange
…
py-dxfile
…
py-easybuild-easyblocks
…
py-easybuild-easyconfigs
…
py-easybuild-framework
…
py-edffile
…
py-editdistance
…
py-elasticsearch
…
py-elephant
…
py-emcee
…
py-entrypoints
…
py-enum34
…
py-epydoc
…
py-espresso
py-espresso: apply patch to v4.0.0 only (#9196)
2018-09-13 10:00:21 +00:00
py-espressopp
…
py-et-xmlfile
…
py-eventlet
…
py-execnet
…
py-fastaindex
…
py-fasteners
…
py-faststructure
…
py-filelock
…
py-fiscalyear
…
py-flake8
…
py-flake8-polyfill
…
py-flask
…
py-flask-compress
…
py-flask-socketio
…
py-flexx
…
py-fn
…
py-fparser
…
py-funcsigs
…
py-functools32
…
py-future
…
py-futures
…
py-gdbgui
…
py-genders
…
py-genshi
…
py-gevent
…
py-git2
…
py-git-review
…
py-gnuplot
…
py-goatools
…
py-gpaw
…
py-greenlet
…
py-griddataformats
…
py-guidata
…
py-guiqwt
…
py-h5py
py-h5py: add version 2.8.0 (#9231)
2018-09-14 15:56:44 -07:00
py-html2text
…
py-html5lib
…
py-htseq
…
py-httpbin
…
py-hypothesis
…
py-idna
…
py-igraph
…
py-illumina-utils
…
py-imageio
…
py-imagesize
…
py-iminuit
…
py-importlib
…
py-ipaddress
…
py-ipdb
…
py-ipykernel
…
py-ipython
…
py-ipython-genutils
…
py-ipywidgets
…
py-isort
…
py-itsdangerous
…
py-jdcal
…
py-jedi
…
py-jinja2
…
py-joblib
…
py-jpype
…
py-jsonschema
…
py-junit-xml
…
py-jupyter-client
…
py-jupyter-console
…
py-jupyter-core
…
py-jupyter-notebook
…
py-keras
…
py-kiwisolver
…
py-lark-parser
…
py-latexcodec
…
py-lazy
…
py-lazy-object-proxy
…
py-lazy-property
…
py-lazyarray
…
py-libconf
…
py-libensemble
Update py-libensemble package to v0.3.0 (#9210)
2018-09-14 17:15:31 -07:00
py-line-profiler
…
py-linecache2
…
py-lit
…
py-llvmlite
…
py-lmfit
…
py-localcider
…
py-locket
…
py-lockfile
…
py-logilab-common
…
py-lrudict
…
py-lxml
…
py-lzstring
…
py-macholib
…
py-machotools
…
py-macs2
…
py-maestrowf
…
py-mako
…
py-mappy
…
py-markdown
py-markdown: fix url and hashes (#9235)
2018-09-14 15:51:20 -07:00
py-markupsafe
…
py-matplotlib
…
py-mccabe
…
py-mdanalysis
…
py-meep
…
py-memory-profiler
…
py-methylcode
…
py-mg-rast-tools
…
py-misopy
…
py-mistune
…
py-mock
…
py-moltemplate
…
py-mongo
…
py-monotonic
…
py-monty
…
py-more-itertools
…
py-mpi4py
…
py-mpmath
…
py-multiprocess
…
py-multiqc
py-multiqc: needs newer py-spectra (#9226)
2018-09-14 15:52:29 -07:00
py-mx
…
py-mxnet
…
py-myhdl
…
py-mysqldb1
…
py-natsort
…
py-nbconvert
…
py-nbformat
…
py-neo
…
py-nestle
…
py-netcdf4
…
py-netifaces
…
py-networkx
py-networkx: new version (#9241)
2018-09-14 15:52:02 -07:00
py-nose
…
py-nosexcover
…
py-numba
…
py-numexpr
…
py-numexpr3
…
py-numpy
…
py-numpydoc
…
py-olefile
…
py-ont-fast5-api
…
py-openpmd-validator
…
py-openpyxl
…
py-openslide-python
…
py-opentuner
…
py-ordereddict
…
py-oset
…
py-owslib
…
py-packaging
…
py-palettable
…
py-pandas
…
py-paramiko
…
py-partd
…
py-pathlib2
…
py-pathos
…
py-pathspec
…
py-patsy
…
py-pbr
…
py-pep8-naming
…
py-perf
…
py-performance
…
py-periodictable
…
py-petsc4py
…
py-pexpect
…
py-phonopy
…
py-pickleshare
…
py-picrust
Feature/py picrust (#9184)
2018-09-14 17:24:17 -07:00
py-pil
…
py-pillow
…
py-pip
…
py-pipits
…
py-pkgconfig
…
py-plotly
…
py-pluggy
…
py-ply
…
py-pmw
…
py-poster
…
py-pox
…
py-ppft
…
py-prettytable
…
py-proj
…
py-projectq
…
py-prompt-toolkit
…
py-protobuf
…
py-psutil
…
py-psyclone
…
py-ptyprocess
…
py-pudb
…
py-py
…
py-py2bit
…
py-py2cairo
…
py-py2neo
…
py-py4j
…
py-pyani
…
py-pyasn1
…
py-pybedtools
…
py-pybigwig
…
py-pybind11
…
py-pybtex
…
py-pybtex-docutils
…
py-pychecker
…
py-pycodestyle
…
py-pycparser
…
py-pycrypto
…
py-pycurl
…
py-pydatalog
…
py-pydispatcher
…
py-pydot
…
py-pyelftools
…
py-pyepsg
…
py-pyfaidx
…
py-pyfasta
…
py-pyfftw
…
py-pyflakes
…
py-pygdbmi
…
py-pygments
…
py-pygobject
…
py-pygpu
…
py-pygtk
…
py-pylint
…
py-pymatgen
…
py-pyminifier
…
py-pymol
…
py-pympler
…
py-pymysql
…
py-pynn
…
py-pypar
…
py-pyparsing
…
py-pypeflow
…
py-pyprof2html
…
py-pyqi
…
py-pyqt
…
py-pyrad
…
py-pysam
…
py-pyscaf
…
py-pyserial
…
py-pyshp
…
py-pyside
…
py-pysocks
…
py-pysqlite
…
py-pytables
…
py-pytest
…
py-pytest-cov
…
py-pytest-flake8
…
py-pytest-httpbin
…
py-pytest-mock
…
py-pytest-runner
…
py-pytest-xdist
…
py-python-daemon
…
py-python-engineio
…
py-python-gitlab
…
py-python-levenshtein
…
py-python-socketio
…
py-pythonqwt
…
py-pytorch
…
py-pytz
…
py-pyutilib
…
py-pyvcf
…
py-pywavelets
…
py-pyyaml
…
py-qtawesome
…
py-qtconsole
…
py-qtpy
…
py-quantities
…
py-quast
…
py-radical-utils
…
py-ranger
…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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py-spectra
py-spectra: new version (#9224)
2018-09-14 16:59:50 -07:00
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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python
Build Python 3.7 with external libffi. (#9245)
2018-09-14 17:07:13 -07:00
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…
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…
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qt
…
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…
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quinoa
Charmpp: rename charm to charmpp according to ++ conventions (#9216)
2018-09-14 17:01:07 -07:00
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
r-catools
…
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…
r-cellranger
…
r-cghflasso
…
r-checkmate
…
r-checkpoint
…
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…
r-chron
…
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…
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…
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…
r-cli
…
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…
r-cluster
…
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…
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…
r-coda
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…
r-complexheatmap
…
r-corpcor
…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
r-diffusionmap
…
r-digest
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…
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…
r-dismo
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…
r-domc
…
r-doparallel
…
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…
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…
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…
r-fastcluster
…
r-fastmatch
…
r-ff
…
r-fftwtools
…
r-fgsea
…
r-filehash
…
r-findpython
…
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…
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…
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…
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…
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…
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r-genomicranges
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
r-illuminaio
…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
r-maps
…
r-maptools
…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
r-minqa
…
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…
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…
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…
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…
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…
r-mlr
…
r-mlrmbo
…
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…
r-mnormt
…
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…
r-modelr
…
r-modeltools
…
r-mpm
…
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…
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…
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…
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r-ncdf4
…
r-network
…
r-networkd3
…
r-nlme
…
r-nloptr
r-nloptr: Explicit depends_on(nlopt). Previously there was a hidden d… (#9176)
2018-09-14 08:11:16 -05:00
r-nmf
…
r-nnet
…
r-nnls
…
r-nor1mix
…
r-np
…
r-numderiv
…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
r-rvest
…
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…
r-s4vectors
…
r-samr
…
r-sandwich
…
r-scales
…
r-scatterplot3d
…
r-sdmtools
…
r-segmented
…
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…
r-seqinr
…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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raxml
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rclone
new package: rclone (#9268)
2018-09-18 18:39:07 -07:00
rdma-core
Update rdma-core : new version and conflict with intel (#9255)
2018-09-15 19:42:45 -05:00
rdp-classifier
…
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…
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…
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…
rgb
…
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…
rlwrap
…
rmats
rmats: new package starting at 4.0.2 (#9243)
2018-09-14 14:54:26 -07:00
rmlab
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rna-seqc
…
rngstreams
…
rockstar
…
root
…
rose
…
ross
…
rr
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rsbench
…
rsem
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…
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ruby
…
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…
scalasca
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…
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…
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scorep
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scr
…
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…
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…
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…
seqan
…
seqprep
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…
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…
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…
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…
soapdenovo2
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soapdenovo-trans
…
soapindel
…
soapsnp
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sofa-c
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sox
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spades
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sqlite
Build Python 3.7 with external libffi. (#9245)
2018-09-14 17:07:13 -07:00
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squid
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…
sspace-standard
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sst-dumpi
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sst-macro
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staden-io-lib
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star
star - added latest versions with shasum (#9257)
2018-09-16 15:44:33 -05:00
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stat
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stc
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steps
steps: new package starting at 3.3 (#9173)
2018-09-11 14:43:15 +02:00
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strelka
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stress
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structure
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sublime-text
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subread
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tmuxinator
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tophat
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tppred
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transabyss
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transdecoder
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transposome
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transset
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trapproto
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tree
…
trf
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triangle
…
trilinos
trilinos: disable xlf_tpetra.patch for trilinos@develop (#9193)
2018-09-08 23:51:16 -05:00
trimgalore
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trimmomatic
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trinity
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turbine
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tut
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umpire
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unison
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units
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unixodbc
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unzip
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util-linux
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uuid
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vampirtrace
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vardictjava
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varscan
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vc
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vcsh
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vdt
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vecgeom
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veclibfort
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vegas2
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veloc
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velvet
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verilator
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verrou
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viennarna
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visit
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wannier90
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xsbench: added v18 (#9269)
2018-09-18 14:07:37 -06:00
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xsdk: disable assimp in deal.II (#9190)
2018-09-08 16:07:37 -05:00
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