zhangyiss/spack
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Code Issues Pull Requests Actions Packages Projects Releases Wiki Activity
Files
5429713eef6b1cb8e51e8f6ba9083d4272ddcba6
spack/var/spack/repos/builtin/packages
History
健美猞猁 5429713eef Add version 2.4.0 for cantera. (#12405)
2019-08-13 19:18:38 -05:00
..
abinit
…
abyss
…
accfft
…
ack
…
activeharmony
…
acts-core
ACTS package: add versions including 0.10.1 (#11606)
2019-06-18 11:00:02 -07:00
adept-utils
…
adios
…
adios2
adios2: Fix backwards compatibility version logic for FindMPI (#12241)
2019-08-02 15:27:47 -04:00
adlbx
swift-t: New release packages for 1.4.3 (#11684)
2019-06-14 09:49:51 -05:00
adol-c
…
aegean
…
aida
…
alan
alan: new package at 2.1.1 (#11593)
2019-05-30 17:50:14 -05:00
albany
…
albert
…
alglib
…
allinea-reports
…
allpaths-lg
…
alquimia
…
alsa-lib
…
aluminum
…
amber
New package: amber (starting at v16) (#11619)
2019-06-18 19:01:03 -07:00
amg
packages: computation.llnl.gov is now computing.llnl.gov (#12013)
2019-07-15 07:32:51 -07:00
amg2013
packages: computation.llnl.gov is now computing.llnl.gov (#12013)
2019-07-15 07:32:51 -07:00
aml
Adds the aml memory management library. (#11590)
2019-05-30 16:01:28 -05:00
amp
…
ampliconnoise
…
amrex
Balay/amrex 19.08 (#12287)
2019-08-05 17:34:01 -05:00
amrvis
…
andi
…
angsd
…
ant
…
antlr
…
ants
…
aoflagger
…
aom
…
ape
…
aperture-photometry
…
apex
…
apple-libunwind
…
applewmproto
…
appres
…
apr
…
apr-util
…
aragorn
…
arborx
New package: ArborX (#11474)
2019-06-18 19:14:05 -07:00
archer
…
argobots
…
argp-standalone
…
argtable
…
aria2
new package: aria2 (#12318)
2019-08-08 22:36:13 -05:00
arlecore
…
arm-forge
…
armadillo
…
arpack-ng
…
arrow
…
asagi
new package: asagi: create package.py (#11931)
2019-08-13 11:13:41 -05:00
ascent
Remove version from py-mpi4py. (#11587)
2019-06-17 10:59:34 -04:00
asciidoc
…
asciidoctor
…
aspa
…
aspcud
…
aspect
…
aspell
…
aspell6-de
…
aspell6-en
…
aspell6-es
…
aspera-cli
Update remaining packages to use Stage.source_path (#11662)
2019-06-12 17:07:47 -07:00
assimp
…
astra
…
astral
…
astyle
…
at-spi2-atk
…
at-spi2-core
…
atk
…
atlas
Overhaul numpy package (#12170)
2019-08-06 18:20:23 -05:00
atom-dft
…
atompaw
…
atop
…
augustus
…
autoconf
…
autodock-vina
…
autofact
…
autogen
…
automaded
…
automake
…
awscli
awscli: new package (#11796)
2019-06-23 14:54:48 -04:00
axel
…
axl
…
bamdst
…
bamtools
…
bamutil
…
barrnap
…
bash
…
bash-completion
…
bats
…
bazel
build env: simplify handling of parallel jobs (#11524)
2019-05-24 11:45:22 -07:00
bbcp
…
bbmap
…
bc
…
bcftools
…
bcl2fastq2
Update remaining packages to use Stage.source_path (#11662)
2019-06-12 17:07:47 -07:00
bdftopcf
…
bdw-gc
bdw-gc: add variant for Multithreading (#12223)
2019-08-01 13:29:41 +02:00
bear
…
beast1
…
beast2
…
beast-tracer
…
bedops
…
bedtools2
…
beforelight
…
benchmark
Add Google Benchmark version 1.5.0 (#11626)
2019-06-04 22:53:07 -05:00
berkeley-db
…
bertini
…
bib2xhtml
bib2xhtml: replace version and change the download url (#11837)
2019-06-28 11:03:54 -07:00
bigreqsproto
…
binutils
Added checksum for binutils@2.32 (#12350)
2019-08-08 23:56:41 -05:00
bioawk
…
biobloom
…
biopieces
…
bismark
…
bison
…
bitmap
…
blasr
…
blasr-libcpp
…
blast2go
…
blast-legacy
…
blast-plus
blast-plus package: remove --with-64 on ARM. (#11877)
2019-06-28 10:11:04 -07:00
blat
…
blaze
blaze: converted to CMakePackage (#12357)
2019-08-12 14:47:54 -05:00
blis
modified: var/spack/repos/builtin/packages/blis/package.py (#12225)
2019-08-01 09:37:23 -05:00
bliss
…
blitz
…
bmake
…
bmi
update web site and git url for BMI package (#12036)
2019-07-17 21:28:39 -05:00
bml
bml: add v1.3.1 (#11856)
2019-06-27 10:57:09 -06:00
bohrium
…
bolt
packages: Add autotools dependencies to bolt (#12246)
2019-08-02 12:22:51 -07:00
bookleaf-cpp
…
boost
boost: use clang toolset when building with Fujitsu compiler. (#11827)
2019-07-15 15:13:04 -07:00
boostmplcartesianproduct
…
bowtie
…
bowtie2
bowtie2: Add version 2.5.3.1 and fix to build on ARM (#11974)
2019-07-11 22:04:22 -05:00
boxlib
…
bpp-core
…
bpp-phyl
…
bpp-seq
…
bpp-suite
…
bracken
…
braker
…
branson
…
breakdancer
…
breseq
…
bridger
…
brigand
…
brotli
…
bsseeker2
Allow bsseeker to build with Python 3 (#12075)
2019-07-30 17:11:14 -05:00
bucky
…
bumpversion
…
busco
…
butter
…
butterflypack
added a package butterflypack (#12222)
2019-08-02 18:58:30 -05:00
bwa
…
bwtool
…
byobu
…
bzip2
bzip2: Add 1.0.8 (#12017)
2019-07-14 14:25:20 -05:00
c-blosc
c-blosc package: Add -std=gnu99 flag for gcc (#11959)
2019-08-05 18:04:16 -07:00
c-lime
…
cabana
…
caffe
…
cairo
…
cairomm
…
caliper
…
callpath
…
camellia
camellia: fix hdf5 dependency (#11810)
2019-07-01 13:40:53 -04:00
candle-benchmarks
…
cantera
Add version 2.4.0 for cantera. (#12405)
2019-08-13 19:18:38 -05:00
canu
…
cap3
…
capstone
…
cardioid
…
cares
…
casacore
…
cask
…
casper
…
catalyst
catalyst package: Fix paths used for intermediate code generation (#12082)
2019-07-29 15:31:07 -07:00
catch
catch: more versions, new and older. (#12123)
2019-07-25 11:33:03 -05:00
cbench
…
cblas
…
cbtf
OpenSpeedShop/CBTF package updates and fixes (#11470)
2019-05-16 18:19:55 -07:00
cbtf-argonavis
OpenSpeedShop/CBTF package updates and fixes (#11470)
2019-05-16 18:19:55 -07:00
cbtf-argonavis-gui
OpenSpeedShop/CBTF package updates and fixes (#11470)
2019-05-16 18:19:55 -07:00
cbtf-krell
cbtf-krell: fixed to build on ARM. (#11859)
2019-06-27 11:55:15 +02:00
cbtf-lanl
OpenSpeedShop/CBTF package updates and fixes (#11470)
2019-05-16 18:19:55 -07:00
ccache
…
ccfits
…
cctools
…
cdbfasta
…
cdd
…
cddlib
…
cdecimal
…
cdhit
…
cdo
cdo: Remove obsolete patch (#11854)
2019-06-26 19:36:41 -05:00
ceed
…
cereal
…
ceres-solver
…
cfitsio
make cfitsio explicitly depend on curl (#12016)
2019-07-14 14:40:09 -05:00
cgal
…
cgdb
New package: cgdb (#12154)
2019-07-29 17:19:53 -07:00
cgm
…
cgns
…
channelflow
…
chapel
…
charliecloud
add charliecloud v0.10 (#12046)
2019-07-17 21:28:02 -05:00
charmpp
Update remaining packages to use Stage.source_path (#11662)
2019-06-12 17:07:47 -07:00
chatterbug
…
check
…
chill
New packages: Chill and IEGenLib (#11406)
2019-06-27 13:41:06 -07:00
chlorop
…
chombo
…
chrpath
…
cinch
Added Cinch Spackage (#11759)
2019-06-18 16:45:58 -05:00
circos
…
cistem
Add py-wxpython package (#12163)
2019-07-30 17:13:32 -05:00
citcoms
…
cityhash
…
clamav
Fix pkgconfig dependencies (#11864)
2019-06-27 14:56:42 +02:00
clamr
…
clapack
…
claw
Add version 1.2.2 and 1.2.3 to the package (#11748)
2019-06-17 16:03:26 +02:00
cleaveland4
…
cleverleaf
…
clfft
…
clhep
Update remaining packages to use Stage.source_path (#11662)
2019-06-12 17:07:47 -07:00
clingo
…
cln
…
cloc
…
cloog
…
cloverleaf
…
cloverleaf3d
…
clp
…
clustalo
…
clustalw
…
cmake
update cmake 3.15.1 checksum (#12182)
2019-07-29 15:13:52 -04:00
cmocka
…
cmor
CMOR package: add version 3.4.0 (Python3-compatible) (#12076)
2019-07-29 16:12:37 -07:00
cnmem
…
cnpy
…
cntk
…
cntk1bitsgd
…
cnvnator
…
codar-cheetah
…
codes
…
coevp
…
cohmm
…
coinhsl
…
colm
…
colordiff
…
comd
…
commons-lang
…
commons-lang3
…
commons-logging
…
compiz
…
compositeproto
…
conduit
LBANN: add support for new python front end (#11395)
2019-05-15 06:20:00 +09:00
connect-proxy
…
constype
…
converge
…
coreutils
…
corset
…
cosmomc
…
cosp2
…
cotter
…
cowsay
cowsay: new package (#11743)
2019-06-16 17:29:25 +02:00
cp2k
CP2K/SIRIUS: add support for building with CUDA, fix CP2K build with MKL (#11418)
2019-08-13 19:59:08 +02:00
cppad
…
cppcheck
Add cppcheck version 1.87. (#11536)
2019-05-22 18:52:48 -05:00
cppgsl
…
cpprestsdk
…
cppunit
…
cppzmq
…
cpu-features
…
cpuinfo
…
cquery
…
cram
…
cromwell
new package: Cromwell (#12309)
2019-08-08 22:39:00 -05:00
cromwell-womtool
new package: Cromwell (#12309)
2019-08-08 22:39:00 -05:00
cryptopp
…
cscope
…
csdp
…
ctffind
Add py-wxpython package (#12163)
2019-07-30 17:13:32 -05:00
cub
…
cube
Add new releases of Cube Tools, Opari2, OTF2, and Score-P (#12303)
2019-08-08 22:44:33 -05:00
cubelib
Add new releases of Cube Tools, Opari2, OTF2, and Score-P (#12303)
2019-08-08 22:44:33 -05:00
cubew
Add new releases of Cube Tools, Opari2, OTF2, and Score-P (#12303)
2019-08-08 22:44:33 -05:00
cuda
find_libraries searches lib and lib64 before prefix (#11958)
2019-07-12 17:46:47 -07:00
cuda-memtest
…
cudnn
LBANN: add support for new python front end (#11395)
2019-05-15 06:20:00 +09:00
cufflinks
…
cups
…
curl
…
cvs
…
czmq
…
dakota
…
daligner
…
damageproto
…
damaris
…
damselfly
…
darshan-runtime
…
darshan-util
…
dash
…
datamash
…
dataspaces
…
dateutils
dateutils: new package (#11623)
2019-06-08 13:32:57 -07:00
davix
…
dbcsr
…
dbus
…
dcmtk
…
dd4hep
…
dealii
dealii: add 9.1.1 (#11573)
2019-05-28 15:22:39 -05:00
dealii-parameter-gui
…
deconseq-standalone
…
dejagnu
…
delly2
…
denovogear
…
dftfe
…
dia
…
dialign-tx
dialign-tx: build on ARM. (#12210)
2019-08-02 19:02:36 -05:00
diamond
…
diffsplice
diffsplice package: remove -m64 on ARM. (#11899)
2019-07-08 17:13:49 -07:00
diffutils
…
dimemas
New package: dimemas (#11979)
2019-07-11 13:55:43 -07:00
direnv
…
discovar
…
discovardenovo
…
dislin
…
diy
…
dlpack
…
dmd
…
dmlc-core
…
dmtcp
…
dmxproto
…
docbook-xml
…
docbook-xsl
…
dos2unix
…
dotnet-core-sdk
…
double-conversion
…
doxygen
…
draco
Add a new version (7.2) of draco. (#11852)
2019-07-28 22:15:21 -05:00
dri2proto
…
dri3proto
…
ds
…
dsdp
…
dsrc
…
dtcmp
…
dyninst
dyninst: rework the cmake args for version 10.1 and later (#11484)
2019-05-18 23:00:48 -05:00
dysco
…
ea-utils
…
easybuild
…
ebms
…
eccodes
Add eccodes 2.13.0 (#12077)
2019-07-30 17:11:29 -05:00
ecflow
…
eclipse-gcj-parser
…
ecp-io-sdk
…
ecp-proxy-apps
…
ecp-viz-sdk
…
ed
…
editline
…
editres
…
eigen
…
elasticsearch
…
elemental
…
elfutils
…
elk
…
elmer-fem
…
elpa
…
elsd
…
elsdc
…
elsi
New Package: ELSI (#11605)
2019-06-18 18:30:57 -07:00
emacs
…
ember
remove binary file that got added inadvertently via #11828 (#11848)
2019-06-25 21:31:36 -04:00
emboss
…
enchant
enchant@2.2.5: new package (#12349)
2019-08-08 22:50:06 -05:00
energyplus
…
entrezdirect
…
environment-modules
environment-modules package: add version 4.3.0 (#12155)
2019-07-27 12:20:39 -05:00
eospac
eospac package: replace md5 checksums with sha256 (#11757)
2019-06-18 19:20:35 -07:00
eqr
…
er
…
erfa
…
ermod
ermod: new package (#12192)
2019-08-02 19:08:35 -05:00
erne
…
es
…
esmf
…
essl
…
ethminer
…
etsf-io
…
everytrace
…
everytrace-example
…
evieext
…
exabayes
…
examinimd
…
exampm
…
exasp2
…
exchanger
…
exmcutils
swift-t: New release packages for 1.4.3 (#11684)
2019-06-14 09:49:51 -05:00
exodusii
…
exonerate
exonerate use autotools. (#11805)
2019-06-21 07:55:29 -04:00
expat
…
expect
…
express
…
extrae
…
exuberant-ctags
…
eztrace
…
f18
F18: Fix the location to the f18 binary (#12186)
2019-07-31 15:43:08 +02:00
f90cache
f90cache: change the download url (#11838)
2019-06-27 12:55:48 -04:00
fabtests
…
falcon
…
faodel
FAODEL: Add 1.1906.1 (#12180)
2019-08-02 19:14:21 -05:00
fast-global-file-status
…
fasta
…
fastjar
…
fastmath
…
fastme
…
fastphase
…
fastq-screen
…
fastqc
…
fastqvalidator
…
fasttree
…
fastx-toolkit
…
fenics
fenics, llvm: Fix package names being overriden (#11879)
2019-06-28 15:59:19 +02:00
fermi
…
fermikit
…
fermisciencetools
…
ferret
Ferret: add version 7.2 and adjust dependencies (#11921)
2019-07-09 09:33:07 -04:00
ffmpeg
…
fftw
…
fgsl
New package: fgsl: fortran interface to GSL (#11775)
2019-06-19 10:59:11 -07:00
figtree
…
fimpute
…
findutils
…
fio
…
fish
…
fixesproto
…
flac
…
flang
…
flann
…
flash
…
flatbuffers
…
flatcc
flatcc: add version 0.5.3 (#12358)
2019-08-09 21:32:10 -05:00
flecsale
…
flecsi
Add llvm as deps when static analyzer is enabled (#11888)
2019-07-02 11:45:13 -06:00
flex
…
flint
…
flit
…
fltk
fltk: fix about variable types (#12292)
2019-08-06 11:07:27 -07:00
flux-core
…
flux-sched
…
fluxbox
…
fmt
Update checksum of fmt 5.3.0 (#12037)
2019-07-28 22:07:51 -05:00
foam-extend
Rename build logs and make names consistent (#11806)
2019-07-11 13:32:06 -07:00
folly
…
font-util
Small fixes for font-util package (#12148)
2019-07-26 10:32:39 -05:00
fontcacheproto
…
fontconfig
…
fontsproto
…
fonttosfnt
…
fp16
…
fpc
…
fqtrim
…
fr-hit
…
freebayes
…
freeglut
…
freetype
Add conflicts statement to freetype for icc (#12111)
2019-07-24 12:33:24 -05:00
freexl
…
fseq
…
fsl
…
fslsfonts
…
fstobdf
…
fstrack
…
ftgl
…
funhpc
…
fyba
…
fzf
…
g4abla
Geant4 data packages: Set the install path name explicitly. (#12244)
2019-08-02 13:48:35 -05:00
g4emlow
Geant4 data packages: Set the install path name explicitly. (#12244)
2019-08-02 13:48:35 -05:00
g4ensdfstate
Geant4 data packages: Set the install path name explicitly. (#12244)
2019-08-02 13:48:35 -05:00
g4ndl
Geant4 data packages: Set the install path name explicitly. (#12244)
2019-08-02 13:48:35 -05:00
g4neutronxs
Geant4 data packages: Set the install path name explicitly. (#12244)
2019-08-02 13:48:35 -05:00
g4photonevaporation
Geant4 data packages: Set the install path name explicitly. (#12244)
2019-08-02 13:48:35 -05:00
g4pii
Geant4 data packages: Set the install path name explicitly. (#12244)
2019-08-02 13:48:35 -05:00
g4radioactivedecay
Geant4 data packages: Set the install path name explicitly. (#12244)
2019-08-02 13:48:35 -05:00
g4realsurface
Geant4 data packages: Set the install path name explicitly. (#12244)
2019-08-02 13:48:35 -05:00
g4saiddata
Geant4 data packages: Set the install path name explicitly. (#12244)
2019-08-02 13:48:35 -05:00
g4tendl
Geant4 data packages: Set the install path name explicitly. (#12244)
2019-08-02 13:48:35 -05:00
gapbs
…
gapcloser
…
gapfiller
…
gasnet
gasnet: 2019.3.0 (#11503)
2019-05-17 12:02:43 -06:00
gatk
…
gaudi
…
gaussian
…
gawk
…
gblocks
…
gcc
gcc: Add 9.2.0 (#12411)
2019-08-13 19:08:12 -05:00
gccmakedep
…
gccxml
…
gconf
…
gcta
…
gdal
Add GDAL 3.0.1 (#12140)
2019-07-26 09:25:35 +02:00
gdb
gdb: add version 8.3 (#12018)
2019-07-14 16:45:55 -05:00
gdbm
…
gdk-pixbuf
…
gdl
Add py-wxpython package (#12163)
2019-07-30 17:13:32 -05:00
geant4
geant4: improvements with respect to building against CLHEP. (#12124)
2019-07-25 08:58:13 -05:00
geant4-data
…
gearshifft
…
gemmlowp
…
genemark-et
…
genomefinisher
genomefinisher: fixed query on jdk instead of java (#12196)
2019-07-31 08:55:56 +02:00
genometools
…
geopm
…
geos
Add GEOS 3.7.2 (#11734)
2019-06-17 20:58:43 -04:00
gettext
Fix QT4 build for mac (#10944)
2019-08-01 10:22:35 -07:00
gflags
…
ghost
…
ghostscript
…
ghostscript-fonts
…
giflib
…
ginkgo
ginkgo: add maintainers (#12273)
2019-08-04 20:36:04 -05:00
git
Revert "Git: patch to make git relocatable with buildcache. (#11596)" (#11625)
2019-06-04 21:09:05 -05:00
git-fat-git
…
git-imerge
…
git-lfs
git-lfs: add version 2.8.0 (#12131)
2019-07-25 19:46:03 -05:00
gl2ps
…
glew
…
glfmultiples
…
glib
glib: fix glib dependency build fixes #9992 (#12153)
2019-08-02 15:18:04 -05:00
glibmm
…
glimmer
…
glm
…
global
…
globalarrays
…
globus-toolkit
…
glog
…
gloo
…
glpk
…
glproto
…
glvis
…
gmake
…
gmap-gsnap
gmap-gsnap: add 2019-05-12 (#11453)
2019-05-14 15:58:48 -05:00
gmime
…
gmodel
…
gmp
…
gmsh
…
gmt
…
gmtsar
…
gnat
…
gnome-common
gnome-common: new package (#12359)
2019-08-09 21:31:47 -05:00
gnu-prolog
…
gnupg
Update GnuPG and associated packages (#11564)
2019-05-26 20:41:37 -05:00
gnuplot
Add py-wxpython package (#12163)
2019-07-30 17:13:32 -05:00
gnutls
gnutls: workaround guile build error on macos (#11751)
2019-06-25 13:08:28 -04:00
go
Added newer GoLang versions (#11756)
2019-06-17 17:23:09 -05:00
go-bootstrap
…
gobject-introspection
…
googletest
googletest: Fix reversed +pthreads option (#12128)
2019-07-25 19:50:23 -05:00
gotcha
Gotcha package: fixed to build on ARM. (#11840)
2019-06-27 15:34:11 -07:00
gource
…
gperf
…
gperftools
…
gpgme
Fix package gpgme dependency (#12410)
2019-08-13 19:08:50 -05:00
gplates
Restrict gplates to proj@:5 (#11761)
2019-06-18 15:15:14 -04:00
grackle
…
gradle
…
grandr
…
graph500
…
graphicsmagick
…
graphlib
…
graphmap
…
graphviz
graphviz package: add MacOS fixes and quartz support (#11128)
2019-08-06 16:26:45 -07:00
grass
Package/grass: fix iconv linking issue (#12165)
2019-08-12 13:45:05 -07:00
grib-api
…
grnboost
…
groff
…
gromacs
gromacs: fix CPU optimizations detection (simd=auto) (#12354)
2019-08-09 21:38:16 -05:00
gsl
…
gslib
…
gtkmm
…
gtkorvo-atl
…
gtkorvo-cercs-env
…
gtkorvo-dill
…
gtkorvo-enet
…
gtkplus
…
gtksourceview
gtksourceview: new package (#12387)
2019-08-12 14:44:54 -05:00
gts
…
guidance
…
guile
guile: add versions 2.2.1 through 2.2.6 (#12333)
2019-08-08 22:22:17 -05:00
gurobi
…
h5hut
…
h5part
…
h5utils
…
h5z-zfp
…
hacckernels
…
hadoop
…
halc
…
hapcut2
…
hapdip
…
haploview
…
harfbuzz
…
harminv
…
hc
…
hdf
Add HDF 4.2.14 (#11723)
2019-06-16 08:45:23 +02:00
hdf5
…
hdf5-blosc
…
help2man
…
henson
…
hepmc
…
heppdt
…
hic-pro
…
highfive
…
highwayhash
…
hiop
…
hisat2
…
hisea
hisea: build on ARM. (#12302)
2019-08-08 22:45:23 -05:00
hmmer
…
homer
…
hoomd-blue
…
hotspot
hotspot: new package at 6.0 (#11610)
2019-06-04 09:35:54 +02:00
hpccg
…
hpctoolkit
hpctoolkit: add version gpu and variant cuda (#12068)
2019-07-21 22:29:08 -07:00
hpcviewer
hpcviewer: update sha sums for version 2019.07 (#12236)
2019-08-02 18:55:46 -05:00
hpgmg
hpgmp package: Don't add cpu=native on ARM when using gcc 5.x or before (#12034)
2019-07-29 16:53:59 -07:00
hpl
Fix latest HPL for MKL use (#11712)
2019-06-15 15:46:59 -05:00
hpx
Added HPX version 1.3.0. (#12025)
2019-07-15 20:54:54 -05:00
hpx5
…
hsakmt
…
hstr
…
htop
…
htslib
…
httpie
…
hub
…
hugo
…
hunspell
bugfix: hunspell: add missing gettext dependency (#12347)
2019-08-09 10:17:57 -05:00
hwloc
…
hybpiper
…
hydra
…
hydrogen
LBANN: add support for new python front end (#11395)
2019-05-15 06:20:00 +09:00
hyphy
…
hypre
packages: computation.llnl.gov is now computing.llnl.gov (#12013)
2019-07-15 07:32:51 -07:00
i3
…
ibm-java
hpcviewer: add version 2019.07 (#12067)
2019-07-20 10:07:15 -07:00
ibmisc
Restrict ibmisc to proj@:4 (#11753)
2019-06-17 18:02:09 -04:00
iceauth
…
icedtea
…
icet
…
ico
…
icu4c
…
id3lib
…
idba
…
iegenlib
Fixed broken iegenlib package (#12229)
2019-08-09 10:14:17 -05:00
igraph
…
igvtools
igvtools: fixed query on jdk instead of java (#12195)
2019-07-31 14:49:51 +02:00
ilmbase
…
image-magick
…
imake
…
imp
…
impute2
…
infernal
…
inputproto
…
intel
Add auto-dispatch specification to Intel packages (#11697)
2019-07-15 11:37:54 -07:00
intel-daal
…
intel-gpu-tools
…
intel-ipp
…
intel-mkl
…
intel-mkl-dnn
Add new versions for intel-mkl-dnn. (#11549)
2019-05-26 20:44:34 -05:00
intel-mpi
intel: add version 19.0.4 (#11741)
2019-06-15 23:19:58 -05:00
intel-parallel-studio
Add auto-dispatch specification to Intel packages (#11697)
2019-07-15 11:37:54 -07:00
intel-pin
…
intel-tbb
intel-tbb: fix patch for old compilers (#11371)
2019-05-18 21:00:32 -05:00
intel-xed
Resources: use expanded archive name by default (#11688)
2019-06-20 11:09:31 -07:00
interproscan
interproscan: new package at 5.36-75.0 (#12130)
2019-07-25 19:49:42 -05:00
intltool
…
ioapi
ioapi: add version 3.2 (#12088)
2019-07-23 12:10:01 -05:00
ior
…
iozone
…
iperf2
…
iperf3
…
ipopt
…
isaac
…
isaac-server
isaac-server: Don't add -march=native on ARM and gcc 5.x or before. (#12042)
2019-07-23 16:48:25 -05:00
isl
…
itstool
…
itsx
…
jackcess
Update URL for older version of jackcess (#11724)
2019-06-16 08:46:13 +02:00
jags
…
jansson
…
jasper
…
jbigkit
…
jchronoss
…
jdk
jdk: Add JDK 12.0.2_10 (#12081)
2019-07-22 12:40:11 -05:00
jellyfish
…
jemalloc
…
jmol
…
jq
…
json-c
…
json-cwx
…
json-fortran
…
json-glib
…
jsoncpp
Preventing jsoncpp from building tests (#11948)
2019-07-31 12:18:25 -05:00
jube
Set default resource manager to 'none' (#12092)
2019-08-02 19:23:14 -05:00
judy
…
julia
…
k8
…
kahip
…
kaiju
…
kaks-calculator
…
kaldi
…
kallisto
…
karma
…
kbproto
…
kdiff3
…
kealib
kealib: fix incorrect md5sum for v1.4.11 (#12126)
2019-07-26 15:14:46 -05:00
kentutils
…
kibana
…
kim-api
kim-api: added version 2.1.2 (#12189)
2019-07-31 09:13:13 +02:00
kitty
kitty: Fix pkgconfig dependency (#11465)
2019-05-15 12:18:16 +02:00
kmergenie
…
kokkos
Kokkos package: add debug variant (#11469)
2019-05-16 17:35:23 -07:00
kraken
…
krb5
…
krims
…
kripke
packages: computation.llnl.gov is now computing.llnl.gov (#12013)
2019-07-15 07:32:51 -07:00
kvasir-mpl
…
kvtree
…
ladot
…
laghos
packages: computation.llnl.gov is now computing.llnl.gov (#12013)
2019-07-15 07:32:51 -07:00
lame
lame & libmad: Added two new packages for sox mp3 support. (#11964)
2019-07-25 10:40:50 -05:00
lammps
Change dependencies to use virtual jpeg package (#12179)
2019-07-29 12:08:55 -05:00
last
…
lastz
…
latte
…
launchmon
patch launchmon to fix char * conversion error (#12219)
2019-07-31 16:47:35 -05:00
lazyten
…
lbann
LBANN: add support for new python front end (#11395)
2019-05-15 06:20:00 +09:00
lbxproxy
…
lbzip2
…
lcals
packages: computation.llnl.gov is now computing.llnl.gov (#12013)
2019-07-15 07:32:51 -07:00
lcms
…
ldc
…
ldc-bootstrap
…
legion
Add HDF5 variant to Legion package (#12221)
2019-08-01 10:33:29 -06:00
lemon
…
leveldb
leveldb: add 1.22 (#12044)
2019-07-19 09:26:09 -05:00
lftp
…
libaec
…
libaio
…
libapplewm
…
libarchive
…
libassuan
Update GnuPG and associated packages (#11564)
2019-05-26 20:41:37 -05:00
libatomic-ops
…
libbeagle
…
libbeato
…
libbsd
…
libbson
…
libcanberra
…
libcap
…
libceed
…
libcerf
…
libcheck
…
libcint
…
libcircle
…
libconfig
libconfig: add version 1.7.1 (#12324)
2019-08-10 11:08:53 -05:00
libcroco
…
libctl
…
libdivsufsort
…
libdmx
…
libdrm
…
libdwarf
…
libeatmydata
…
libedit
…
libelf
…
libemos
…
libepoxy
add glx variant to libepoxy (#11814)
2019-06-24 17:57:17 -04:00
libev
…
libevent
…
libevpath
…
libfabric
Add EFA fabric to libfabric
2019-07-23 12:08:33 -07:00
libffi
…
libffs
…
libfive
Add new package: libfive@master (#12334)
2019-08-09 18:10:00 -05:00
libflame
modified: var/spack/repos/builtin/packages/libflame/package.py (#12379)
2019-08-10 11:48:58 -05:00
libfontenc
…
libfs
…
libgcrypt
Update GnuPG and associated packages (#11564)
2019-05-26 20:41:37 -05:00
libgd
…
libgeotiff
Add libgeotiff 1.5.1 (#11731)
2019-06-17 20:46:46 -04:00
libgit2
…
libgpg-error
Update GnuPG and associated packages (#11564)
2019-05-26 20:41:37 -05:00
libgpuarray
…
libgridxc
…
libgtextutils
…
libharu
…
libhio
…
libiberty
…
libice
…
libiconv
…
libidn2
CMake package: add dependencies (#11257)
2019-05-15 10:07:31 -07:00
libint
…
libjpeg
…
libjpeg-turbo
libjpeg-turbo: set compiler flags with CMake args (#11938)
2019-07-17 15:37:18 -07:00
libksba
…
liblbxutil
…
liblockfile
…
libmad
lame & libmad: Added two new packages for sox mp3 support. (#11964)
2019-07-25 10:40:50 -05:00
libmatheval
…
libmaxminddb
…
libmesh
Libmesh updates (#11750)
2019-06-17 19:38:19 -05:00
libmng
…
libmo-unpack
New packages: libmo-unpack and py-mo-pack (#11895)
2019-07-01 18:24:45 -07:00
libmongoc
…
libmonitor
…
libnbc
…
libnl
…
libnova
…
libnrm
New packages: nrm and libnrm (#11777)
2019-06-20 19:21:44 -07:00
libnsl
…
libogg
…
liboldx
…
libpcap
…
libpciaccess
…
libpfm4
…
libpipeline
…
libplist
…
libpmemobj-cpp
…
libpng
…
libpsl
…
libpthread-stubs
…
libquo
…
librom
…
libseccomp
…
libsharp
libsharp: Don't add -march=native on ARM (#12064)
2019-07-21 21:56:14 -05:00
libshm
…
libsigcpp
…
libsigsegv
…
libsm
…
libsodium
…
libspatialindex
…
libspatialite
Restrict libspatialite to proj@:5' (#11752)
2019-06-17 23:48:16 -04:00
libsplash
…
libssh
…
libssh2
…
libsvm
…
libszip
…
libtasn1
…
libtermkey
…
libtiff
Add libtiff 4.0.10 (#11732)
2019-06-16 08:52:16 +02:00
libtirpc
…
libtomlc99
libtomlc99: Update version
2019-06-30 16:02:08 -07:00
libtool
libtool: execute autoreconf at ver.2.4.2 (#11913)
2019-07-03 18:04:29 -07:00
libunistring
…
libunwind
…
libusb
…
libusbmuxd
…
libuuid
…
libuv
…
libvdwxc
…
libvorbis
…
libvterm
…
libwebsockets
…
libwindowswm
…
libx11
…
libxau
…
libxaw
…
libxaw3d
…
libxc
libxc: Make configure recognize Fujitsu compiler (#12147)
2019-07-26 12:09:52 -05:00
libxcb
…
libxcomposite
…
libxcursor
…
libxdamage
…
libxdmcp
…
libxevie
…
libxext
…
libxfixes
…
libxfont
…
libxfont2
…
libxfontcache
…
libxft
…
libxi
…
libxinerama
…
libxkbcommon
…
libxkbfile
…
libxkbui
…
libxml2
…
libxmu
…
libxp
…
libxpm
libxpm: cope with system gettext if configured. (#10881)
2019-07-19 08:36:58 -05:00
libxpresent
…
libxprintapputil
…
libxprintutil
…
libxrandr
…
libxrender
…
libxres
…
libxscrnsaver
…
libxshmfence
…
libxslt
…
libxsmm
LIBXSMM package: add version 1.13 and optional shared libs (#11998)
2019-07-29 17:14:41 -07:00
libxstream
…
libxt
…
libxtrap
…
libxtst
…
libxv
…
libxvmc
…
libxxf86dga
…
libxxf86misc
…
libxxf86vm
…
libyaml
…
libyogrt
…
libzip
…
liggghts
liggghts: added version 3.8.0 (#12242)
2019-08-02 18:53:06 -05:00
lighttpd
…
likwid
likwid package: Fix build with version 4.3.4 (#11878)
2019-06-28 10:05:38 -07:00
linkphase3
…
linux-headers
…
listres
…
llvm
Use correct GCC installation when installing clang with GCC (#12381)
2019-08-11 12:40:12 -05:00
llvm-openmp
Fix scikit-learn build with Apple clang (#11496)
2019-07-17 21:27:16 -05:00
llvm-openmp-ompt
Fix scikit-learn build with Apple clang (#11496)
2019-07-17 21:27:16 -05:00
lm-sensors
…
lmdb
…
lmod
Update remaining packages to use Stage.source_path (#11662)
2019-06-12 17:07:47 -07:00
lndir
…
log4cplus
…
log4cxx
…
loki
…
lordec
…
lrslib
…
lrzip
…
lsf
Add LSF dependency for OpenMPI (#11532)
2019-05-29 10:38:55 -07:00
lsof
…
ltrace
…
lua
Updated lmod (to version 8.1.5) and associated dependencies (#11552)
2019-05-24 12:45:52 -05:00
lua-bitlib
…
lua-jit
…
lua-lpeg
…
lua-luafilesystem
bugfix: lua-luafilesystem package should use stage.source_path (#11648)
2019-06-06 14:07:46 -07:00
lua-luaposix
…
lua-mpack
…
luit
luit package: use autotools. (#11962)
2019-07-11 13:34:50 -07:00
lulesh
packages: computation.llnl.gov is now computing.llnl.gov (#12013)
2019-07-15 07:32:51 -07:00
lumpy-sv
…
lwgrp
…
lwm2
…
lz4
…
lzma
…
lzo
…
m4
Define LDFLAGS when using fujitsu compiler (#11669)
2019-06-10 11:01:32 -04:00
macsio
packages: computation.llnl.gov is now computing.llnl.gov (#12013)
2019-07-15 07:32:51 -07:00
mad-numdiff
…
mafft
…
magics
Add Magics 4.1.0 (#12078)
2019-07-30 17:11:47 -05:00
magma
Add version 2.5.1 of MAGMA released today (#12274)
2019-08-04 20:36:48 -05:00
makedepend
…
mallocmc
…
man-db
…
manta
…
mapserver
Specify which versions of PROJ work with MapServer (#11764)
2019-06-17 21:34:54 -04:00
maq
…
margo
…
mariadb
…
mariadb-c-client
…
masa
…
masurca
…
mathematica
Rename build logs and make names consistent (#11806)
2019-07-11 13:32:06 -07:00
matio
…
matlab
…
maven
…
maverick
…
mawk
…
mbedtls
mbedtls: add pic variant (#11558)
2019-05-24 21:50:13 -05:00
mc
…
mcl
…
mdtest
…
med
…
meep
…
mefit
…
megadock
…
megahit
megahit package: add patch to build on ARM. (#11963)
2019-07-11 17:40:00 -07:00
memaxes
…
meme
…
memkind
…
memsurfer
…
meraculous
…
mercurial
…
mercury
…
mesa
mesa: Revert updated meson build and restore autotools build (#11595)
2019-06-03 10:55:36 -04:00
mesa-glu
…
meshkit
…
meson
…
mesquite
…
metabat
…
metaphysicl
…
metis
…
mfem
…
mgis
…
microbiomeutil
…
migrate
…
mii
mii: new package at 1.0.2 (#12184)
2019-07-30 16:16:41 -05:00
minced
…
mindthegap
…
miniaero
…
miniamr
…
miniasm
…
miniconda2
…
miniconda3
…
minife
…
minighost
…
minigmg
…
minimap2
minimap2, py-mappy: change dependency and build on ARM (#12127)
2019-08-02 19:21:33 -05:00
minimd
…
miniqmc
…
minisign
…
minismac2d
…
minitri
…
minivite
Bumping-up miniVite to version 1.1 (#11828)
2019-06-24 19:41:01 -06:00
minixyce
…
minuit
…
mira
…
mirdeep2
…
mitofates
…
mitos
…
mixcr
…
mkfontdir
…
mkfontscale
…
mlhka
…
mmg
…
moab
Fix build for moab 4.9.2 on gcc8 (#12328)
2019-08-10 11:08:13 -05:00
modern-wheel
…
mofem-cephas
…
mofem-fracture-module
…
mofem-minimal-surface-equation
…
mofem-users-modules
…
molcas
…
mongo-cxx-driver
…
mono
…
montage
montage: new package at 6.0 (#11696)
2019-06-14 16:40:50 -05:00
mosh
…
mothur
…
motif
motif package: fix the download url (#11939)
2019-07-08 16:20:01 -07:00
motioncor2
…
mount-point-attributes
fix mpa package build error with a patch (#12217)
2019-07-31 16:48:06 -05:00
mozjs
…
mpark-variant
…
mpc
…
mpdecimal
…
mpe2
mpe2 use autotools and add libx11 dependency. (#11807)
2019-06-21 07:54:51 -04:00
mpest
…
mpfr
…
mpibash
…
mpiblast
…
mpich
mpich: Add 3.3.1 (#11976)
2019-07-10 20:41:23 -05:00
mpifileutils
…
mpilander
…
mpileaks
Update Package Creation Tutorial for PEARC19 (#12209)
2019-07-31 12:54:09 -05:00
mpip
…
mpir
…
mpix-launch-swift
…
mrbayes
…
mrnet
…
mrtrix3
…
mscgen
…
msgpack-c
…
mshadow
…
msmc
…
multitail
…
multitime
…
multiverso
…
mummer
…
mumps
…
munge
…
muparser
…
muscle
…
muse
…
musl
Packages/musl (#12288)
2019-08-05 20:16:14 -05:00
muster
…
mutationpp
package mutationpp: add new version: 1.0.0 (#12035)
2019-07-16 11:55:53 -05:00
mvapich2
…
mxml
…
mxnet
…
mysql
mysql package: New versions, add conflicts, cope with use of dtrace. (#11356)
2019-08-02 10:51:02 -07:00
nag
…
nalu
…
nalu-wind
…
namd
…
nano
…
nanoflann
nanoflann: Don't add -mtune=native on ARM and gcc 5.x (#12093)
2019-07-23 16:47:28 -05:00
nanopb
…
nasm
Add nasm 2.14.02 (#11729)
2019-06-16 08:50:05 +02:00
nauty
…
ncbi-magicblast
…
ncbi-rmblastn
…
ncbi-toolkit
ncbi-toolkit: add version 22_0_0 (#12278)
2019-08-07 14:18:36 -05:00
nccl
Add NCCL 2.4.8-1 (#12362)
2019-08-10 11:53:29 -05:00
nccmp
…
ncdu
…
ncftp
…
ncl
ncl: Fix build (#11855)
2019-06-26 19:36:29 -05:00
nco
…
ncurses
ncurses: fix pic and opt flags (#12272)
2019-08-06 22:21:25 -05:00
ncview
…
ndiff
…
nek5000
…
nekbone
…
nekcem
…
nektar
…
nektools
…
neovim
…
nest
…
netcdf
…
netcdf-cxx
…
netcdf-cxx4
netcdf-cxx4: add m4 dep for call to autoreconf (#12325)
2019-08-08 22:29:42 -05:00
netcdf-fortran
Bump netcdf-fortran version to 4.4.5 (#11790)
2019-06-19 17:38:17 -05:00
netgauge
…
netgen
…
netlib-lapack
Apply xl patch for cce@9: to fix cmake. (#12392)
2019-08-12 14:41:00 -05:00
netlib-scalapack
…
netlib-xblas
…
nettle
nettle: fix broken build (#11611)
2019-06-05 19:09:01 -05:00
neuron
…
nextflow
…
nfft
…
nghttp2
…
nginx
…
ngmlr
…
nim
New package: Nim (#11649)
2019-07-12 17:03:26 -07:00
ninja
ninja{-fortran}: make pkgs nonvirtual (fix #11628) (#11629)
2019-06-10 12:53:30 -04:00
ninja-fortran
ninja{-fortran}: make pkgs nonvirtual (fix #11628) (#11629)
2019-06-10 12:53:30 -04:00
nix
…
nlohmann-json
…
nlopt
…
nmap
…
nnvm
nnvm: cmake bug is fixed. (#12113)
2019-07-24 12:31:49 -05:00
node-js
…
notmuch
…
npb
…
npm
…
npth
…
nrm
New packages: nrm and libnrm (#11777)
2019-06-20 19:21:44 -07:00
nseg
Update remaining packages to use Stage.source_path (#11662)
2019-06-12 17:07:47 -07:00
nspr
…
ntpoly
…
numactl
…
numdiff
…
nut
nut: add v0.1.1 (#11444)
2019-05-14 16:36:31 -06:00
nvptx-tools
…
nwchem
…
nyancat
…
ocaml
…
occa
…
oce
…
oclint
…
oclock
…
octave
…
octave-optim
…
octave-splines
…
octave-struct
…
octopus
…
of-adios-write
openfoam: rename openfoam-com to openfoam (#11876)
2019-07-01 22:54:36 -07:00
of-catalyst
openfoam: rename openfoam-com to openfoam (#11876)
2019-07-01 22:54:36 -07:00
of-precice
openfoam: rename openfoam-com to openfoam (#11876)
2019-07-01 22:54:36 -07:00
omega-h
…
ompss
…
ompt-openmp
Fix scikit-learn build with Apple clang (#11496)
2019-07-17 21:27:16 -05:00
oniguruma
…
ont-albacore
Rename py-dateutil -> py-python-dateutil (#11717)
2019-06-16 08:40:56 +02:00
opa-psm2
patch opa-psm2 to build with spack wrappers (#12407)
2019-08-13 19:13:21 -05:00
opam
…
opari2
Add new releases of Cube Tools, Opari2, OTF2, and Score-P (#12303)
2019-08-08 22:44:33 -05:00
openbabel
…
openblas
openblas: fix target detection for cross-compiling (#12390)
2019-08-12 14:43:04 -05:00
opencoarrays
package opencoarrays: add new version: 2.7.1 (#12043)
2019-07-17 12:11:02 -05:00
opencv
…
openexr
…
openfast
…
openfoam
OpenFOAM package: update download url (#11973)
2019-07-11 13:45:38 -07:00
openfoam-org
Rename build logs and make names consistent (#11806)
2019-07-11 13:32:06 -07:00
openfst
…
opengl
OpenGL package: always provides gl (#12158)
2019-07-29 12:11:53 -07:00
openglu
…
openimageio
…
openjdk
openjdk (#10446)
2019-07-22 13:11:45 -05:00
openjpeg
Add openjpeg 2.3.1 (#11728)
2019-06-16 08:49:36 +02:00
openkim-models
update to kim-api-2.1.1 and openkim-models-2019-07-25 (#12137)
2019-07-26 13:06:10 -05:00
openmc
…
openmpi
OpenMPI: add support for pbs/tm at configure. (#10620)
2019-07-03 14:07:51 -07:00
opennurbs
…
openpa
…
openpmd-api
openPMD-api: pre-load depend libs (#12279)
2019-08-05 14:02:23 -05:00
openscenegraph
…
openslide
…
openspeedshop
OpenSpeedShop/CBTF package updates and fixes (#11470)
2019-05-16 18:19:55 -07:00
openspeedshop-utils
OpenSpeedShop/CBTF package updates and fixes (#11470)
2019-05-16 18:19:55 -07:00
openssh
…
openssl
openssl package: add versions including 1.1.1c (#12342)
2019-08-08 17:04:53 -07:00
opium
…
optional-lite
Update optional-lite and span-lite to use CMakePackage (#11407)
2019-05-20 13:04:06 -05:00
opus
…
orca
…
orfm
…
orthofiller
…
orthofinder
…
orthomcl
…
osmctools
…
osu-micro-benchmarks
osu-micro-benchmarks: add version 5.6.1 (#11779)
2019-06-19 11:04:03 -07:00
otf
OTF package: use autotools. (#11873)
2019-06-28 10:13:21 -07:00
otf2
Add new releases of Cube Tools, Opari2, OTF2, and Score-P (#12303)
2019-08-08 22:44:33 -05:00
p4est
…
p7zip
…
pacbio-daligner
…
pacbio-damasker
…
pacbio-dazz-db
…
pacbio-dextractor
…
packmol
…
pacvim
…
pagit
…
pagmo
…
pal
…
paml
…
panda
…
pandaseq
…
pango
…
pangomm
…
papi
…
papyrus
…
paradiseo
…
parallel
…
parallel-netcdf
…
paraver
Add py-wxpython package (#12163)
2019-07-30 17:13:32 -05:00
paraview
vtk, paraview, catalyst packages: Add maintainers (#11774)
2019-06-19 10:57:19 -07:00
parmetis
…
parmgridgen
…
parquet
…
parsimonator
parsimonator: Enable build on non x86_64 hosts. (#12194)
2019-08-02 19:07:43 -05:00
parsplice
added branch multisplice to the parsplice package (#11504)
2019-05-17 12:08:40 -06:00
partitionfinder
Rename py-pytables -> py-tables (#11847)
2019-06-25 21:32:49 -04:00
pasta
…
patch
…
patchelf
…
pathfinder
…
pax-utils
…
pbbam
…
pbmpi
…
pbsuite
…
pcma
…
pcre
…
pcre2
…
pdf2svg
Updates to poppler to get pdf2svg working (#11681)
2019-06-15 17:32:39 -05:00
pdftk
…
pdsh
…
pdt
Package/tau/tau 2.28.1 update (#11591)
2019-05-31 10:01:19 -05:00
pegtl
…
pennant
…
percept
…
perl
Perl take in flags (#12112)
2019-07-24 12:32:49 -05:00
perl-algorithm-diff
…
perl-app-cmd
…
perl-array-utils
…
perl-b-hooks-endofscope
…
perl-bio-perl
…
perl-bit-vector
…
perl-cairo
…
perl-capture-tiny
…
perl-carp-clan
…
perl-cgi
…
perl-class-data-inheritable
…
perl-class-inspector
…
perl-class-load
…
perl-class-load-xs
…
perl-clone
…
perl-clone-choose
…
perl-compress-raw-bzip2
…
perl-compress-raw-zlib
…
perl-config-general
…
perl-contextual-return
…
perl-cpan-meta-check
…
perl-data-dumper
…
perl-data-optlist
…
perl-data-stag
…
perl-dbd-mysql
…
perl-dbd-sqlite
…
perl-dbfile
…
perl-dbi
…
perl-devel-cycle
…
perl-devel-globaldestruction
…
perl-devel-overloadinfo
…
perl-devel-stacktrace
…
perl-digest-md5
…
perl-dist-checkconflicts
…
perl-encode-locale
…
perl-eval-closure
…
perl-exception-class
…
perl-exporter-tiny
…
perl-extutils-config
…
perl-extutils-depends
…
perl-extutils-helpers
…
perl-extutils-installpaths
…
perl-extutils-makemaker
…
perl-extutils-pkgconfig
…
perl-file-copy-recursive
…
perl-file-homedir
…
perl-file-listing
…
perl-file-pushd
…
perl-file-sharedir-install
…
perl-file-slurp-tiny
…
perl-file-slurper
…
perl-file-which
…
perl-font-ttf
…
perl-gd
…
perl-gd-graph
…
perl-gd-text
…
perl-gdgraph-histogram
…
perl-graph
…
perl-graph-readwrite
…
perl-hash-merge
…
perl-html-parser
…
perl-html-tagset
…
perl-http-cookies
…
perl-http-daemon
…
perl-http-date
…
perl-http-message
…
perl-http-negotiate
…
perl-inline
…
perl-inline-c
…
perl-intervaltree
…
perl-io-compress
…
perl-io-html
…
perl-io-sessiondata
…
perl-io-socket-ssl
…
perl-io-string
…
perl-json
…
perl-libwww-perl
…
perl-list-moreutils
…
perl-log-log4perl
…
perl-logger-simple
…
perl-lwp
…
perl-lwp-mediatypes
…
perl-lwp-protocol-https
…
perl-math-bezier
…
perl-math-cdf
…
perl-math-cephes
…
perl-math-matrixreal
…
perl-math-round
…
perl-math-vecstat
…
perl-module-build
…
perl-module-build-tiny
…
perl-module-implementation
…
perl-module-runtime
…
perl-module-runtime-conflicts
…
perl-moose
…
perl-mozilla-ca
…
perl-mro-compat
…
perl-namespace-clean
…
perl-net-http
…
perl-net-scp-expect
…
perl-net-ssleay
…
perl-number-format
…
perl-object-insideout
…
perl-package-deprecationmanager
…
perl-package-stash
…
perl-package-stash-xs
…
perl-padwalker
…
perl-parallel-forkmanager
…
perl-params-util
…
perl-params-validate
…
perl-parse-recdescent
…
perl-pdf-api2
…
perl-pegex
…
perl-perl4-corelibs
…
perl-perl6-slurp
…
perl-perlio-gzip
…
perl-perlio-utf8-strict
…
perl-readonly
…
perl-regexp-common
…
perl-scalar-list-utils
…
perl-scalar-util-numeric
…
perl-set-intspan
…
perl-soap-lite
…
perl-star-fusion
…
perl-statistics-basic
…
perl-statistics-descriptive
…
perl-statistics-pca
…
perl-sub-exporter
…
perl-sub-exporter-progressive
…
perl-sub-identify
…
perl-sub-install
…
perl-sub-name
…
perl-sub-uplevel
…
perl-svg
…
perl-swissknife
…
perl-task-weaken
…
perl-term-readkey
…
perl-test-cleannamespaces
…
perl-test-deep
…
perl-test-differences
…
perl-test-exception
…
perl-test-fatal
…
perl-test-memory-cycle
…
perl-test-most
…
perl-test-needs
…
perl-test-requires
…
perl-test-requiresinternet
…
perl-test-warn
…
perl-test-warnings
…
perl-text-csv
…
perl-text-diff
…
perl-text-format
…
perl-text-simpletable
…
perl-text-soundex
…
perl-text-unidecode
…
perl-time-hires
…
perl-time-piece
…
perl-try-tiny
…
perl-uri
…
perl-uri-escape
…
perl-version
…
perl-want
…
perl-www-robotrules
…
perl-xml-parser
…
perl-xml-parser-lite
…
perl-xml-simple
…
perl-yaml
…
perl-yaml-libyaml
…
petsc
petsc: add version 3.11.3 (#11857)
2019-06-27 07:02:03 +02:00
pexsi
…
pfft
…
pflotran
…
pfunit
pfunit: fixed a typo (#11843)
2019-06-25 14:06:52 -04:00
pgdspider
…
pgi
…
pgmath
…
phantompeakqualtools
…
phast
…
phasta
…
phist
phist: added version 1.8.0 (#12201)
2019-07-31 15:35:59 +02:00
phrap-crossmatch-swat
…
phred
…
phylip
…
phyluce
…
picard
Rename build logs and make names consistent (#11806)
2019-07-11 13:32:06 -07:00
picsar
…
picsarlite
…
pidx
…
pigz
…
pilon
…
pindel
…
piranha
…
pism
PISM package: add version 1.1.4 (#12083)
2019-07-29 15:26:03 -07:00
pixman
…
pkg-config
…
pkgconf
pkgconf: Add 1.6.1 (#11863)
2019-06-27 22:15:04 +02:00
planck-likelihood
planck-likelihood: remove -m64 on ARM (#11902)
2019-07-01 10:48:45 -07:00
plasma
Version 19.8.1 of PLASMA (#12299)
2019-08-07 00:08:59 -05:00
platypus
…
plink
New Plink beta version (#12352)
2019-08-09 10:22:18 -05:00
plplot
Add py-wxpython package (#12163)
2019-07-30 17:13:32 -05:00
plumed
…
pmdk
PMDK package: requires ncurses dependency (#11868)
2019-06-28 10:15:06 -07:00
pmgr-collective
…
pmix
added version 3.1.3 of PMIx (#12055)
2019-07-18 13:59:02 -05:00
pnfft
…
pngwriter
…
pnmpi
…
poamsa
…
pocl
…
polymake
…
poppler
New package: TexStudio (#12301)
2019-08-12 14:48:28 -05:00
poppler-data
…
porta
…
portage
portage: add v1.2.2 (#11842)
2019-06-28 06:39:26 -06:00
portcullis
portcullis package: remove -m64 on aarch64. (#11905)
2019-07-02 10:42:06 -07:00
postgresql
…
powerapi
package: Add powerapi package (#11845)
2019-07-09 09:57:53 -04:00
ppl
…
pplacer
…
prank
…
precice
Add preCICE xSDK support (#12356)
2019-08-11 12:19:44 -05:00
presentproto
…
preseq
…
price
…
primer3
…
prinseq-lite
…
printproto
…
prng
…
probconsrna
…
prodigal
…
proj
Add PROJ.6 (#11730)
2019-06-17 23:46:42 -04:00
protobuf
LBANN: add support for new python front end (#11395)
2019-05-15 06:20:00 +09:00
proxymngr
…
prrte
pkg PRRTE: added version 1.0.0 (#12054)
2019-07-18 13:59:39 -05:00
pruners-ninja
…
ps-lite
…
psi4
…
pslib
…
psm
…
psmc
…
pstreams
…
pugixml
…
pumi
pumi: new version 2.2.1 (#12282)
2019-08-06 22:09:46 -05:00
pv
…
pvm
…
pxz
…
py-3to2
…
py-4suite-xml
…
py-abipy
…
py-absl-py
Add py-setuptools as a build dependency for py-absl-py (#12109)
2019-07-24 12:33:45 -05:00
py-adios
…
py-advancedhtmlparser
…
py-aenum
Add py-aenum package (#11716)
2019-06-16 08:39:54 +02:00
py-affine
…
py-alabaster
…
py-alembic
…
py-antlr4-python3-runtime
py-antlr4-python3-runtime: new package (#11890)
2019-07-04 10:12:54 -04:00
py-apache-libcloud
…
py-apipkg
package/py-apipkg add new version, add sha256 sums (#12260)
2019-08-03 18:38:34 -05:00
py-appdirs
…
py-appnope
…
py-apscheduler
…
py-argcomplete
…
py-argparse
…
py-ase
…
py-asn1crypto
…
py-astor
New package py-astor (and test dependency py-astunparse) (#11813)
2019-06-23 17:33:22 -04:00
py-astroid
…
py-astropy
py-astropy: added latest version 3.2.1 (#11967)
2019-07-09 21:19:38 -04:00
py-astunparse
New package py-astor (and test dependency py-astunparse) (#11813)
2019-06-23 17:33:22 -04:00
py-async-generator
…
py-atomicwrites
…
py-attrs
…
py-autopep8
…
py-avro
…
py-avro-json-serializer
…
py-babel
…
py-backcall
…
py-backports-abc
…
py-backports-functools-lru-cache
…
py-backports-shutil-get-terminal-size
…
py-backports-ssl-match-hostname
…
py-backports-tempfile
new package: py-backports-tempfile (#12261)
2019-08-04 16:10:24 -05:00
py-backports-weakref
new package: py-backports-weakref (#12262)
2019-08-03 18:37:10 -05:00
py-basemap
py-basemap: install without egg (#11961)
2019-07-15 10:26:13 -04:00
py-bcbio-gff
…
py-beautifulsoup4
…
py-binwalk
…
py-biom-format
…
py-biomine
…
py-biopython
…
py-bitarray
…
py-bitstring
…
py-black
…
py-bleach
…
py-blessed
new package/py-blessed (#11656)
2019-06-22 17:05:03 -05:00
py-blessings
…
py-bokeh
Rename py-dateutil -> py-python-dateutil (#11717)
2019-06-16 08:40:56 +02:00
py-boltons
…
py-boto3
Add new package py-boto3 (#11722)
2019-06-16 08:44:41 +02:00
py-botocore
Add new package py-botocore (#11720)
2019-06-16 08:43:06 +02:00
py-bottleneck
…
py-breakseq2
…
py-breathe
…
py-brian
…
py-brian2
…
py-bsddb3
…
py-bx-python
…
py-cachetools
Move new packages from tutorial to builtin (#12289)
2019-08-05 19:55:39 -05:00
py-cairocffi
Add py-cairocffi package (#12161)
2019-07-30 17:13:02 -05:00
py-cartopy
py-cartopy does not yet support PROJ.6 (#11765)
2019-06-17 21:35:14 -04:00
py-cclib
…
py-cdat-lite
…
py-cdo
…
py-certifi
Add py-certifi 2019.6.16 (#12339)
2019-08-08 21:57:01 -05:00
py-cf-units
py-cf-units: new package (#11891)
2019-07-03 19:20:34 -04:00
py-cffi
…
py-cftime
…
py-chardet
…
py-checkm-genome
…
py-cheetah
…
py-click
…
py-click-plugins
…
py-cligj
Add py-cligj 0.5.0 (#11727)
2019-06-16 08:48:42 +02:00
py-clipboard
Add py-clipboard package (#12364)
2019-08-10 11:52:52 -05:00
py-cloudpickle
…
py-cogent
…
py-colorama
…
py-colorlog
new package: py-colorlog (#12265)
2019-08-03 18:36:29 -05:00
py-colormath
…
py-colorpy
new package: py-colorpy (#12266)
2019-08-03 18:36:17 -05:00
py-configparser
…
py-counter
…
py-coverage
…
py-cpuinfo
…
py-crispresso
…
py-crossmap
…
py-cryptography
…
py-csvkit
Rename py-dateutil -> py-python-dateutil (#11717)
2019-06-16 08:40:56 +02:00
py-current
…
py-cutadapt
…
py-cvxopt
…
py-cycler
…
py-cython
Add latest version of py-cython (#11494)
2019-05-23 20:01:45 -05:00
py-dask
…
py-dbf
…
py-decorator
…
py-deeptools
…
py-dendropy
…
py-descartes
…
py-dill
…
py-discover
…
py-dlcpar
…
py-docopt
…
py-docutils
…
py-doxypy
…
py-doxypypy
…
py-dryscrape
…
py-dxchange
…
py-dxfile
…
py-earthengine-api
Move new packages from tutorial to builtin (#12289)
2019-08-05 19:55:39 -05:00
py-easybuild-easyblocks
…
py-easybuild-easyconfigs
…
py-easybuild-framework
…
py-edffile
…
py-editdistance
…
py-elasticsearch
…
py-elephant
…
py-emcee
…
py-entrypoints
…
py-enum34
…
py-epydoc
…
py-espresso
…
py-espressopp
…
py-et-xmlfile
…
py-eventlet
…
py-execnet
…
py-exodus
new package: py-exodus (#12291)
2019-08-06 23:11:56 -05:00
py-fastaindex
…
py-fasteners
…
py-faststructure
…
py-filelock
…
py-fiona
Add py-fiona 1.8.6 (#11736)
2019-06-17 20:54:58 -04:00
py-fiscalyear
…
py-flake8
Add flake8 3.7.8 (#12141)
2019-07-26 12:11:07 -05:00
py-flake8-polyfill
…
py-flask
…
py-flask-compress
…
py-flask-socketio
…
py-flexx
…
py-flye
py-flye: change to build ARM. (#12176)
2019-08-02 19:15:49 -05:00
py-fn
…
py-fparser
…
py-freezegun
Add new package py-freezegun (#11718)
2019-06-16 08:41:27 +02:00
py-funcsigs
…
py-functools32
…
py-future
…
py-futures
…
py-fypp
…
py-gdbgui
…
py-gee-asset-manager
Add py-gee-asset-manager package (#12365)
2019-08-10 11:52:38 -05:00
py-geeadd
Add py-geeadd package (#12366)
2019-08-10 11:52:24 -05:00
py-geeup
Add py-geeup package (#12367)
2019-08-10 11:52:10 -05:00
py-genders
…
py-genshi
…
py-geopandas
Add py-geopandas 0.5.0 (#11737)
2019-06-16 08:57:13 +02:00
py-gevent
…
py-git2
…
py-git-review
…
py-gnuplot
…
py-goatools
…
py-google-api-core
Add py-google-api-core package (#12368)
2019-08-10 11:51:56 -05:00
py-google-api-python-client
Move new packages from tutorial to builtin (#12289)
2019-08-05 19:55:39 -05:00
py-google-auth
Move new packages from tutorial to builtin (#12289)
2019-08-05 19:55:39 -05:00
py-google-auth-httplib2
Move new packages from tutorial to builtin (#12289)
2019-08-05 19:55:39 -05:00
py-google-cloud-core
Add py-google-cloud-core package (#12369)
2019-08-10 11:51:41 -05:00
py-google-cloud-storage
Add py-google-cloud-storage package (#12370)
2019-08-10 11:51:27 -05:00
py-google-resumable-media
Add py-google-resumable-media package (#12371)
2019-08-10 11:51:12 -05:00
py-googleapis-common-protos
Add py-googleapis-common-protos package (#12372)
2019-08-10 11:50:58 -05:00
py-gpaw
…
py-graphviz
LBANN: add support for new python front end (#11395)
2019-05-15 06:20:00 +09:00
py-greenlet
…
py-griddataformats
…
py-guidata
Add SIPPackage base class (#12157)
2019-07-30 17:12:48 -05:00
py-guiqwt
…
py-h5glance
…
py-h5py
…
py-hdfs
…
py-hepdata-validator
…
py-hpccm
…
py-html2text
…
py-html5lib
…
py-htseq
py-htseq: new version (#11525)
2019-05-21 12:08:31 -05:00
py-httpbin
…
py-httplib2
Move new packages from tutorial to builtin (#12289)
2019-08-05 19:55:39 -05:00
py-hypothesis
…
py-idna
…
py-igraph
…
py-illumina-utils
…
py-imageio
…
py-imagesize
…
py-iminuit
…
py-importlib
…
py-invoke
…
py-ipaddress
…
py-ipdb
…
py-ipykernel
…
py-ipython
Fix some Mac constraint checks (#12138)
2019-07-29 15:05:02 -07:00
py-ipython-genutils
…
py-ipywidgets
…
py-isort
…
py-itsdangerous
…
py-jdcal
…
py-jedi
…
py-jinja2
…
py-jmespath
Add new package py-jmespath (#11719)
2019-06-16 08:42:35 +02:00
py-joblib
Add latest version of joblib (#11495)
2019-05-19 14:17:03 -05:00
py-jprops
…
py-jpype
…
py-jsonpatch
New packages: nrm and libnrm (#11777)
2019-06-20 19:21:44 -07:00
py-jsonpointer
New packages: nrm and libnrm (#11777)
2019-06-20 19:21:44 -07:00
py-jsonschema
Add py-jsonschema 2.6.0 (#12009)
2019-07-13 09:05:17 -05:00
py-junit-xml
…
py-jupyter-client
…
py-jupyter-console
…
py-jupyter-core
…
py-jupyter-notebook
…
py-jupyterhub
Rename py-dateutil -> py-python-dateutil (#11717)
2019-06-16 08:40:56 +02:00
py-keras
…
py-keras-applications
…
py-keras-preprocessing
…
py-kiwisolver
…
py-kmodes
Add py-kmodes package (#11497)
2019-05-19 14:17:30 -05:00
py-lark-parser
Added latest version, 0.7.1 (#11927)
2019-07-04 10:26:59 -04:00
py-latexcodec
…
py-lazy
…
py-lazy-object-proxy
…
py-lazy-property
…
py-lazyarray
…
py-libconf
…
py-libensemble
Update libensemble (#11990)
2019-07-12 10:36:44 -05:00
py-line-profiler
…
py-linecache2
…
py-lit
…
py-llvmlite
…
py-lmfit
…
py-localcider
…
py-locket
…
py-lockfile
…
py-logilab-common
…
py-lrudict
…
py-luigi
Rename py-dateutil -> py-python-dateutil (#11717)
2019-06-16 08:40:56 +02:00
py-lxml
…
py-lzstring
…
py-m2r
…
py-macholib
…
py-machotools
…
py-macs2
…
py-maestrowf
…
py-mako
…
py-markdown
py-markdown package: update dependency version range (#11908)
2019-07-01 17:52:41 -07:00
py-markupsafe
…
py-matplotlib
Fix py-matplotlib build with Intel compiler (#12144)
2019-08-11 12:57:31 -05:00
py-mccabe
…
py-mdanalysis
…
py-meep
Overhaul numpy package (#12170)
2019-08-06 18:20:23 -05:00
py-memory-profiler
…
py-merlin
…
py-metasv
py-metasv: new package at 0.5.4 (#11476)
2019-05-17 14:33:04 -05:00
py-methylcode
…
py-mg-rast-tools
…
py-misopy
…
py-mistune
…
py-mlxtend
py-mlxtend: new package at 0.16.0 (#12039)
2019-07-18 12:25:41 -05:00
py-mo-pack
New packages: libmo-unpack and py-mo-pack (#11895)
2019-07-01 18:24:45 -07:00
py-mock
…
py-modred
…
py-moltemplate
…
py-mongo
…
py-monotonic
…
py-monty
…
py-more-itertools
…
py-mpi4py
py-mpi4py: Added build argument for mpicc path (#12191)
2019-08-02 19:09:37 -05:00
py-mpmath
…
py-multiprocess
…
py-multiqc
…
py-munch
…
py-mx
…
py-mxnet
…
py-myhdl
…
py-mysql-connector
…
py-mysqldb1
…
py-natsort
…
py-nbconvert
…
py-nbformat
…
py-nc-time-axis
New package: py-nc-time-axis (#11898)
2019-07-01 18:07:57 -07:00
py-neo
…
py-nestle
…
py-netcdf4
py-netcdf4: depend on hdf5+hl (#11893)
2019-07-01 15:38:35 +02:00
py-netifaces
…
py-networkx
…
py-nose
…
py-nosexcover
…
py-numba
…
py-numexpr
py-numexpr: switch from PyPI to GitHub download (#12360)
2019-08-09 22:27:34 -05:00
py-numexpr3
…
py-numpy
Overhaul numpy package (#12170)
2019-08-06 18:20:23 -05:00
py-numpydoc
…
py-oauth2client
Add py-oauth2client package (#12373)
2019-08-10 11:50:43 -05:00
py-olefile
…
py-onnx
LBANN: add support for new python front end (#11395)
2019-05-15 06:20:00 +09:00
py-ont-fast5-api
…
py-openpmd-validator
Rename py-dateutil -> py-python-dateutil (#11717)
2019-06-16 08:40:56 +02:00
py-openpyxl
…
py-openslide-python
…
py-opentuner
…
py-ordereddict
…
py-oset
…
py-owslib
Rename py-dateutil -> py-python-dateutil (#11717)
2019-06-16 08:40:56 +02:00
py-packaging
…
py-palettable
…
py-pandas
Add pandas 0.25.0 (#12173)
2019-07-30 17:16:32 -05:00
py-paramiko
…
py-partd
…
py-pathlib
Add py-pathlib package (#12374)
2019-08-10 11:50:24 -05:00
py-pathlib2
…
py-pathos
…
py-pathspec
…
py-patsy
…
py-pauvre
…
py-pbr
…
py-pep8-naming
…
py-perf
…
py-performance
…
py-periodictable
…
py-petsc4py
…
py-pexpect
…
py-phonopy
…
py-pickleshare
…
py-picrust
…
py-pil
…
py-pillow
…
py-pint
…
py-pip
…
py-pipits
Add py-pipits 2.4 (#12074)
2019-07-30 17:10:57 -05:00
py-pispino
Add py-pipits 2.4 (#12074)
2019-07-30 17:10:57 -05:00
py-pkgconfig
…
py-plotly
…
py-pluggy
…
py-ply
…
py-pmw
…
py-poster
Port py-poster to Python 3 (#12363)
2019-08-10 11:53:15 -05:00
py-pox
…
py-ppft
…
py-prettytable
…
py-progress
…
py-progressbar2
New package: py-progressbar2 (#11421)
2019-05-15 10:49:28 +09:00
py-projectq
…
py-prometheus-client
…
py-prompt-toolkit
…
py-protobuf
LBANN: add support for new python front end (#11395)
2019-05-15 06:20:00 +09:00
py-psutil
…
py-psyclone
…
py-psycopg2
…
py-ptyprocess
…
py-pudb
…
py-py
…
py-py2bit
…
py-py2cairo
…
py-py2neo
…
py-py4j
…
py-pyani
…
py-pyarrow
…
py-pyasn1
Add py-pyasn1 0.4.6 (#12251)
2019-08-02 20:09:15 -05:00
py-pyasn1-modules
Move new packages from tutorial to builtin (#12289)
2019-08-05 19:55:39 -05:00
py-pybedtools
py-pybedtools: new package at 0.6.9 (#11475)
2019-05-17 14:32:21 -05:00
py-pybigwig
…
py-pybind11
pybind11: v2.3.0 (#11713)
2019-06-15 10:30:04 -05:00
py-pybtex
…
py-pybtex-docutils
…
py-pycairo
…
py-pycares
…
py-pychecker
…
py-pycodestyle
…
py-pycparser
…
py-pycrypto
…
py-pycurl
…
py-pydatalog
…
py-pydispatcher
…
py-pydot
…
py-pydv
Rename py-dateutil -> py-python-dateutil (#11717)
2019-06-16 08:40:56 +02:00
py-pyelftools
…
py-pyepsg
…
py-pyfaidx
…
py-pyfasta
…
py-pyfftw
…
py-pyflakes
…
py-pygdbmi
…
py-pygments
…
py-pygobject
glib: fix glib dependency build fixes #9992 (#12153)
2019-08-02 15:18:04 -05:00
py-pygpu
…
py-pygresql
…
py-pygtk
…
py-pyke
py-pyke: new package (#11894)
2019-07-02 15:58:14 -04:00
py-pylint
…
py-pymatgen
…
py-pyminifier
…
py-pymol
Add SIPPackage base class (#12157)
2019-07-30 17:12:48 -05:00
py-pympler
…
py-pymysql
…
py-pynio
…
py-pynn
…
py-pyodbc
…
py-pyomo
py-pyomo: new package at 5.6.6 (#12134)
2019-07-26 10:38:25 -05:00
py-pypar
…
py-pyparsing
…
py-pypeflow
…
py-pyperclip
Add py-pyperclip package (#12375)
2019-08-10 11:50:10 -05:00
py-pyprof2html
…
py-pyproj
Add py-pyproj 2.2.0 (#11735)
2019-06-17 20:23:40 -04:00
py-pyqi
…
py-pyqt4
Add SIPPackage base class (#12157)
2019-07-30 17:12:48 -05:00
py-pyqt5
py-pyqt5: add missing py-enum34 dependency (#12224)
2019-08-01 13:30:35 +02:00
py-pyrad
…
py-pyrosar
New package: py-pyrosar (#11428)
2019-05-15 10:53:30 +09:00
py-pysam
…
py-pyscaf
…
py-pyserial
…
py-pyshp
…
py-pyside
…
py-pysmartdl
Add py-pysmartdl package (#12376)
2019-08-10 11:49:55 -05:00
py-pysocks
…
py-pyspark
…
py-pysqlite
…
py-pytest
…
py-pytest-cov
…
py-pytest-flake8
…
py-pytest-httpbin
…
py-pytest-isort
New package: py-pytest-isort (#12160)
2019-07-29 14:02:06 -07:00
py-pytest-mock
…
py-pytest-runner
…
py-pytest-xdist
…
py-pythia
…
py-python-daemon
…
py-python-dateutil
py-python-dateutil: Version 2.7.0 acquired dependency on setuptools-scm (#11795)
2019-06-20 09:18:04 -05:00
py-python-engineio
…
py-python-gitlab
…
py-python-htmlgen
…
py-python-levenshtein
…
py-python-socketio
…
py-python-utils
New package: py-python-utils (#11422)
2019-05-15 10:47:28 +09:00
py-pythonqwt
Add SIPPackage base class (#12157)
2019-07-30 17:12:48 -05:00
py-pytz
…
py-pyugrid
py-pyugrid: unstructured grids in netcdf files (#11900)
2019-07-02 15:56:18 -04:00
py-pyutilib
…
py-pyvcf
…
py-pywavelets
…
py-pyyaml
…
py-qtawesome
…
py-qtconsole
…
py-qtpy
Add SIPPackage base class (#12157)
2019-07-30 17:12:48 -05:00
py-quantities
…
py-quast
…
py-queryablelist
…
py-radical-utils
…
py-ranger
…
py-rasterio
Add py-rasterio 1.0.24 (#11738)
2019-06-18 15:14:27 -04:00
py-readme-renderer
…
py-regex
…
py-reportlab
Set ignore files for py-reportlab (#11928)
2019-07-03 19:15:01 -07:00
py-requests
…
py-requests-futures
new package: py-requests-futures (#12264)
2019-08-03 18:36:42 -05:00
py-requests-toolbelt
…
py-restview
…
py-retrying
Add py-retrying package (#12377)
2019-08-10 11:49:41 -05:00
py-rope
…
py-rpy2
…
py-rsa
…
py-rseqc
…
py-rtree
…
py-s3transfer
Add new package py-s3transfer (#11721)
2019-06-16 08:43:41 +02:00
py-saga-python
…
py-scandir
…
py-scientificpython
…
py-scikit-image
py-scikit-image: include more dependencies (#11912)
2019-07-04 10:38:02 -04:00
py-scikit-learn
Add master version to sklearn (#12057)
2019-07-18 15:56:48 -05:00
py-scikit-optimize
…
py-scipy
py-scipy package: add version 1.3.0 (#12171)
2019-07-29 11:57:59 -07:00
py-scoop
New package: py-scoop (#11423)
2019-05-15 10:50:41 +09:00
py-seaborn
…
py-selenium
Add py-selenium package (#12378)
2019-08-10 11:49:25 -05:00
py-send2trash
…
py-setuptools
Add latest version of setuptools (#11493)
2019-05-19 14:16:37 -05:00
py-setuptools-git
…
py-setuptools-scm
…
py-sfepy
Rename py-pytables -> py-tables (#11847)
2019-06-25 21:32:49 -04:00
py-sh
…
py-shapely
Add py-shapely 1.6.4.post2 (#11739)
2019-06-18 14:24:56 -04:00
py-shiboken
…
py-simplegeneric
…
py-simplejson
…
py-singledispatch
…
py-sip
Add SIPPackage base class (#12157)
2019-07-30 17:12:48 -05:00
py-six
…
py-slepc4py
…
py-slurm-pipeline
…
py-sncosmo
…
py-snowballstemmer
…
py-snuggs
…
py-spatialist
New package: py-spatialist (#11427)
2019-05-15 10:52:31 +09:00
py-spectra
…
py-spefile
…
py-spglib
…
py-sphinx
…
py-sphinx-bootstrap-theme
…
py-sphinx-rtd-theme
…
py-sphinxautomodapi
…
py-sphinxcontrib-bibtex
…
py-sphinxcontrib-programoutput
…
py-sphinxcontrib-websupport
…
py-spyder
Add SIPPackage base class (#12157)
2019-07-30 17:12:48 -05:00
py-spykeutils
…
py-sqlalchemy
…
py-statsmodels
…
py-stevedore
…
py-storm
…
py-stratify
py-stratify: vertical interpolation/stratification of atmos/ocean data (#11911)
2019-07-04 10:38:48 -04:00
py-subprocess32
…
py-symengine
…
py-symfit
…
py-sympy
…
py-tables
Re-add py-cython dependency to py-tables (#12338)
2019-08-08 21:57:16 -05:00
py-tabulate
…
py-tappy
…
py-tblib
New package: py-tblib (#11425)
2019-05-15 10:51:37 +09:00
py-terminado
…
py-testinfra
…
py-tetoolkit
…
py-texttable
LBANN: add support for new python front end (#11395)
2019-05-15 06:20:00 +09:00
py-theano
…
py-tifffile
…
py-toml
…
py-tomopy
…
py-toolz
…
py-torch
PyTorch package: add version 1.1.0 (#12174)
2019-07-29 11:39:05 -07:00
py-torchvision
New package: py-torchvision (#12175)
2019-07-29 11:42:08 -07:00
py-tornado
…
py-tqdm
…
py-traceback2
…
py-traitlets
…
py-treehash
…
py-tuiview
Add SIPPackage base class (#12157)
2019-07-30 17:12:48 -05:00
py-twisted
…
py-typesentry
new python package/py-typesentry (#11657)
2019-06-11 14:33:43 -04:00
py-typing
Added setuptools to receipe (#11463)
2019-05-15 12:19:04 +02:00
py-typing-extensions
LBANN: add support for new python front end (#11395)
2019-05-15 06:20:00 +09:00
py-tzlocal
…
py-udunits
…
py-umi-tools
…
py-unicycler
…
py-unittest2
…
py-unittest2py3k
…
py-uritemplate
Move new packages from tutorial to builtin (#12289)
2019-08-05 19:55:39 -05:00
py-urllib3
…
py-urwid
…
py-usgs
new package: py-usgs (#12263)
2019-08-03 18:36:55 -05:00
py-vcversioner
…
py-virtualenv
…
py-virtualenv-clone
…
py-virtualenvwrapper
…
py-vsc-base
…
py-vsc-install
…
py-warlock
New packages: nrm and libnrm (#11777)
2019-06-20 19:21:44 -07:00
py-wcsaxes
…
py-wcwidth
…
py-webencodings
…
py-webkit-server
…
py-weblogo
…
py-werkzeug
…
py-whatshap
…
py-wheel
…
py-widgetsnbextension
…
py-wrapt
…
py-wxpython
Add py-wxpython package (#12163)
2019-07-30 17:13:32 -05:00
py-xarray
…
py-xattr
…
py-xdot
…
py-xenv
…
py-xlrd
…
py-xlsxwriter
…
py-xmlrunner
…
py-xopen
…
py-xpyb
…
py-xvfbwrapper
…
py-yamlreader
…
py-yapf
…
py-yt
…
py-ytopt
…
py-zmq
…
py-zope-event
…
py-zope-interface
…
pythia6
…
python
Fix QT4 build for mac (#10944)
2019-08-01 10:22:35 -07:00
qbank
…
qbox
…
qca
…
qhull
…
qjson
…
qmcpack
QMCPACK Update July 2019 (#12097)
2019-07-24 12:28:35 -05:00
qmd-progress
…
qorts
…
qrupdate
…
qt
Fix QT4 build for mac (#10944)
2019-08-01 10:22:35 -07:00
qt-creator
…
qtgraph
OpenSpeedShop/CBTF package updates and fixes (#11470)
2019-05-16 18:19:55 -07:00
qthreads
qthreads package: make hwloc dependency optional and add version 1.14 (#11780)
2019-06-28 11:43:06 -07:00
quantum-espresso
Quantum Espresso package: Specify F90 compiler (#12119)
2019-07-29 15:53:39 -07:00
quinoa
…
qwt
…
qwtpolar
new package: qwtpolar (#12382)
2019-08-11 12:39:58 -05:00
r
r: set FPICFLAGS for compilers except 'gcc' (#12033)
2019-07-16 11:56:34 -05:00
r3d
r3d: add version 2018-01-07 (#11770)
2019-06-18 09:36:49 -05:00
r-a4
…
r-a4base
…
r-a4classif
…
r-a4core
…
r-a4preproc
…
r-a4reporting
…
r-abadata
…
r-abaenrichment
…
r-abind
…
r-absseq
…
r-acde
…
r-acepack
…
r-acgh
…
r-acme
…
r-ada
…
r-adabag
…
r-ade4
…
r-adegenet
…
r-adsplit
…
r-aer
…
r-affxparser
…
r-affy
…
r-affycomp
…
r-affycompatible
…
r-affycontam
…
r-affycoretools
…
r-affydata
…
r-affyexpress
…
r-affyilm
…
r-affyio
…
r-affypdnn
…
r-affyplm
…
r-affyqcreport
…
r-affyrnadegradation
…
r-agdex
…
r-agilp
…
r-agimicrorna
…
r-aims
…
r-aldex2
…
r-allelicimbalance
…
r-alpine
…
r-als
…
r-alsace
…
r-altcdfenvs
…
r-amap
…
r-ampliqueso
…
r-analysispageserver
…
r-anaquin
…
r-aneufinder
…
r-aneufinderdata
…
r-animation
…
r-annaffy
…
r-annotate
…
r-annotationdbi
…
r-annotationfilter
…
r-annotationforge
…
r-annotationhub
…
r-ape
…
r-argparse
…
r-assertthat
…
r-backports
…
r-bamsignals
…
r-base64
…
r-base64enc
…
r-bayesm
…
r-bbmisc
…
r-beanplot
…
r-bfast
…
r-bfastspatial
…
r-bglr
r-bglr: new package at 1.0.8 (#11489)
2019-05-17 14:35:38 -05:00
r-bh
…
r-biasedurn
…
r-bibtex
…
r-bindr
…
r-bindrcpp
…
r-biobase
…
r-biocgenerics
r-biocgenerics: add 0.30.0 (#11935)
2019-07-08 11:59:54 -07:00
r-biocinstaller
…
r-biocparallel
…
r-biocstyle
…
r-biom-utils
…
r-biomart
…
r-biomformat
…
r-biostrings
…
r-biovizbase
…
r-bit
…
r-bit64
…
r-bitops
…
r-blob
…
r-blockmodeling
…
r-bookdown
…
r-boot
…
r-brew
…
r-broom
…
r-bsgenome
…
r-bumphunter
…
r-c50
…
r-cairo
…
r-callr
…
r-car
…
r-caret
…
r-caroline
r-caroline: new package at 0.7.6 (#11450)
2019-05-14 15:57:33 -05:00
r-category
…
r-catools
…
r-cdcfluview
…
r-cellranger
…
r-checkmate
…
r-checkpoint
…
r-chemometrics
…
r-chron
…
r-circlize
…
r-class
…
r-classint
…
r-cli
…
r-clipr
…
r-cluster
…
r-clustergeneration
…
r-clusterprofiler
…
r-cner
…
r-coda
…
r-codetools
…
r-coin
…
r-colorspace
…
r-combinat
…
r-commonmark
…
r-complexheatmap
…
r-compositions
…
r-construct
r-construct: new package at 1.0.3 (#11452)
2019-05-14 16:24:01 -05:00
r-convevol
…
r-corhmm
…
r-corpcor
…
r-corrplot
…
r-covr
…
r-cowplot
…
r-crayon
…
r-crosstalk
…
r-crul
r-crul: new package at 0.7.4 (#11459)
2019-05-15 15:51:11 -05:00
r-ctc
…
r-cubature
…
r-cubist
…
r-curl
r-curl: add 3.3 (#11456)
2019-05-15 15:47:45 -05:00
r-data-table
…
r-dbi
…
r-dbplyr
…
r-delayedarray
…
r-deldir
…
r-dendextend
…
r-deoptim
…
r-deoptimr
…
r-desc
…
r-deseq
…
r-deseq2
…
r-desolve
…
r-devtools
…
r-diagrammer
…
r-dicekriging
…
r-dichromat
…
r-diffusionmap
…
r-digest
…
r-diptest
…
r-dirichletmultinomial
…
r-dismo
…
r-diversitree
…
r-dnacopy
…
r-do-db
…
r-domc
…
r-doparallel
…
r-dorng
…
r-dose
…
r-downloader
…
r-dplyr
…
r-dt
…
r-dtw
…
r-dygraphs
…
r-dynamictreecut
…
r-e1071
…
r-edger
…
r-ellipse
…
r-emmli
r-emmli: new package (#11557)
2019-05-26 20:43:22 -05:00
r-energy
…
r-ensembldb
…
r-ergm
…
r-evaluate
…
r-expint
…
r-expm
…
r-factoextra
…
r-factominer
…
r-fansi
…
r-fastcluster
…
r-fastmatch
…
r-ff
…
r-fftwtools
…
r-fgsea
…
r-filehash
…
r-findpython
…
r-fit-models
…
r-flashclust
…
r-flexclust
…
r-flexmix
…
r-fnn
…
r-forcats
…
r-foreach
…
r-forecast
…
r-foreign
…
r-formatr
…
r-formula
…
r-fpc
…
r-fracdiff
…
r-futile-logger
…
r-futile-options
…
r-gamlss
…
r-gamlss-data
…
r-gamlss-dist
…
r-gbm
…
r-gcrma
…
r-gdalutils
…
r-gdata
…
r-gdsfmt
…
r-geiger
…
r-genefilter
…
r-genelendatabase
…
r-geneplotter
…
r-genie3
…
r-genomeinfodb
…
r-genomeinfodbdata
…
r-genomicalignments
…
r-genomicfeatures
…
r-genomicranges
…
r-gensa
…
r-geomorph
r-geomorph: new version (#11556)
2019-05-26 23:34:17 -05:00
r-geonames
r-geonames: new package at 0.999 (#11455)
2019-05-15 16:04:50 -05:00
r-geoquery
…
r-geor
…
r-geosphere
…
r-getopt
…
r-getoptlong
…
r-ggally
…
r-ggbio
…
r-ggdendro
…
r-ggjoy
…
r-ggmap
…
r-ggplot2
…
r-ggpubr
…
r-ggrepel
…
r-ggridges
…
r-ggsci
…
r-ggvis
…
r-gistr
…
r-git2r
…
r-glimma
…
r-glmnet
…
r-globaloptions
…
r-glue
…
r-gmodels
…
r-gmp
…
r-go-db
…
r-googlevis
…
r-goplot
…
r-gosemsim
…
r-goseq
…
r-gostats
…
r-gplots
…
r-graph
r-graph: update R constraint to reflect DESCRIPTION (#11934)
2019-07-08 12:01:17 -07:00
r-grbase
New package: r-grbase (starting at 1.8-3.4) (#11937)
2019-07-08 12:01:58 -07:00
r-gridbase
…
r-gridextra
…
r-gseabase
…
r-gss
…
r-gsubfn
…
r-gtable
…
r-gtools
…
r-gtrellis
…
r-gviz
…
r-gwmodel
New package: r-gwmodel (starting at 2.0-9) (#11887)
2019-07-01 18:14:29 -07:00
r-haven
…
r-hexbin
…
r-highr
…
r-hmisc
…
r-hms
…
r-hoardr
…
r-htmltable
…
r-htmltools
…
r-htmlwidgets
…
r-httpcode
r-httpcode: new package at 0.2.0 (#11454)
2019-05-15 15:50:32 -05:00
r-httpuv
…
r-httr
…
r-hwriter
…
r-hypergraph
…
r-ica
…
r-igraph
…
r-illuminaio
…
r-impute
…
r-influencer
…
r-inline
…
r-interactivedisplaybase
…
r-intervals
r-intervals: new package at 0.15.1 (#11884)
2019-06-28 19:42:55 -04:00
r-ipred
…
r-iranges
…
r-irdisplay
…
r-irkernel
…
r-irlba
…
r-isdparser
r-isdparser: new package at 0.3.0 (#11460)
2019-05-15 15:51:50 -05:00
r-iso
…
r-iterators
…
r-janitor
…
r-jaspar2018
…
r-jomo
…
r-jpeg
…
r-jsonlite
…
r-kegg-db
…
r-kegggraph
…
r-keggrest
…
r-kernlab
…
r-kernsmooth
…
r-kknn
…
r-knitr
…
r-ks
…
r-labeling
…
r-lambda-r
…
r-laplacesdemon
…
r-lars
…
r-lattice
…
r-latticeextra
…
r-lava
…
r-lazyeval
…
r-leaflet
…
r-leaps
…
r-learnbayes
…
r-lhs
…
r-limma
…
r-lme4
…
r-lmtest
…
r-locfit
…
r-log4r
…
r-loo
r-loo: new package at 2.1.0 (#11448)
2019-05-14 16:22:29 -05:00
r-lpsolve
…
r-lsei
…
r-lubridate
…
r-magic
…
r-magrittr
…
r-makecdfenv
…
r-maldiquant
…
r-manipulatewidget
…
r-mapproj
…
r-maps
…
r-maptools
…
r-markdown
…
r-mass
…
r-matr
…
r-matrix
…
r-matrixmodels
…
r-matrixstats
…
r-mclust
…
r-mcmcglmm
…
r-mco
…
r-mda
…
r-memoise
…
r-mergemaid
…
r-methodss3
…
r-mgcv
…
r-mgraster
…
r-mice
…
r-mime
…
r-minfi
…
r-miniui
…
r-minqa
…
r-misc3d
…
r-mitml
…
r-mixtools
…
r-mlbench
…
r-mlinterfaces
…
r-mlr
…
r-mlrmbo
…
r-mmwrweek
…
r-mnormt
…
r-modelmetrics
…
r-modelr
…
r-modeltools
…
r-mpm
…
r-msnbase
…
r-multcomp
…
r-multicool
…
r-multitaper
…
r-multtest
…
r-munsell
…
r-mvtnorm
…
r-mzid
…
r-mzr
…
r-nanotime
…
r-ncbit
…
r-ncdf4
…
r-network
…
r-networkd3
…
r-nleqslv
…
r-nlme
…
r-nloptr
…
r-nmf
…
r-nnet
…
r-nnls
…
r-nor1mix
…
r-nortest
…
r-np
…
r-numderiv
…
r-oligoclasses
…
r-oo
…
r-openssl
…
r-optparse
…
r-org-hs-eg-db
…
r-organismdbi
…
r-packrat
…
r-pacman
…
r-paleotree
…
r-pamr
…
r-pan
…
r-parallelmap
…
r-paramhelpers
…
r-party
…
r-partykit
…
r-pathview
…
r-pbapply
…
r-pbdzmq
…
r-pbkrtest
…
r-pcamethods
…
r-pcapp
…
r-permute
…
r-pfam-db
…
r-phangorn
…
r-phantompeakqualtools
…
r-phyloseq
…
r-phylostratr
r-phylostratr: new package (#11053)
2019-05-15 16:03:36 -05:00
r-phytools
…
r-picante
…
r-pillar
…
r-pkgbuild
…
r-pkgconfig
…
r-pkgload
…
r-pkgmaker
…
r-plogr
…
r-plot3d
…
r-plotly
…
r-plotrix
…
r-pls
…
r-plyr
…
r-pmcmr
…
r-png
…
r-popgenome
…
r-popvar
r-popvar: new package at 1.2.1 (#11490)
2019-05-17 14:45:21 -05:00
r-powerlaw
…
r-prabclus
…
r-praise
…
r-preprocesscore
…
r-prettyunits
…
r-processx
…
r-prodlim
…
r-progress
…
r-protgenerics
…
r-proto
…
r-proxy
…
r-pryr
…
r-ps
…
r-psych
…
r-ptw
…
r-purrr
…
r-qtl
r-qtl: new package at 1.44-9 (#11487)
2019-05-17 14:33:42 -05:00
r-quadprog
…
r-quantmod
…
r-quantreg
…
r-quantro
…
r-qvalue
…
r-r6
…
r-randomfields
…
r-randomfieldsutils
…
r-randomforest
…
r-randomglm
r-randomglm: new package at 1.02-1 (#11589)
2019-05-30 13:35:01 -05:00
r-ranger
…
r-rappdirs
…
r-raster
…
r-rbgl
r-rbgl: add 1.60.0 (#11936)
2019-07-08 12:00:16 -07:00
r-rbokeh
…
r-rcolorbrewer
…
r-rcpp
…
r-rcpparmadillo
…
r-rcppblaze
…
r-rcppcctz
…
r-rcppcnpy
…
r-rcppeigen
…
r-rcppprogress
…
r-rcurl
…
r-rda
…
r-readr
…
r-readxl
…
r-registry
…
r-rematch
…
r-reordercluster
…
r-reportingtools
…
r-repr
…
r-reprex
…
r-reshape
…
r-reshape2
…
r-rex
…
r-rgdal
r-rgdal does not yet support PROJ.6 (#11766)
2019-06-17 23:47:52 -04:00
r-rgenoud
…
r-rgeos
…
r-rgl
…
r-rgooglemaps
…
r-rgraphviz
…
r-rhdf5
…
r-rhmmer
…
r-rhtslib
…
r-rinside
…
r-rjags
…
r-rjava
…
r-rjson
…
r-rjsonio
…
r-rlang
…
r-rmarkdown
…
r-rminer
…
r-rmpfr
…
r-rmpi
…
r-rmysql
r-rmysql: add 0.10.17, mariadb-connector-c dependency (#11044)
2019-05-15 15:58:15 -05:00
r-rngtools
…
r-rnoaa
r-rnoaa: new package at 0.8.4 (#11461)
2019-05-15 15:52:17 -05:00
r-robust
…
r-robustbase
…
r-rocr
…
r-rodbc
…
r-rots
…
r-roxygen2
…
r-rpart
…
r-rpart-plot
…
r-rpostgresql
…
r-rprojroot
…
r-rrblup
r-rrblup: new package at 4.6 (#11488)
2019-05-17 14:34:33 -05:00
r-rrcov
…
r-rrpp
…
r-rsamtools
…
r-rsnns
…
r-rsolnp
…
r-rsqlite
…
r-rstan
r-rstan: add 2.18.2 (#11447)
2019-05-14 16:23:14 -05:00
r-rstantools
r-rstantools: new package at 1.5.1 (#11451)
2019-05-14 15:57:54 -05:00
r-rstudioapi
…
r-rtracklayer
…
r-rtsne
…
r-runit
…
r-rvcheck
…
r-rvest
…
r-rzmq
…
r-s4vectors
…
r-samr
…
r-sandwich
…
r-scales
…
r-scatterplot3d
…
r-sdmtools
…
r-segmented
…
r-selectr
…
r-seqinr
…
r-seqlogo
…
r-seurat
…
r-sf
r-sf may not support PROJ.6 (#11767)
2019-06-23 11:35:33 -05:00
r-sfsmisc
…
r-shape
…
r-shiny
…
r-shinydashboard
…
r-shortread
…
r-siggenes
…
r-simpleaffy
…
r-sm
…
r-smoof
…
r-sn
…
r-snow
…
r-snowfall
…
r-snprelate
…
r-som
…
r-somaticsignatures
…
r-sourcetools
…
r-sp
…
r-spacetime
r-spacetime: new package at 1.2-2 (#11885)
2019-07-01 13:39:15 -04:00
r-sparsem
…
r-spatial
…
r-spatialreg
New package: r-spatialreg (starting at 1.1-3) (#11886)
2019-07-01 18:13:06 -07:00
r-spdata
New package: r-spdata (starting at version 0.3.0) (#11883)
2019-07-01 18:11:16 -07:00
r-spdep
…
r-speedglm
…
r-spem
…
r-splancs
…
r-splitstackshape
…
r-sqldf
…
r-squash
…
r-sseq
…
r-stanheaders
r-stanheaders: add 2.18.1 (#11446)
2019-05-14 15:18:03 -05:00
r-statmod
…
r-statnet-common
…
r-stringi
…
r-stringr
…
r-strucchange
…
r-subplex
…
r-summarizedexperiment
…
r-survey
…
r-survival
…
r-sva
…
r-tarifx
…
r-taxizedb
r-taxizedb: new package at 0.1.4 (#11052)
2019-05-15 16:02:54 -05:00
r-tclust
…
r-tensora
…
r-testit
…
r-testthat
…
r-tfbstools
…
r-tfmpvalue
…
r-th-data
…
r-threejs
…
r-tibble
…
r-tidycensus
…
r-tidyr
…
r-tidyselect
…
r-tidyverse
…
r-tiff
Change dependencies to use virtual jpeg package (#12179)
2019-07-29 12:08:55 -05:00
r-tigris
…
r-timedate
…
r-tmixclust
…
r-topgo
…
r-triebeard
r-triebeard: new package at 0.3.0 (#11457)
2019-05-15 15:48:17 -05:00
r-trimcluster
…
r-truncnorm
…
r-trust
…
r-tseries
…
r-tsne
…
r-ttr
…
r-udunits2
…
r-units
…
r-urltools
r-urltools: new package at 1.7.3 (#11458)
2019-05-15 15:48:54 -05:00
r-utf8
…
r-utils
…
r-uuid
…
r-variantannotation
…
r-varselrf
…
r-vcd
…
r-vegan
…
r-vfs
…
r-vgam
…
r-vipor
…
r-viridis
…
r-viridislite
…
r-visnetwork
…
r-vsn
…
r-webshot
…
r-wgcna
…
r-whisker
…
r-withr
r-withr: add 2.1.2 (#11445)
2019-05-14 15:17:25 -05:00
r-xde
…
r-xgboost
…
r-xlconnect
…
r-xlconnectjars
…
r-xlsx
…
r-xlsxjars
…
r-xmapbridge
…
r-xml
…
r-xml2
…
r-xnomial
…
r-xtable
…
r-xts
…
r-xvector
…
r-yaml
…
r-yapsa
…
r-yaqcaffy
…
r-yarn
…
r-zlibbioc
…
r-zoo
…
racon
…
raft
…
ragel
…
raja
Fix CMake versions dependencies in RAJA package (#11440)
2019-05-16 13:54:52 +02:00
randfold
…
random123
…
randrproto
…
range-v3
Resolves #11487. (#12136)
2019-08-02 19:19:39 -05:00
rankstr
…
rapidjson
rapidjson: Don't add -march=native on ARM and gcc 5.x or before. (#12117)
2019-07-24 12:30:32 -05:00
ravel
…
raxml
raxml: compile n non-x86 hosts. (#12208)
2019-08-02 19:04:25 -05:00
ray
…
rclone
Ensure proper gopath set for rclone (#11755)
2019-06-18 10:49:07 -07:00
rdma-core
…
rdp-classifier
…
rdptools
Add py-pipits 2.4 (#12074)
2019-07-30 17:10:57 -05:00
re2c
…
readfq
…
readline
…
recon
recon: new package at 1.08 (#11408)
2019-05-15 15:55:10 -05:00
recordproto
…
redis
…
redset
…
redundans
…
regcm
…
relax
…
relion
added relion 3.0.7 - removed deprecated versions (#12101)
2019-07-23 18:13:00 -05:00
rempi
…
rename
…
rendercheck
…
renderproto
…
repeatmasker
repeatmasker: perl and HMMER dependency fixes (#11660)
2019-06-18 11:11:00 -07:00
repeatmodeler
repeatmodeler: new package at 1.0.11 (#11472)
2019-05-17 14:31:26 -05:00
repeatscout
repeatscout: new package at 1.0.5 (#11409)
2019-05-15 16:04:17 -05:00
resourceproto
…
revbayes
Revbayes update (#11559)
2019-05-30 13:23:32 -04:00
rgb
…
rhash
…
rlwrap
…
rmats
…
rmlab
…
rna-seqc
…
rngstreams
…
rocksdb
rocksdb: Don't add -march=native on ARM and gcc 5.x or before. (#12108)
2019-07-23 22:33:05 -05:00
rockstar
…
rodinia
New package: Rodinia (starting at 3.1) (#11650)
2019-06-24 18:32:46 -07:00
root
Buildcache relocate.py error fix (#11616)
2019-06-04 14:39:04 -05:00
rose
ROSE: add version 0.9.10.0, update to Autotools, add variants (#9484)
2019-05-29 12:00:50 -07:00
ross
…
routino
…
rpcsvc-proto
…
rr
…
rsbench
…
rsem
…
rstart
…
rsync
…
rtags
…
rtax
…
ruby
…
ruby-gnuplot
…
ruby-narray
…
ruby-ronn
…
ruby-rubyinline
…
ruby-svn2git
…
ruby-terminal-table
…
rust
…
rust-bindgen
…
sabre
…
saga-gis
Add py-wxpython package (#12163)
2019-07-30 17:13:32 -05:00
sailfish
…
salmon
…
sambamba
…
samblaster
…
samrai
packages: computation.llnl.gov is now computing.llnl.gov (#12013)
2019-07-15 07:32:51 -07:00
samtools
…
sandbox
…
sas
…
satsuma2
…
savanna
…
saws
…
sbt
…
scala
…
scalasca
update scalasca to latest version, simplify recipe (#11999)
2019-07-12 10:30:07 -05:00
scallop
…
scalpel
…
scan-for-matches
…
scons
scons: add version 3.1.0 (#12084)
2019-07-22 17:35:40 -05:00
scorec-core
…
scorep
Add new releases of Cube Tools, Opari2, OTF2, and Score-P (#12303)
2019-08-08 22:44:33 -05:00
scotch
…
scr
packages: computation.llnl.gov is now computing.llnl.gov (#12013)
2019-07-15 07:32:51 -07:00
screen
…
scripts
…
scrnsaverproto
…
sctk
…
sdl2
sdl2: fix dependency for libxext and build on ARM (#12351)
2019-08-09 10:24:16 -05:00
sdl2-image
…
sdsl-lite
…
seacas
…
sed
…
sentieon-genomics
…
seqan
…
seqkit
Add py-pipits 2.4 (#12074)
2019-07-30 17:10:57 -05:00
seqprep
…
seqtk
…
serf
…
sessreg
…
setxkbmap
…
sga
…
shapeit
…
shared-mime-info
…
shiny-server
…
shocklibs
…
shoremap
…
shortbred
…
shortstack
…
showfont
…
shuffile
…
sickle
…
siesta
…
signalp
…
signify
…
silo
…
simgrid
…
simplemoc
…
simul
…
simulationio
SimulationIO package: add version 9.0.1 (#12079)
2019-07-29 15:40:57 -07:00
singularity
singularity: update version to 3.3.0 (#12295)
2019-08-12 15:38:15 -05:00
singularity-legacy
…
sirius
CP2K/SIRIUS: add support for building with CUDA, fix CP2K build with MKL (#11418)
2019-08-13 19:59:08 +02:00
skilion-onedrive
…
skopeo
packages/skopeo (#12348)
2019-08-12 11:28:05 -05:00
sl
New Package: sl (#11565)
2019-05-26 20:40:55 -05:00
slate
…
sleef
…
slepc
slepc: update python dependencies to be in sync with petsc (#12250)
2019-08-02 20:07:29 -05:00
slurm
…
smalt
…
smof
smof: new package at 2.13.1 (#11502)
2019-05-17 14:44:35 -05:00
smproxy
…
snakemake
…
snap
…
snap-berkeley
…
snap-korf
…
snappy
…
snbone
…
sniffles
…
snpeff
…
snphylo
…
snptest
…
soap2
…
soapdenovo2
…
soapdenovo-trans
…
soapindel
…
soapsnp
…
sofa-c
…
somatic-sniper
…
sortmerna
…
sosflow
…
sowing
…
sox
lame & libmad: Added two new packages for sox mp3 support. (#11964)
2019-07-25 10:40:50 -05:00
spades
…
span-lite
Update optional-lite and span-lite to use CMakePackage (#11407)
2019-05-20 13:04:06 -05:00
spark
…
sparsehash
…
sparta
…
spdlog
…
spectrum-mpi
…
speex
…
spglib
…
sph2pipe
…
spherepack
…
spindle
packages: computation.llnl.gov is now computing.llnl.gov (#12013)
2019-07-15 07:32:51 -07:00
spm
…
spot
…
sqlite
…
sqlitebrowser
…
squashfs
…
squid
…
sra-toolkit
…
ssht
…
sspace-longread
…
sspace-standard
…
sst-core
…
sst-dumpi
…
sst-macro
…
stacks
…
staden-io-lib
…
star
…
star-ccm-plus
…
startup-notification
…
stat
…
stata
…
stc
swift-t: New release packages for 1.4.3 (#11684)
2019-06-14 09:49:51 -05:00
steps
…
stow
…
strace
…
stream
…
strelka
…
stress
…
string-view-lite
Update optional-lite and span-lite to use CMakePackage (#11407)
2019-05-20 13:04:06 -05:00
stringtie
…
structure
…
strumpack
…
sublime-text
…
subread
subread: add 1.6.4 (#11800)
2019-06-20 13:54:20 -05:00
subversion
…
suite-sparse
fix suite-sparse built with tbb from intel-parallel-studio (#11134)
2019-05-15 11:03:19 -07:00
sumaclust
…
sundials
packages: computation.llnl.gov is now computing.llnl.gov (#12013)
2019-07-15 07:32:51 -07:00
superlu
…
superlu-dist
…
superlu-mt
…
supernova
…
sw4lite
…
swap-assembler
…
swarm
…
swfft
…
swiftsim
…
swig
Update SWIG versions and add Fortran fork (#12185)
2019-08-11 12:58:12 -05:00
symengine
symengine: add 0.4.0, fix dependency in dealii (#11473)
2019-05-16 12:23:21 +02:00
sympol
…
sz
…
tabix
…
talass
…
talloc
…
tantan
…
tar
…
targetp
…
task
…
taskd
…
tasmanian
…
tassel
…
tau
Fixed arch setting variants. Activate cray arch automatically. (#11203)
2019-08-02 15:14:43 -05:00
tcl
added tix package and python variant for tix (#11599)
2019-06-06 17:19:24 -04:00
tcl-itcl
…
tcl-tcllib
…
tcl-tclxml
…
tclap
…
tcoffee
…
tcptrace
…
tcsh
tcsh: change the download url, add version 6.21.00 (#11836)
2019-06-27 12:53:43 -04:00
tealeaf
tealeaf: Don't add -march=native on ARM and gcc 5.x or before. (#12080)
2019-07-22 13:03:43 -05:00
templight
…
templight-tools
…
tetgen
…
tethex
…
texinfo
…
texlive
…
texstudio
New package: TexStudio (#12301)
2019-08-12 14:48:28 -05:00
tfel
…
the-platinum-searcher
…
the-silver-searcher
…
thornado-mini
…
thrift
…
thrust
…
tig
…
time
…
tinyxml
…
tinyxml2
…
tioga
…
tippecanoe
newpackage/tippecanoe (#12319)
2019-08-09 10:18:26 -05:00
tix
added tix package and python variant for tix (#11599)
2019-06-06 17:19:24 -04:00
tk
Add variants for tk package (#11956)
2019-07-11 22:21:17 -05:00
tldd
…
tmalign
…
tmhmm
…
tmux
…
tmuxinator
…
tophat
…
tppred
…
tracer
…
transabyss
…
transdecoder
…
transposome
…
transset
…
trapproto
…
tree
…
treesub
…
trf
…
triangle
…
trilinos
Generalize STK package settings in Trilinos (#11917)
2019-08-07 16:11:15 -05:00
trilinos-catalyst-ioss-adapter
…
trimal
…
trimgalore
…
trimmomatic
…
trinity
…
trinotate
…
trnascan-se
…
turbine
turbine: Better auto-detection of R location (#11711)
2019-07-03 11:24:20 -07:00
turbomole
…
tut
…
twm
…
tycho2
…
typhon
…
typhonio
…
uberftp
…
ucx
Add UCX 1.6.0 (#12089)
2019-07-22 21:43:35 -05:00
udunits2
…
ufo-core
…
ufo-filters
…
umap
new package: umap (#12000)
2019-07-12 15:26:24 -05:00
umpire
Update Umpire package with new versions (#11441)
2019-05-18 23:04:12 -05:00
unblur
…
uncrustify
…
unibilium
…
unifycr
…
unison
…
units
…
unittest-cpp
Add support for new unittest-cpp package (#11575)
2019-05-28 15:21:24 -05:00
unixodbc
…
unuran
…
unzip
unzip: fix build for cray back-end
2019-07-31 20:44:40 -07:00
usearch
…
util-linux
…
util-macros
…
uuid
…
uvw
…
valgrind
valgrind: added version 3.15.0 (#12239)
2019-08-02 15:10:37 +02:00
vampirtrace
…
vardictjava
…
varscan
…
vc
…
vcftools
…
vcsh
…
vdt
vdt: add simd variant (#12188)
2019-08-02 19:10:39 -05:00
vecgeom
…
veclibfort
Overhaul numpy package (#12170)
2019-08-06 18:20:23 -05:00
vegas2
…
veloc
…
velvet
velvet: remove -m64 on aarch64. (#11984)
2019-07-11 21:59:24 -05:00
verilator
…
verrou
…
videoproto
…
viennarna
…
viewres
…
vigra
Change dependencies to use virtual jpeg package (#12179)
2019-07-29 12:08:55 -05:00
vim
…
virtualgl
Change dependencies to use virtual jpeg package (#12179)
2019-07-29 12:08:55 -05:00
visit
…
vizglow
…
vmatch
…
voropp
…
votca-csg
…
votca-ctp
…
votca-tools
…
votca-xtp
…
vpfft
…
vpic
…
vsearch
…
vt
…
vtk
Change dependencies to use virtual jpeg package (#12179)
2019-07-29 12:08:55 -05:00
vtkh
…
vtkm
vtkm: fix the directory cmake looks for the source code (#11576)
2019-05-29 11:10:12 -04:00
wannier90
…
warpx
Resources: use expanded archive name by default (#11688)
2019-06-20 11:09:31 -07:00
wcslib
…
wget
…
wgsim
…
windowswmproto
…
wireshark
…
wordnet
…
workrave
…
wt
…
wtdbg2
…
wxpropgrid
Add py-wxpython package (#12163)
2019-07-30 17:13:32 -05:00
wxwidgets
Add py-wxpython package (#12163)
2019-07-30 17:13:32 -05:00
x11perf
…
xapian-core
…
xauth
…
xbacklight
…
xbiff
…
xbitmaps
…
xbraid
packages: computation.llnl.gov is now computing.llnl.gov (#12013)
2019-07-15 07:32:51 -07:00
xcalc
…
xcb-demo
…
xcb-proto
…
xcb-util
…
xcb-util-cursor
…
xcb-util-errors
…
xcb-util-image
…
xcb-util-keysyms
…
xcb-util-renderutil
…
xcb-util-wm
…
xcb-util-xrm
…
xclip
…
xclipboard
…
xclock
…
xcmiscproto
…
xcmsdb
…
xcompmgr
…
xconsole
…
xcursor-themes
…
xcursorgen
…
xdbedizzy
…
xditview
…
xdm
…
xdpyinfo
…
xdriinfo
…
xedit
…
xerces-c
…
xeus
…
xev
…
xextproto
…
xeyes
…
xf86bigfontproto
…
xf86dga
…
xf86dgaproto
…
xf86driproto
…
xf86miscproto
…
xf86rushproto
…
xf86vidmodeproto
…
xfd
xfd package: use Spack-installed libintl (#11545)
2019-06-19 10:54:50 -07:00
xfindproxy
…
xfontsel
…
xfs
…
xfsinfo
…
xfwp
…
xgamma
…
xgboost
…
xgc
…
xhmm
…
xhost
…
xineramaproto
…
xinit
…
xinput
…
xios
…
xkbcomp
…
xkbdata
…
xkbevd
…
xkbprint
…
xkbutils
…
xkeyboard-config
…
xkill
…
xload
…
xlogo
…
xlsatoms
…
xlsclients
…
xlsfonts
…
xmag
…
xman
…
xmessage
…
xmh
…
xmlf90
…
xmlto
…
xmodmap
…
xmore
…
xorg-cf-files
…
xorg-docs
…
xorg-gtest
…
xorg-server
…
xorg-sgml-doctools
…
xphelloworld
…
xplor-nih
…
xplsprinters
…
xpr
…
xprehashprinterlist
…
xprop
…
xproto
…
xproxymanagementprotocol
…
xqilla
…
xrandr
…
xrdb
…
xrefresh
…
xrootd
Xrootd: set PYTHON_EXECUTABLE with +python variant (#11581)
2019-05-29 15:41:30 -05:00
xrx
…
xsbench
…
xscope
…
xsd
…
xsdk
xsdk: phist has a conflict with gcc version <= gcc-4.9.1 (#11946)
2019-07-25 14:01:00 -05:00
xsdktrilinos
…
xset
…
xsetmode
…
xsetpointer
…
xsetroot
…
xsimd
xtensor package: add version 0.20.7 and update dependencies (#11574)
2019-06-18 17:05:47 -07:00
xsm
…
xstdcmap
…
xtensor
xtensor package: add version 0.20.7 and update dependencies (#11574)
2019-06-18 17:05:47 -07:00
xtensor-python
xtensor package: add version 0.20.7 and update dependencies (#11574)
2019-06-18 17:05:47 -07:00
xterm
…
xtl
xtensor package: add version 0.20.7 and update dependencies (#11574)
2019-06-18 17:05:47 -07:00
xtrans
…
xtrap
…
xts
…
xvidtune
…
xvinfo
…
xwd
…
xwininfo
…
xwud
…
xxhash
…
xz
…
yajl
…
yambo
…
yaml-cpp
Make yaml-cpp build with libc++ (#10504)
2019-06-26 14:29:09 -07:00
yara
…
yasm
…
yorick
…
z3
…
zeromq
zeromq package: choose URL based on version; add versions (#12149)
2019-07-29 14:36:33 -07:00
zfp
packages: computation.llnl.gov is now computing.llnl.gov (#12013)
2019-07-15 07:32:51 -07:00
zip
…
zlib
…
zoltan
zoltan: use autotools for new architecture host (#11924)
2019-07-08 16:57:17 -07:00
zsh
…
zstd
…