zhangyiss/spack
1
0
Fork 0
Code Issues Pull Requests Actions Packages Projects Releases Wiki Activity
Files
cb64e3229639fc777f39e0c32a95e995dc0f5c4b
spack/var/spack/repos/builtin/packages
History
snehring cb64e32296 gcta: new package (#7425)
2018-03-07 15:40:51 -08:00
..
abinit
…
abyss
abyss: added missing libtool dependency (#7054)
2018-01-31 14:01:49 +01:00
accfft
accfft: added new package (#7213)
2018-02-23 23:29:12 +01:00
ack
…
activeharmony
…
adept-utils
…
adios
…
adios2
ADIOS 2.1.0 (#7240)
2018-02-14 13:54:13 -08:00
adlbx
…
adol-c
…
albert
…
alglib
…
allinea-forge
…
allinea-reports
…
allpaths-lg
…
alquimia
…
alsa-lib
…
amg
…
amg2013
…
amp
…
ampliconnoise
…
amrex
…
andi
…
angsd
angsd: new version, and conflict for newer htslib with old version (#7122)
2018-02-05 18:33:12 +01:00
ant
…
antlr
…
ape
…
apex
…
applewmproto
…
appres
…
apr
…
apr-util
…
archer
…
argp-standalone
…
argtable
…
arlecore
…
armadillo
…
arpack-ng
Changed keyword argument 'recurse' to 'recursive'
2018-02-13 02:18:28 -08:00
ascent
updates to conduit and ascent packages (#7040)
2018-02-12 10:20:46 -08:00
asciidoc
…
aspa
…
aspcud
aspcud@1.9.4: new package (#7094)
2018-02-27 13:16:40 +01:00
aspell
…
aspell6-de
…
aspell6-en
…
aspell6-es
…
assimp
…
astra
…
astral
…
astyle
…
atk
…
atlas
Changed keyword argument 'recurse' to 'recursive'
2018-02-13 02:18:28 -08:00
atom-dft
…
atompaw
…
atop
…
augustus
Augustus update hash (#7286)
2018-02-19 22:06:40 -08:00
autoconf
…
autodock-vina
…
autogen
…
automaded
…
automake
…
bamtools
…
bamutil
…
barrnap
…
bash
…
bash-completion
…
bats
…
bazel
…
bbcp
…
bbmap
…
bcftools
…
bcl2fastq2
…
bdftopcf
…
bdw-gc
…
bear
…
beast2
…
bedtools2
…
beforelight
…
benchmark
…
berkeley-db
…
bertini
…
bib2xhtml
…
bigreqsproto
…
binutils
…
bioawk
…
biopieces
…
bison
…
bitmap
…
blast-plus
…
blat
…
blaze
…
bliss
…
blitz
…
bmake
bmake@20171207: new package (#7099)
2018-01-31 13:42:41 +01:00
bml
bml: enable MPI by default (#7324)
2018-02-22 09:04:49 -07:00
bohrium
…
boost
…
boostmplcartesianproduct
…
bowtie
…
bowtie2
bowtie2: Add version 2.3.4.1 (#7252)
2018-03-06 18:48:48 +01:00
boxlib
…
bpp-core
…
bpp-phyl
…
bpp-seq
…
bpp-suite
…
bracken
bracken: Create new package (#7375)
2018-03-05 14:16:27 +01:00
braker
braker: added list_url (#7058)
2018-03-06 08:51:43 +01:00
branson
branson: needs mpi-2 (#7319)
2018-02-26 06:35:47 -07:00
breakdancer
…
breseq
…
brigand
…
bsseeker2
…
bucky
…
busco
…
butter
…
bwa
…
byobu
…
bzip2
change recurse into recursive in a few places (#7342)
2018-02-28 20:15:26 +01:00
c-blosc
…
caffe
…
cairo
…
caliper
…
callpath
…
candle-benchmarks
ECP-CANDLE benchmark script (#7271)
2018-02-22 09:54:46 -08:00
cantera
…
canu
…
cap3
…
cares
…
cask
…
casper
…
catalyst
…
catch
…
cbench
cbench set its environment using setup_environment (#7236)
2018-02-21 06:42:51 +01:00
cblas
…
cbtf
OpenSpeedShop package: add support for building on cray (#7338)
2018-03-07 14:26:07 -08:00
cbtf-argonavis
OpenSpeedShop package: add support for building on cray (#7338)
2018-03-07 14:26:07 -08:00
cbtf-argonavis-gui
OpenSpeedShop package: add support for building on cray (#7338)
2018-03-07 14:26:07 -08:00
cbtf-krell
OpenSpeedShop package: add support for building on cray (#7338)
2018-03-07 14:26:07 -08:00
cbtf-lanl
OpenSpeedShop package: add support for building on cray (#7338)
2018-03-07 14:26:07 -08:00
ccache
…
cctools
…
cdbfasta
…
cdd
…
cddlib
…
cdhit
…
cdo
Package 'cdo': new versions. (#7250)
2018-02-16 13:39:56 +01:00
cereal
…
cfitsio
…
cgal
…
cgm
…
cgns
…
charm
…
check
…
chlorop
…
chombo
…
cityhash
…
clamr
clamr: needs cmake-3.1 (#7297)
2018-02-21 09:11:50 -08:00
cleaveland4
…
cleverleaf
…
clfft
…
clhep
…
clingo
clingo@5.2.2: new package (#7091)
2018-02-03 10:05:06 +01:00
cloc
…
cloog
…
cloverleaf
…
cloverleaf3d
…
clustalo
…
clustalw
…
cmake
…
cmocka
…
cmor
Add cmor version 3.3.0 (#7197)
2018-03-06 18:16:52 +01:00
cnmem
…
cnpy
LBANN OS X (#7105)
2018-01-31 09:38:53 -08:00
cntk
…
cntk1bitsgd
…
codar-cheetah
…
coevp
…
cohmm
cohmm: use more sane defaults (#7296)
2018-02-21 15:03:53 -07:00
coinhsl
…
colordiff
Colordiff: new package (#7070)
2018-03-06 13:14:29 +01:00
comd
comd: more sane default (#7046)
2018-02-08 12:36:23 -05:00
compiz
…
compositeproto
…
conduit
update for conduit 0.3.1 release (#7344)
2018-03-05 11:04:21 +01:00
constype
…
converge
…
coreutils
…
corset
…
cosmomc
…
cosp2
…
cp2k
…
cppad
…
cppcheck
…
cpprestsdk
…
cppunit
…
cppzmq
…
cpu-features
cpu_features (#7302)
2018-02-26 20:47:22 +01:00
cram
…
cryptopp
…
cscope
…
csdp
…
ctffind
…
cub
…
cube
…
cuda
…
cuda-memtest
…
cudnn
…
cufflinks
…
cups
…
curl
Add the libssh2 variant for curl. (#6980)
2018-03-06 18:41:22 +01:00
cvs
…
czmq
…
dakota
…
daligner
…
damageproto
…
damselfly
…
darshan-runtime
…
darshan-util
…
dash
…
datamash
…
dataspaces
…
dbus
…
dealii
…
dejagnu
…
delly2
…
denovogear
…
dia
…
dialign-tx
…
diamond
…
diffsplice
new package: diffsplice (#7187)
2018-02-09 20:15:58 -08:00
direnv
…
discovar
…
discovardenovo
…
dlpack
…
dmlc-core
…
dmxproto
…
docbook-xml
…
docbook-xsl
…
dos2unix
…
double-conversion
…
doxygen
…
dri2proto
…
dri3proto
…
dtcmp
…
dyninst
…
ea-utils
…
easybuild
…
ebms
ebms: needs mpi-2 (#7320)
2018-02-26 06:35:34 -07:00
eccodes
…
ecp-proxy-apps
…
editres
…
eigen
…
elemental
Changed keyword argument 'recurse' to 'recursive'
2018-02-13 02:18:28 -08:00
elfutils
OpenSpeedShop package: add support for building on cray (#7338)
2018-03-07 14:26:07 -08:00
elk
…
elpa
Changed keyword argument 'recurse' to 'recursive'
2018-02-13 02:18:28 -08:00
emacs
…
emboss
…
encodings
…
environment-modules
…
es
…
esmf
…
espresso
yambo: added new package (#7301)
2018-02-22 12:11:51 +01:00
essl
…
ethminer
…
etsf-io
…
everytrace
…
everytrace-example
…
evieext
…
exabayes
…
examinimd
examinimd: fix a typo (#7352)
2018-02-28 10:02:33 -07:00
exampm
…
exasp2
exasp2: add v1.0 (#7398)
2018-03-06 09:01:53 +01:00
exmcutils
…
exodusii
…
exonerate
…
expat
…
expect
…
express
…
extrae
…
exuberant-ctags
…
f90cache
…
falcon
…
farmhash
…
fastjar
…
fastmath
…
fastme
…
fastphase
…
fastq-screen
…
fastqc
…
fastqvalidator
…
fasttree
…
fastx-toolkit
…
fenics
…
ferret
…
ffmpeg
…
fftw
change recurse into recursive in a few places (#7342)
2018-02-28 20:15:26 +01:00
fimpute
…
findutils
…
fio
…
fish
Update fish url for fish 2.7.1 (#7089)
2018-02-04 09:05:44 +01:00
fixesproto
…
flac
…
flang
…
flann
…
flash
…
flecsale
…
flecsi
…
flex
…
flint
…
flit
…
fltk
…
flux
…
fluxbox
fluxbox lightweight window manager (#7169)
2018-02-12 19:35:18 +01:00
fmt
fmt: add version (#7415)
2018-03-07 13:59:20 +01:00
foam-extend
…
folly
…
font-adobe-75dpi
…
font-adobe-100dpi
…
font-adobe-utopia-75dpi
…
font-adobe-utopia-100dpi
…
font-adobe-utopia-type1
…
font-alias
…
font-arabic-misc
…
font-bh-75dpi
…
font-bh-100dpi
…
font-bh-lucidatypewriter-75dpi
…
font-bh-lucidatypewriter-100dpi
…
font-bh-ttf
…
font-bh-type1
…
font-bitstream-75dpi
…
font-bitstream-100dpi
…
font-bitstream-speedo
…
font-bitstream-type1
…
font-cronyx-cyrillic
…
font-cursor-misc
…
font-daewoo-misc
…
font-dec-misc
…
font-ibm-type1
…
font-isas-misc
…
font-jis-misc
…
font-micro-misc
…
font-misc-cyrillic
…
font-misc-ethiopic
…
font-misc-meltho
…
font-misc-misc
…
font-mutt-misc
…
font-schumacher-misc
…
font-screen-cyrillic
…
font-sony-misc
…
font-sun-misc
…
font-util
…
font-winitzki-cyrillic
…
font-xfree86-type1
…
fontcacheproto
…
fontconfig
…
fontsproto
…
fonttosfnt
…
fpc
…
fr-hit
fr-hit: Create new package (#7132)
2018-01-31 19:28:48 +01:00
freebayes
…
freetype
…
fseq
…
fsl
…
fslsfonts
…
fstobdf
…
funhpc
…
gapbs
…
gapcloser
…
gapfiller
…
gasnet
…
gatk
…
gaussian
…
gawk
…
gblocks
…
gcc
gcc: add version 7.3.0 (#7097)
2018-01-31 13:41:12 +01:00
gccmakedep
…
gccxml
…
gconf
…
gcta
gcta: new package (#7425)
2018-03-07 15:40:51 -08:00
gdal
macOS Fix for GDAL (#7155)
2018-02-03 10:06:35 +01:00
gdb
help gdb pick up python3 (#7104)
2018-02-28 23:13:06 -08:00
gdbm
gdbm: fix lmod global name 'spack_cc' undefined (#7225)
2018-02-14 08:41:50 +01:00
gdk-pixbuf
…
geant4
…
gearshifft
…
gemmlowp
…
genemark-et
…
genometools
…
geos
Update package.py (#7327)
2018-03-06 18:28:02 +01:00
gettext
…
gflags
…
ghostscript
…
ghostscript-fonts
…
giflib
…
git
…
git-imerge
git-imerge@1.1.0: new package (#7203)
2018-02-09 19:48:11 +01:00
git-lfs
…
gl2ps
…
glew
…
glfmultiples
new package: Glfmultiples (#7055)
2018-02-12 19:35:57 -08:00
glib
…
glimmer
glimmer: Create new package (#7208)
2018-02-11 22:22:34 +01:00
glm
…
global
…
globalarrays
…
globus-toolkit
…
glog
…
glpk
…
glproto
…
gmake
…
gmap-gsnap
updating package: gmap-gsnap (#7285)
2018-02-19 22:09:05 -08:00
gmime
…
gmp
…
gmsh
…
gnat
…
gnu-prolog
…
gnupg
…
gnuplot
…
gnutls
…
go
…
go-bootstrap
…
gobject-introspection
…
googletest
…
gotcha
…
gource
…
gperf
…
gperftools
…
grackle
grackle package: add float option (#7196)
2018-02-12 14:32:24 -08:00
gradle
…
grandr
…
graphlib
…
graphmap
…
graphviz
…
grib-api
…
groff
…
gromacs
gromacs: add v2018 (#7050)
2018-03-06 18:37:45 +01:00
gsl
…
gslib
…
gtkorvo-atl
…
gtkorvo-cercs-env
…
gtkorvo-dill
…
gtkorvo-enet
…
gtkplus
…
gts
…
guidance
…
guile
…
h5hut
…
h5part
…
h5utils
…
h5z-zfp
hdf5: fixing ~/+ fortran builds; updated to version 0.8.0 (#7260)
2018-02-19 22:13:13 -08:00
hacckernels
…
hadoop
…
hapcut2
…
haploview
…
harfbuzz
…
harminv
…
hdf
…
hdf5
adds patches required to build hdf5 1.8.10 (#7386)
2018-03-06 12:49:36 -08:00
hdf5-blosc
…
help2man
…
hepmc
…
heppdt
…
highfive
highfive: Update to version 1.5 (#7041)
2018-02-03 10:22:03 +01:00
highwayhash
…
hiop
new package: hiop (#7039)
2018-03-01 15:26:28 -08:00
hisat2
…
hmmer
…
hoomd-blue
…
hpccg
…
hpctoolkit
…
hpctoolkit-externals
…
hpgmg
hpgmg: more sane defaults for a proxy (#7330)
2018-02-26 06:35:17 -07:00
hpl
…
hpx
…
hpx5
…
hsakmt
…
hstr
…
htop
…
htslib
…
httpie
…
hub
…
hunspell
…
hwloc
…
hybpiper
…
hydra
…
hypre
hypre: add libs method (#7234)
2018-02-14 09:21:13 +01:00
i3
…
ibmisc
…
iceauth
…
icedtea
…
icet
…
ico
…
icu4c
…
id3lib
…
idba
…
igraph
…
igv
…
igvtools
new package: igvtools (#6974)
2018-02-15 16:27:46 -08:00
ilmbase
…
image-magick
…
imake
…
impute2
…
infernal
…
inputproto
…
intel
…
intel-daal
…
intel-gpu-tools
…
intel-ipp
…
intel-mkl
mkl: fix order of libs (#7280)
2018-02-21 19:14:34 +01:00
intel-mkl-dnn
…
intel-mpi
Changed keyword argument 'recurse' to 'recursive'
2018-02-13 02:18:28 -08:00
intel-parallel-studio
change recurse into recursive in a few places (#7342)
2018-02-28 20:15:26 +01:00
intel-tbb
…
intltool
…
ior
…
iozone
…
ipopt
ipopt: fix lmod global name 'prefix' undefined bug (#7224)
2018-02-14 08:40:47 +01:00
isaac
…
isaac-server
…
isl
…
itstool
…
itsx
…
jags
…
jansson
…
jasper
…
jbigkit
…
jdk
…
jellyfish
…
jemalloc
…
jmol
…
jq
…
json-c
…
json-cwx
…
json-glib
…
jsoncpp
…
judy
…
julia
…
kahip
…
kaks-calculator
…
kaldi
…
kallisto
…
kbproto
…
kdiff3
…
kealib
…
kentutils
…
kmergenie
…
kokkos
…
kraken
…
krims
…
kripke
…
kvasir-mpl
…
laghos
…
lammps
lammps: add version 20180222 (#7408)
2018-03-07 06:32:06 +01:00
last
…
latte
…
launchmon
…
lazyten
…
lbann
LBANN OS X (#7105)
2018-01-31 09:38:53 -08:00
lbxproxy
…
lcals
…
lcms
…
ldc
…
ldc-bootstrap
…
legion
…
leveldb
…
lftp
…
libaec
…
libaio
…
libapplewm
…
libarchive
libarchive@3.3.2: new version (#7113)
2018-01-31 13:39:58 +01:00
libassuan
…
libatomic-ops
…
libbeagle
…
libbsd
…
libbson
…
libcanberra
…
libcap
…
libcerf
…
libcheck
Fixed Theano GPU support (#7325)
2018-02-22 09:45:37 -08:00
libcint
…
libcircle
…
libconfig
…
libcroco
A new package: libcroco. (#7154)
2018-02-03 10:07:02 +01:00
libctl
…
libdivsufsort
…
libdmx
…
libdrm
…
libdwarf
libdwarf: fix linking, fix build on Darwin (#7124)
2018-01-31 16:12:25 -08:00
libedit
…
libelf
…
libemos
…
libepoxy
…
libev
…
libevent
…
libevpath
…
libfabric
Added v1.4.2 to libfabric package (#7053)
2018-01-31 14:02:21 +01:00
libffi
…
libffs
…
libfontenc
…
libfs
…
libgcrypt
…
libgd
…
libgit2
…
libgpg-error
…
libgpuarray
Fixed Theano GPU support (#7325)
2018-02-22 09:45:37 -08:00
libgridxc
…
libgtextutils
…
libharu
…
libhio
…
libice
…
libiconv
…
libint
…
libjpeg
…
libjpeg-turbo
…
libksba
…
liblbxutil
…
libmatheval
…
libmesh
…
libmng
…
libmongoc
…
libmonitor
…
libnbc
…
libogg
…
liboldx
…
libpcap
…
libpciaccess
…
libpfm4
…
libpipeline
…
libpng
…
libpsl
…
libpthread-stubs
…
libquo
…
libsigsegv
…
libsm
…
libsodium
…
libspatialindex
…
libsplash
libSplash 1.7.0: Root Fix (#7368)
2018-03-06 09:38:40 +01:00
libssh2
…
libsvm
…
libszip
…
libtermkey
…
libtiff
…
libtool
libtool: symlink correctly on darwin (#7179)
2018-02-14 13:52:44 -08:00
libunistring
…
libunwind
…
libuuid
…
libuv
…
libvorbis
…
libvterm
…
libwebsockets
…
libwindowswm
…
libx11
…
libxau
…
libxaw
…
libxaw3d
…
libxc
Changed keyword argument 'recurse' to 'recursive'
2018-02-13 02:18:28 -08:00
libxcb
…
libxcomposite
…
libxcursor
…
libxdamage
…
libxdmcp
…
libxevie
…
libxext
…
libxfixes
…
libxfont
…
libxfont2
…
libxfontcache
…
libxft
…
libxi
…
libxinerama
…
libxkbcommon
…
libxkbfile
…
libxkbui
…
libxml2
…
libxmu
…
libxp
…
libxpm
…
libxpresent
…
libxprintapputil
…
libxprintutil
…
libxrandr
…
libxrender
…
libxres
…
libxscrnsaver
…
libxshmfence
…
libxslt
…
libxsmm
change recurse into recursive in a few places (#7342)
2018-02-28 20:15:26 +01:00
libxstream
…
libxt
…
libxtrap
…
libxtst
…
libxv
…
libxvmc
…
libxxf86dga
…
libxxf86misc
…
libxxf86vm
…
libyogrt
…
libzip
…
likwid
likwid: Fix build (#7244)
2018-03-06 18:07:37 +01:00
linkphase3
…
linux-headers
…
listres
…
llvm
llvm package: update python dependency (#7100)
2018-02-26 10:33:40 -08:00
llvm-openmp-ompt
OpenSpeedShop package: add support for building on cray (#7338)
2018-03-07 14:26:07 -08:00
lmdb
…
lmod
…
lndir
…
log4cplus
…
log4cxx
Fix apr pick up of log4cxx (#7347)
2018-03-06 18:08:51 +01:00
lrslib
…
lrzip
…
lua
…
lua-bitlib
…
lua-jit
…
lua-lpeg
…
lua-luafilesystem
…
lua-luaposix
…
lua-mpack
…
luit
…
lulesh
…
lumpy-sv
…
lwgrp
…
lwm2
…
lz4
lz4 platform=darwin: fix dylib name (#7112)
2018-01-31 16:12:44 -08:00
lzma
…
lzo
…
m4
…
macsio
…
mad-numdiff
…
mafft
…
magics
…
magma
…
makedepend
…
mallocmc
…
man-db
…
maq
maq: Create new package. (#7133)
2018-01-31 13:12:43 +01:00
mariadb
…
masa
…
masurca
…
matio
…
matlab
…
maven
…
maverick
…
mawk
…
mbedtls
…
mcl
…
mdtest
…
meep
…
mefit
…
memaxes
…
meme
…
meraculous
…
mercurial
…
mesa
…
mesa-glu
…
meshkit
…
meson
…
mesquite
…
metaphysicl
…
metasv
…
metis
Fix for building METIS 4.0.3 with '~shared'. (#7202)
2018-02-13 02:22:25 -08:00
mfem
mfem: have hypre link line also link lapack+blas (#7165)
2018-02-15 14:59:07 +01:00
microbiomeutil
…
minced
…
miniaero
…
miniamr
…
miniconda2
…
miniconda3
…
minife
…
minighost
minighost: rework link logic (#7402)
2018-03-06 15:51:12 -07:00
minigmg
…
minimap2
…
minimd
…
miniqmc
…
minisign
…
minismac2d
minismac2d: fix build with external Debian MPI (#7318)
2018-03-05 16:07:41 -07:00
minitri
…
minixyce
…
mira
…
mirdeep
…
mitofates
…
mitos
…
mkfontdir
…
mkfontscale
…
mlhka
…
moab
…
molcas
…
mono
…
mosh
mosh build depends on pkg-config (#7365)
2018-03-06 09:34:00 +01:00
mothur
…
motif
…
motioncor2
…
mozjs
…
mpark-variant
MPark.Variant (#7251)
2018-02-27 13:15:59 +01:00
mpc
…
mpe2
…
mpest
…
mpfr
…
mpibash
…
mpiblast
…
mpich
mpich@develop: needs git submodules (#7357)
2018-02-28 19:48:57 -06:00
mpifileutils
…
mpileaks
…
mpip
…
mpir
…
mpix-launch-swift
…
mrbayes
…
mrnet
OpenSpeedShop package: add support for building on cray (#7338)
2018-03-07 14:26:07 -08:00
mrtrix3
…
msgpack-c
…
mshadow
…
multitail
…
multiverso
…
mummer
…
mumps
mumps: add the libs property (#7264)
2018-03-06 18:05:58 +01:00
munge
…
muparser
…
muscle
…
muse
…
muster
…
mvapich2
filter_compiler_path: added the possibility to narrow search path
2018-02-13 02:18:28 -08:00
mxml
…
mxnet
…
nag
…
nalu
nalu package: update dependency (#7245)
2018-02-22 14:14:39 -08:00
namd
…
nano
…
nanoflann
…
nasm
…
nauty
…
ncbi-rmblastn
…
nccl
…
nccmp
…
ncdu
…
ncftp
…
ncl
…
nco
…
ncurses
Changed keyword argument 'recurse' to 'recursive'
2018-02-13 02:18:28 -08:00
ncview
…
ndiff
…
nek5000
Update Nek5000 package to Version 17 (#7178)
2018-02-03 17:05:14 -06:00
nekbone
…
nekcem
…
neovim
…
netcdf
…
netcdf-cxx
change recurse into recursive in a few places (#7342)
2018-02-28 20:15:26 +01:00
netcdf-cxx4
change recurse into recursive in a few places (#7342)
2018-02-28 20:15:26 +01:00
netcdf-fortran
Changed keyword argument 'recurse' to 'recursive'
2018-02-13 02:18:28 -08:00
netgauge
…
netgen
…
netlib-lapack
Changed keyword argument 'recurse' to 'recursive'
2018-02-13 02:18:28 -08:00
netlib-scalapack
netlib-scalapack: add the libs property (#7265)
2018-02-18 10:19:03 +01:00
netlib-xblas
change recurse into recursive in a few places (#7342)
2018-02-28 20:15:26 +01:00
nettle
…
neuron
Make neuron package more generic (#7393)
2018-03-06 16:31:28 +01:00
nextflow
…
nfft
…
nghttp2
…
nginx
…
ngmlr
…
ninja
…
ninja-fortran
…
nlopt
…
nmap
…
nnvm
…
node-js
…
notmuch
…
npb
…
npm
…
npth
…
nspr
…
numactl
…
numdiff
…
nut
nut: needs cmake-3.0 (#7298)
2018-02-21 09:10:14 -08:00
nwchem
…
ocaml
ocaml@4.06.0: new version (#7078)
2018-01-31 13:49:17 +01:00
oce
…
oclint
oclint: new package (#7076)
2018-02-06 06:35:17 +01:00
oclock
…
octave
…
octave-optim
…
octave-splines
…
octave-struct
…
octopus
…
of-adios-write
…
ompss
…
ompt-openmp
…
oniguruma
…
ont-albacore
…
opa-psm2
…
opam
opam: new package (#7079)
2018-01-31 13:44:09 +01:00
opari2
…
openbabel
…
openblas
…
opencoarrays
…
opencv
change recurse into recursive in a few places (#7342)
2018-02-28 20:15:26 +01:00
openexr
…
openfast
…
openfoam-com
…
openfoam-org
…
openfst
…
opengl
…
openjpeg
…
openmc
…
openmpi
openmpi: add package-specific 'headers' property (#7267)
2018-03-05 12:53:36 -07:00
opennurbs
…
openscenegraph
…
openspeedshop
OpenSpeedShop package: add support for building on cray (#7338)
2018-03-07 14:26:07 -08:00
openssh
…
openssl
…
opium
…
opus
…
orfm
…
orthofinder
orthofinder: Create new package. (#7364)
2018-03-07 20:45:45 +01:00
orthomcl
…
osu-micro-benchmarks
Added osu-micro-benchmarks@5.4 (#7149)
2018-01-31 16:10:14 -08:00
otf
…
otf2
…
p4est
…
p7zip
…
pacbio-daligner
…
pacbio-damasker
…
pacbio-dazz-db
…
pacbio-dextractor
…
pagit
…
pagmo
…
paml
…
panda
…
pandaseq
…
pango
…
papi
…
paradiseo
…
parallel
…
parallel-netcdf
…
paraver
…
paraview
…
parmetis
…
parmgridgen
…
parsimonator
…
parsplice
…
partitionfinder
…
patch
…
patchelf
…
pathfinder
…
pax-utils
…
pbmpi
…
pcma
…
pcre
…
pcre2
…
pdsh
…
pdt
…
pegtl
…
pennant
…
percept
…
perl
…
perl-algorithm-diff
…
perl-app-cmd
…
perl-array-utils
…
perl-b-hooks-endofscope
…
perl-bio-perl
…
perl-bit-vector
…
perl-capture-tiny
…
perl-carp-clan
…
perl-class-data-inheritable
…
perl-class-inspector
…
perl-class-load
…
perl-class-load-xs
…
perl-cpan-meta-check
…
perl-data-optlist
…
perl-data-stag
…
perl-dbd-mysql
…
perl-dbfile
…
perl-dbi
…
perl-devel-cycle
…
perl-devel-globaldestruction
…
perl-devel-overloadinfo
…
perl-devel-stacktrace
…
perl-digest-md5
…
perl-dist-checkconflicts
…
perl-encode-locale
…
perl-eval-closure
…
perl-exception-class
…
perl-exporter-tiny
new package: perl-exporter-tiny (#7030)
2018-02-02 10:28:45 -08:00
perl-extutils-depends
perl-extutils-depends: Create new package (#7376)
2018-03-05 21:32:22 +01:00
perl-extutils-makemaker
…
perl-extutils-pkgconfig
…
perl-file-copy-recursive
…
perl-file-listing
…
perl-file-pushd
…
perl-file-sharedir-install
…
perl-file-slurp-tiny
…
perl-file-slurper
perl-file-slurper: Create new package (#7378)
2018-03-06 09:28:37 +01:00
perl-file-which
…
perl-font-ttf
…
perl-gd
…
perl-gd-graph
…
perl-gd-text
…
perl-graph
…
perl-graph-readwrite
perl-graph-readwrite: Create new package (#7284)
2018-03-06 18:12:06 +01:00
perl-html-parser
…
perl-html-tagset
…
perl-http-cookies
…
perl-http-daemon
…
perl-http-date
…
perl-http-message
…
perl-http-negotiate
…
perl-inline
…
perl-inline-c
…
perl-intervaltree
…
perl-io-html
…
perl-io-sessiondata
…
perl-io-socket-ssl
…
perl-io-string
…
perl-list-moreutils
…
perl-log-log4perl
…
perl-lwp
…
perl-lwp-mediatypes
…
perl-lwp-protocol-https
…
perl-math-cdf
…
perl-module-build
…
perl-module-runtime-conflicts
…
perl-moose
…
perl-mozilla-ca
…
perl-mro-compat
…
perl-namespace-clean
…
perl-net-http
…
perl-net-scp-expect
perl-net-scp-expect: Create new package (#7028)
2018-03-06 18:39:13 +01:00
perl-net-ssleay
…
perl-package-deprecationmanager
…
perl-package-stash
…
perl-package-stash-xs
…
perl-padwalker
…
perl-parallel-forkmanager
new package: perl-parallel-forkmanager (#7049)
2018-03-01 12:37:16 -08:00
perl-params-util
…
perl-parse-recdescent
…
perl-pdf-api2
…
perl-pegex
…
perl-perlio-gzip
…
perl-soap-lite
…
perl-star-fusion
…
perl-statistics-descriptive
…
perl-sub-exporter
…
perl-sub-exporter-progressive
…
perl-sub-identify
…
perl-sub-install
…
perl-sub-name
…
perl-sub-uplevel
…
perl-svg
…
perl-swissknife
…
perl-task-weaken
…
perl-term-readkey
…
perl-test-cleannamespaces
…
perl-test-deep
…
perl-test-differences
…
perl-test-exception
…
perl-test-fatal
…
perl-test-memory-cycle
…
perl-test-most
…
perl-test-needs
…
perl-test-requires
…
perl-test-requiresinternet
…
perl-test-warn
…
perl-test-warnings
…
perl-text-csv
perl-text-csv: Create new package (#7258)
2018-02-19 22:13:50 -08:00
perl-text-diff
…
perl-text-unidecode
…
perl-time-hires
…
perl-time-piece
…
perl-try-tiny
…
perl-uri
…
perl-uri-escape
…
perl-version
…
perl-www-robotrules
…
perl-xml-libxml
…
perl-xml-parser
…
perl-xml-parser-lite
…
perl-xml-simple
…
perl-yaml-libyaml
…
petsc
petsc: use spack-built python for configure (#7176)
2018-02-09 13:11:03 -08:00
pexsi
…
pfft
…
pflotran
…
pfunit
…
pgdspider
…
pgi
…
phantompeakqualtools
…
phasta
…
phylip
…
picard
…
pidx
…
pigz
…
pilon
new package: pilon (#7033)
2018-02-15 16:23:59 -08:00
piranha
…
pixman
…
pkg-config
Fix pkgconf on Crays (#7171)
2018-03-05 12:08:11 -08:00
pkgconf
Setup dependent environment for pkgconf. (#7102)
2018-03-06 18:25:00 +01:00
planck-likelihood
…
plasma
…
plink
…
plumed
…
pmgr-collective
…
pmix
pmix: add 2.1.0 and more (#7191)
2018-02-14 16:26:49 -08:00
pnfft
…
pngwriter
PNGwriter: 0.7.0 (#7026)
2018-01-31 14:34:52 +01:00
pnmpi
pnmpi@1.7: new package (#7051)
2018-03-06 18:48:28 +01:00
poamsa
…
pocl
…
polymake
…
porta
…
portage
…
postgresql
add new version (10.2) (#7272)
2018-02-17 07:27:26 +01:00
ppl
…
prank
…
presentproto
…
preseq
…
price
…
primer3
…
printproto
…
probconsrna
…
prodigal
…
proj
…
protobuf
Protobuf fix (#7110)
2018-01-31 09:39:53 -08:00
proxymngr
…
pruners-ninja
…
ps-lite
…
psi4
…
pstreams
…
pugixml
…
pumi
…
pvm
…
py-3to2
…
py-4suite-xml
…
py-abipy
…
py-adios
…
py-affine
py-rasterio: Added with dependencies. (#7156)
2018-03-06 18:21:34 +01:00
py-alabaster
…
py-apache-libcloud
…
py-apipkg
…
py-appdirs
…
py-appnope
…
py-apscheduler
…
py-argcomplete
…
py-argparse
…
py-ase
py-gpaw package with variants for MPI, FFTW and ScaLAPACK (#7373)
2018-03-07 09:30:47 +01:00
py-asn1crypto
…
py-astroid
…
py-astropy
…
py-attrs
…
py-autopep8
…
py-babel
…
py-backports-abc
…
py-backports-functools-lru-cache
fix url finding of lru-cache (#7118)
2018-02-23 07:41:14 -06:00
py-backports-shutil-get-terminal-size
…
py-backports-ssl-match-hostname
…
py-basemap
…
py-beautifulsoup4
…
py-binwalk
…
py-biom-format
…
py-biopython
…
py-bitarray
Efficient array of booleans, C extension (#7135)
2018-02-01 18:48:32 +00:00
py-bitstring
py-bitstring: Create new package (#7190)
2018-03-06 13:04:16 +01:00
py-bleach
…
py-blessings
…
py-bokeh
…
py-boltons
…
py-bottleneck
…
py-brian
…
py-brian2
…
py-bsddb3
Fix version-specific URLs for Python packages (#7394)
2018-03-05 12:00:49 -08:00
py-bx-python
…
py-cclib
…
py-cdat-lite
…
py-cdo
…
py-certifi
…
py-cffi
…
py-chardet
…
py-checkm-genome
py-checkm-genome: Create new package (#7200)
2018-02-09 19:37:16 +01:00
py-click
…
py-cligj
py-rasterio: Added with dependencies. (#7156)
2018-03-06 18:21:34 +01:00
py-cogent
…
py-colorama
…
py-colormath
…
py-configparser
…
py-counter
…
py-coverage
…
py-cpuinfo
…
py-crossmap
py-crossmap: adding new package (#7108)
2018-03-06 18:27:03 +01:00
py-cryptography
…
py-csvkit
…
py-current
…
py-cutadapt
…
py-cycler
…
py-cython
…
py-dask
…
py-dateutil
…
py-dbf
…
py-decorator
…
py-deeptools
…
py-dendropy
…
py-dev
…
py-dill
…
py-dlcpar
…
py-docutils
…
py-doxypy
…
py-doxypypy
…
py-dryscrape
…
py-dxchange
…
py-dxfile
…
py-easybuild-easyblocks
…
py-easybuild-easyconfigs
…
py-easybuild-framework
…
py-edffile
…
py-editdistance
…
py-elasticsearch
…
py-elephant
…
py-emcee
…
py-entrypoints
…
py-enum34
…
py-epydoc
…
py-espresso
…
py-espressopp
…
py-et-xmlfile
…
py-execnet
…
py-fastaindex
…
py-fasteners
…
py-faststructure
…
py-fiscalyear
…
py-flake8
…
py-flask
…
py-flexx
…
py-fparser
…
py-funcsigs
…
py-functools32
…
py-future
…
py-futures
…
py-genders
…
py-genshi
…
py-git2
…
py-git-review
…
py-gnuplot
…
py-goatools
new package: py-goatools (#7328)
2018-02-28 17:41:22 -08:00
py-gpaw
py-gpaw package with variants for MPI, FFTW and ScaLAPACK (#7373)
2018-03-07 09:30:47 +01:00
py-griddataformats
…
py-guidata
…
py-guiqwt
…
py-h5py
…
py-html2text
…
py-html5lib
…
py-htseq
…
py-httpbin
…
py-hypothesis
…
py-idna
…
py-igraph
…
py-imagesize
…
py-iminuit
…
py-importlib
…
py-ipaddress
…
py-ipdb
…
py-ipykernel
…
py-ipython
…
py-ipython-genutils
…
py-ipywidgets
…
py-isort
…
py-itsdangerous
…
py-jdcal
…
py-jedi
…
py-jinja2
…
py-joblib
…
py-jpype
…
py-jsonschema
…
py-junit-xml
…
py-jupyter-client
…
py-jupyter-console
…
py-jupyter-core
…
py-jupyter-notebook
…
py-keras
…
py-latexcodec
…
py-lazy
…
py-lazy-object-proxy
…
py-lazyarray
…
py-libconf
…
py-libensemble
…
py-line-profiler
…
py-linecache2
…
py-lit
…
py-llvmlite
…
py-lmfit
…
py-localcider
py-localcider: Create new package (#7189)
2018-02-06 13:52:37 +01:00
py-lockfile
…
py-logilab-common
…
py-lrudict
…
py-lxml
…
py-lzstring
…
py-macholib
…
py-machotools
…
py-macs2
…
py-maestrowf
maestrowf: new package (#7300)
2018-02-22 16:01:18 -08:00
py-mako
…
py-mappy
…
py-markdown
…
py-markupsafe
…
py-matplotlib
…
py-mccabe
…
py-mdanalysis
…
py-meep
…
py-memory-profiler
…
py-methylcode
…
py-misopy
…
py-mistune
…
py-mock
…
py-moltemplate
…
py-mongo
…
py-monotonic
…
py-monty
…
py-mpi4py
…
py-mpmath
…
py-multiprocess
…
py-multiqc
…
py-mx
…
py-mxnet
…
py-myhdl
…
py-mysqldb1
…
py-nbconvert
…
py-nbformat
…
py-neo
…
py-nestle
…
py-netcdf4
…
py-netifaces
…
py-networkx
…
py-nose
…
py-nosexcover
…
py-numba
…
py-numexpr
…
py-numpy
…
py-numpydoc
…
py-olefile
…
py-ont-fast5-api
…
py-openpmd-validator
openPMD-validator (#7064)
2018-01-31 13:59:38 +01:00
py-openpyxl
…
py-ordereddict
…
py-oset
…
py-packaging
…
py-palettable
…
py-pandas
…
py-paramiko
…
py-pathlib2
…
py-pathos
…
py-pathspec
…
py-patsy
…
py-pbr
Added virtualenvwrapper python package (#7270)
2018-02-22 09:47:05 -08:00
py-periodictable
…
py-petsc4py
…
py-pexpect
…
py-phonopy
…
py-pickleshare
…
py-pil
…
py-pillow
…
py-pip
…
py-pipits
…
py-pkgconfig
…
py-plotly
…
py-ply
…
py-pmw
…
py-pox
…
py-ppft
…
py-prettytable
…
py-proj
…
py-prompt-toolkit
…
py-protobuf
…
py-psutil
…
py-psyclone
…
py-ptyprocess
…
py-pudb
…
py-py
…
py-py2bit
…
py-py2cairo
…
py-py2neo
…
py-py4j
…
py-pyani
…
py-pyasn1
…
py-pybedtools
py-pybedtools: adding older version 0.6.9 (#7107)
2018-02-14 08:46:10 +01:00
py-pybigwig
…
py-pybind11
pybind11: 2.2.[1,2] & develop (#7216)
2018-02-11 18:00:22 +01:00
py-pybtex
…
py-pybtex-docutils
…
py-pychecker
…
py-pycodestyle
…
py-pycparser
…
py-pycrypto
…
py-pycurl
…
py-pydatalog
…
py-pydispatcher
…
py-pydot
…
py-pyelftools
…
py-pyfasta
Fix version-specific URLs for Python packages (#7394)
2018-03-05 12:00:49 -08:00
py-pyfftw
…
py-pyflakes
…
py-pygments
…
py-pygobject
…
py-pygpu
Fixed Theano GPU support (#7325)
2018-02-22 09:45:37 -08:00
py-pygtk
…
py-pylint
…
py-pymatgen
…
py-pyminifier
…
py-pympler
…
py-pynn
…
py-pypar
…
py-pyparsing
…
py-pypeflow
…
py-pyprof2html
…
py-pyqt
…
py-pyrad
…
py-pysam
…
py-pyscaf
…
py-pyserial
…
py-pyside
…
py-pysocks
…
py-pytables
…
py-pytest
…
py-pytest-cov
…
py-pytest-flake8
…
py-pytest-httpbin
…
py-pytest-mock
…
py-pytest-runner
…
py-pytest-xdist
…
py-python-daemon
…
py-python-gitlab
…
py-pythonqwt
…
py-pytz
…
py-pyvcf
py-pyvcf: versions 0.6.7 and 0.6.8 (#6743)
2018-02-20 17:14:06 -06:00
py-pywavelets
…
py-pyyaml
…
py-qtawesome
…
py-qtconsole
…
py-qtpy
…
py-quantities
…
py-quast
py-quast: Create new package (#7254)
2018-02-18 14:33:59 +01:00
py-radical-utils
…
py-ranger
…
py-rasterio
py-rasterio: Added with dependencies. (#7156)
2018-03-06 18:21:34 +01:00
py-readme-renderer
…
py-regex
…
py-reportlab
…
py-requests
…
py-restview
…
py-rope
…
py-rpy2
…
py-rsa
…
py-rseqc
…
py-rtree
…
py-saga-python
…
py-scandir
…
py-scientificpython
…
py-scikit-image
…
py-scikit-learn
…
py-scipy
…
py-seaborn
…
py-setuptools
…
py-setuptools-git
py-setuptools-git: Create new package (#7131)
2018-01-31 16:52:34 +01:00
py-setuptools-scm
…
py-sfepy
…
py-sh
…
py-shiboken
…
py-simplegeneric
…
py-simplejson
…
py-singledispatch
…
py-sip
…
py-six
…
py-slepc4py
…
py-sncosmo
…
py-snowballstemmer
…
py-snuggs
py-rasterio: Added with dependencies. (#7156)
2018-03-06 18:21:34 +01:00
py-spectra
…
py-spefile
…
py-spglib
…
py-sphinx
…
py-sphinx-bootstrap-theme
…
py-sphinx-rtd-theme
…
py-sphinxcontrib-bibtex
…
py-sphinxcontrib-programoutput
…
py-sphinxcontrib-websupport
…
py-spyder
…
py-spykeutils
…
py-sqlalchemy
…
py-statsmodels
…
py-stevedore
Added virtualenvwrapper python package (#7270)
2018-02-22 09:47:05 -08:00
py-storm
…
py-subprocess32
…
py-symengine
…
py-symfit
…
py-sympy
…
py-tabulate
…
py-tappy
…
py-terminado
…
py-tetoolkit
…
py-theano
Fixed Theano GPU support (#7325)
2018-02-22 09:45:37 -08:00
py-tifffile
…
py-toml
…
py-tomopy
…
py-tornado
…
py-tqdm
…
py-traceback2
…
py-traitlets
…
py-tuiview
…
py-twisted
…
py-typing
…
py-tzlocal
…
py-umi-tools
…
py-unittest2
…
py-unittest2py3k
…
py-urllib3
…
py-urwid
…
py-vcversioner
…
py-virtualenv
…
py-virtualenv-clone
Added virtualenvwrapper python package (#7270)
2018-02-22 09:47:05 -08:00
py-virtualenvwrapper
Added virtualenvwrapper python package (#7270)
2018-02-22 09:47:05 -08:00
py-vsc-base
…
py-vsc-install
…
py-wcsaxes
…
py-wcwidth
…
py-webkit-server
…
py-werkzeug
…
py-wheel
…
py-widgetsnbextension
…
py-wrapt
…
py-xarray
…
py-xattr
…
py-xlrd
…
py-xlsxwriter
…
py-xmlrunner
…
py-xopen
…
py-xpyb
…
py-xvfbwrapper
…
py-yapf
…
py-yt
…
py-zmq
…
python
Set a default python that is consistent with the libraries in PYTHONHOME (#7157)
2018-02-11 23:08:45 -08:00
qbank
…
qbox
…
qhull
…
qmcpack
QMCPACK - General Improvements (#6958)
2018-02-23 09:52:46 -08:00
qmd-progress
…
qrupdate
…
qt
OpenSpeedShop package: add support for building on cray (#7338)
2018-03-07 14:26:07 -08:00
qt-creator
…
qtgraph
…
qthreads
…
quinoa
…
qwt
…
r
R package: add version v3.2.5 (#7139)
2018-02-13 12:11:52 -08:00
r-a4
…
r-a4base
…
r-a4classif
…
r-a4core
…
r-a4preproc
…
r-a4reporting
…
r-abadata
…
r-abaenrichment
…
r-abind
…
r-absseq
…
r-acde
…
r-acepack
…
r-acgh
…
r-acme
…
r-ada
…
r-adabag
…
r-ade4
…
r-adegenet
…
r-adsplit
…
r-affxparser
…
r-affy
…
r-affycomp
…
r-affycompatible
…
r-affycontam
…
r-affycoretools
…
r-affydata
…
r-affyexpress
…
r-affyilm
…
r-affyio
…
r-affypdnn
…
r-affyplm
…
r-affyqcreport
…
r-affyrnadegradation
…
r-agdex
…
r-agilp
…
r-agimicrorna
…
r-aims
…
r-aldex2
…
r-allelicimbalance
…
r-alpine
…
r-als
…
r-alsace
…
r-altcdfenvs
…
r-ampliqueso
…
r-analysispageserver
…
r-anaquin
…
r-aneufinder
…
r-aneufinderdata
…
r-annaffy
…
r-annotate
…
r-annotationdbi
…
r-annotationfilter
…
r-annotationforge
…
r-annotationhub
…
r-ape
…
r-assertthat
…
r-backports
…
r-bamsignals
…
r-base64
…
r-base64enc
…
r-beanplot
…
r-bh
…
r-bindr
…
r-bindrcpp
…
r-biobase
…
r-biocgenerics
…
r-biocinstaller
…
r-biocparallel
…
r-biocstyle
…
r-biomart
…
r-biomformat
…
r-biostrings
…
r-biovizbase
…
r-bit
…
r-bit64
…
r-bitops
…
r-blob
…
r-bookdown
…
r-boot
…
r-brew
…
r-broom
…
r-bsgenome
…
r-bumphunter
…
r-c50
…
r-callr
…
r-car
…
r-caret
…
r-category
…
r-catools
…
r-cellranger
…
r-checkmate
…
r-checkpoint
…
r-chemometrics
…
r-chron
…
r-circlize
…
r-class
…
r-classint
…
r-cli
…
r-clipr
…
r-cluster
…
r-clusterprofiler
…
r-coda
…
r-codetools
…
r-coin
…
r-colorspace
…
r-complexheatmap
…
r-corpcor
…
r-corrplot
…
r-covr
…
r-cowplot
…
r-crayon
…
r-crosstalk
…
r-cubature
…
r-cubist
…
r-curl
…
r-data-table
…
r-dbi
…
r-dbplyr
…
r-delayedarray
…
r-deldir
…
r-dendextend
…
r-deoptim
…
r-deoptimr
…
r-deseq
…
r-deseq2
…
r-desolve
…
r-devtools
…
r-diagrammer
…
r-dichromat
…
r-diffusionmap
…
r-digest
…
r-diptest
…
r-dnacopy
…
r-do-db
…
r-domc
…
r-doparallel
…
r-dorng
…
r-dose
…
r-downloader
…
r-dplyr
…
r-dt
…
r-dtw
…
r-dygraphs
…
r-e1071
…
r-edger
…
r-ellipse
…
r-ensembldb
…
r-ergm
…
r-evaluate
…
r-expm
…
r-factoextra
…
r-factominer
…
r-ff
…
r-fftwtools
…
r-fgsea
…
r-filehash
…
r-flashclust
…
r-flexmix
…
r-fnn
…
r-forcats
…
r-foreach
…
r-forecast
…
r-foreign
…
r-formatr
…
r-formula
…
r-fpc
…
r-fracdiff
…
r-futile-logger
…
r-futile-options
…
r-gbm
…
r-gcrma
…
r-gdata
…
r-gdsfmt
…
r-geiger
…
r-genefilter
…
r-geneplotter
…
r-genomeinfodb
…
r-genomeinfodbdata
…
r-genomicalignments
…
r-genomicfeatures
…
r-genomicranges
…
r-geomorph
…
r-geoquery
…
r-geosphere
…
r-getopt
…
r-getoptlong
…
r-ggally
…
r-ggbio
…
r-ggdendro
…
r-ggjoy
…
r-ggmap
…
r-ggplot2
…
r-ggpubr
…
r-ggrepel
…
r-ggridges
…
r-ggsci
…
r-ggvis
…
r-gistr
…
r-git2r
…
r-glmnet
…
r-globaloptions
…
r-glue
…
r-gmodels
…
r-gmp
…
r-go-db
…
r-googlevis
…
r-gosemsim
…
r-gostats
…
r-gplots
…
r-graph
…
r-gridbase
…
r-gridextra
…
r-gseabase
…
r-gsubfn
…
r-gtable
…
r-gtools
…
r-gtrellis
…
r-gviz
…
r-haven
…
r-hexbin
…
r-highr
…
r-hmisc
…
r-hms
…
r-htmltable
…
r-htmltools
…
r-htmlwidgets
…
r-httpuv
…
r-httr
…
r-hwriter
…
r-hypergraph
…
r-ica
…
r-igraph
…
r-illuminaio
…
r-impute
…
r-influencer
…
r-inline
…
r-interactivedisplaybase
…
r-ipred
…
r-iranges
…
r-irdisplay
…
r-irkernel
…
r-irlba
…
r-iso
…
r-iterators
…
r-janitor
…
r-jaspar2018
r-jaspar2018: Create new package. (#7221)
2018-02-14 08:35:16 +01:00
r-jpeg
…
r-jsonlite
…
r-kegg-db
…
r-kegggraph
…
r-keggrest
…
r-kernlab
…
r-kernsmooth
…
r-kknn
…
r-knitr
…
r-labeling
…
r-lambda-r
…
r-laplacesdemon
…
r-lars
…
r-lattice
…
r-latticeextra
…
r-lava
…
r-lazyeval
…
r-leaflet
…
r-leaps
…
r-learnbayes
…
r-limma
…
r-lme4
…
r-lmtest
…
r-locfit
…
r-log4r
…
r-lpsolve
…
r-lsei
…
r-lubridate
…
r-magic
…
r-magrittr
…
r-makecdfenv
…
r-maldiquant
…
r-mapproj
…
r-maps
…
r-maptools
…
r-markdown
…
r-mass
…
r-matrix
r-rcppblaze: new package (#7209)
2018-02-13 14:07:18 +01:00
r-matrixmodels
…
r-matrixstats
…
r-mclust
…
r-mcmcglmm
…
r-mda
…
r-memoise
…
r-mergemaid
…
r-methodss3
…
r-mgcv
r-powerlaw: new package (#7222)
2018-02-14 08:36:34 +01:00
r-mime
…
r-minfi
…
r-minqa
…
r-mixtools
…
r-mlbench
…
r-mlinterfaces
…
r-mnormt
…
r-modelmetrics
…
r-modelr
…
r-modeltools
…
r-mpm
…
r-msnbase
…
r-multcomp
…
r-multtest
…
r-munsell
…
r-mvtnorm
…
r-mzid
…
r-mzr
…
r-nanotime
…
r-ncbit
…
r-ncdf4
…
r-network
…
r-networkd3
…
r-nlme
…
r-nloptr
…
r-nmf
…
r-nnet
…
r-nnls
…
r-nor1mix
…
r-np
…
r-numderiv
…
r-oligoclasses
…
r-oo
…
r-openssl
…
r-org-hs-eg-db
…
r-organismdbi
…
r-packrat
…
r-pacman
…
r-pamr
…
r-party
…
r-partykit
…
r-pathview
…
r-pbapply
…
r-pbdzmq
…
r-pbkrtest
…
r-pcamethods
…
r-pcapp
…
r-permute
…
r-pfam-db
…
r-phantompeakqualtools
…
r-phyloseq
…
r-pkgconfig
…
r-pkgmaker
…
r-plogr
…
r-plotly
…
r-plotrix
…
r-pls
…
r-plyr
…
r-pmcmr
…
r-png
…
r-powerlaw
r-powerlaw: new package (#7222)
2018-02-14 08:36:34 +01:00
r-prabclus
…
r-praise
…
r-preprocesscore
…
r-prettyunits
…
r-prodlim
…
r-progress
…
r-protgenerics
…
r-proto
…
r-proxy
…
r-pryr
…
r-psych
…
r-ptw
…
r-purrr
…
r-quadprog
…
r-quantmod
…
r-quantreg
…
r-quantro
…
r-qvalue
…
r-r6
…
r-randomforest
…
r-ranger
…
r-rappdirs
…
r-raster
…
r-rbgl
…
r-rbokeh
…
r-rcolorbrewer
…
r-rcpp
…
r-rcpparmadillo
…
r-rcppblaze
r-rcppblaze: new package (#7209)
2018-02-13 14:07:18 +01:00
r-rcppcctz
…
r-rcppeigen
…
r-rcppprogress
…
r-rcurl
…
r-rda
…
r-readr
…
r-readxl
…
r-registry
…
r-rematch
…
r-reordercluster
…
r-reportingtools
…
r-repr
…
r-reprex
…
r-reshape
…
r-reshape2
…
r-rex
…
r-rgdal
…
r-rgeos
…
r-rgl
…
r-rgooglemaps
…
r-rgraphviz
…
r-rhdf5
…
r-rhtslib
…
r-rinside
…
r-rjags
…
r-rjava
…
r-rjson
…
r-rjsonio
…
r-rlang
…
r-rmarkdown
…
r-rminer
…
r-rmpfr
…
r-rmpi
…
r-rmysql
…
r-rngtools
…
r-robustbase
…
r-rocr
…
r-rodbc
…
r-roxygen2
…
r-rpart
…
r-rpart-plot
…
r-rpostgresql
…
r-rprojroot
…
r-rsamtools
…
r-rsnns
…
r-rsqlite
…
r-rstan
…
r-rstudioapi
…
r-rtracklayer
…
r-rtsne
…
r-rvcheck
…
r-rvest
…
r-rzmq
…
r-s4vectors
…
r-samr
…
r-sandwich
…
r-scales
…
r-scatterplot3d
…
r-sdmtools
…
r-segmented
…
r-selectr
…
r-seqinr
…
r-seqlogo
r-seqlogo: new package (#7229)
2018-02-14 09:42:40 +01:00
r-seurat
…
r-sf
r-sf: new package (#6547)
2018-03-05 23:45:19 -06:00
r-sfsmisc
…
r-shape
…
r-shiny
…
r-shortread
…
r-siggenes
…
r-simpleaffy
…
r-sn
…
r-snow
…
r-snprelate
…
r-som
…
r-somaticsignatures
…
r-sourcetools
…
r-sp
…
r-sparsem
…
r-spdep
…
r-speedglm
…
r-sqldf
…
r-stanheaders
…
r-statmod
…
r-statnet-common
…
r-stringi
…
r-stringr
…
r-strucchange
…
r-subplex
…
r-summarizedexperiment
…
r-survey
…
r-survival
…
r-sva
…
r-tarifx
…
r-tclust
…
r-tensora
…
r-testit
…
r-testthat
…
r-tfmpvalue
r-tfmpvalue: new package (#7230)
2018-02-14 08:49:09 +01:00
r-th-data
…
r-threejs
…
r-tibble
…
r-tidycensus
…
r-tidyr
…
r-tiff
…
r-tigris
…
r-timedate
…
r-topgo
…
r-trimcluster
…
r-trust
…
r-tseries
…
r-tsne
…
r-ttr
…
r-udunits2
…
r-units
…
r-utils
…
r-uuid
…
r-variantannotation
…
r-varselrf
…
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…
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…
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…
r-viridis
…
r-viridislite
…
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…
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…
r-whisker
…
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…
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…
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…
r-xlconnect
…
r-xlconnectjars
…
r-xlsx
…
r-xlsxjars
…
r-xmapbridge
…
r-xml
…
r-xml2
…
r-xtable
…
r-xts
…
r-xvector
…
r-yaml
…
r-yapsa
…
r-yaqcaffy
…
r-yarn
…
r-zlibbioc
…
r-zoo
…
raft
…
raja
RAJA package: add versions and CUDA/openmp support (#7201)
2018-02-12 10:34:54 -08:00
randfold
…
random123
…
randrproto
…
rapidjson
rapidjson: new package (#7391)
2018-03-05 21:10:02 +01:00
ravel
…
raxml
…
ray
…
rdp-classifier
…
re2c
re2c@1.0.3: new package (#7092)
2018-01-31 13:46:17 +01:00
readline
…
recordproto
…
redundans
…
relion
Relion 2.1 - Using CudaPackage class (#6707)
2018-03-07 07:45:48 +01:00
rempi
…
rename
…
rendercheck
…
renderproto
…
repeatmasker
…
resourceproto
…
revbayes
…
rgb
…
rhash
…
rlwrap
…
rmlab
…
rna-seqc
rna-seqc package: JAVA_{ARGS,OPTS} for helper script (#6972)
2018-01-29 20:23:59 -08:00
rockstar
…
root
…
rose
…
rr
…
rsbench
…
rsem
…
rstart
…
rsync
Rsync package: Fix Src Link (#7367)
2018-03-01 22:42:26 -08:00
rtags
rtags: add 2.17 and for now comment-out 2.12 (#7126)
2018-01-31 13:36:22 +01:00
rtax
…
ruby
fix ruby build on gcc >= 7 (#7387)
2018-03-05 10:01:23 +01:00
ruby-gnuplot
…
ruby-narray
…
ruby-rubyinline
…
ruby-terminal-table
…
rust
…
rust-bindgen
…
sabre
…
sailfish
…
salmon
…
sambamba
…
samblaster
samblaster: Create new package (#7188)
2018-02-06 13:54:05 +01:00
samrai
…
samtools
…
sandbox
…
sas
…
satsuma2
…
savanna
…
saws
…
sbt
…
scala
…
scalasca
…
scalpel
…
scan-for-matches
…
scons
…
scorec-core
…
scorep
…
scotch
Changed keyword argument 'recurse' to 'recursive'
2018-02-13 02:18:28 -08:00
scr
…
screen
…
scripts
…
scrnsaverproto
…
sctk
…
sdl2
…
sdl2-image
…
sed
…
seqprep
…
seqtk
…
serf
…
sessreg
…
setxkbmap
…
sga
…
shapeit
…
shared-mime-info
…
shiny-server
…
shortbred
shortbred: Create new package (#7210)
2018-02-11 22:26:35 +01:00
shortstack
…
showfont
…
sickle
…
siesta
…
signalp
…
signify
…
silo
add -ldl to silo ldflags when building with static hdf5 in order to fix #7384 (#7385)
2018-03-05 13:28:37 +01:00
simplemoc
…
simul
…
simulationio
…
singularity
…
slepc
…
slurm
…
smalt
…
smproxy
…
snakemake
…
snap
…
snap-berkeley
…
snap-korf
…
snappy
…
snbone
snbone: fix build gcc-4.8 (#7317)
2018-02-27 13:02:04 +01:00
sniffles
…
snpeff
snpEff: Create new package. (#7382)
2018-03-06 09:34:22 +01:00
snptest
…
soap2
…
soapdenovo2
new package: Soapdenovo2 (#7047)
2018-02-20 10:33:41 -08:00
soapindel
…
soapsnp
…
somatic-sniper
…
sortmerna
…
sosflow
sosflow: add missing dependencies (#7182)
2018-03-06 18:17:49 +01:00
sowing
…
sox
…
spades
…
spark
…
sparsehash
…
sparta
…
spdlog
…
spectrum-mpi
…
speex
…
spglib
spglib: add new package (#7321)
2018-02-27 13:00:07 +01:00
sph2pipe
…
spherepack
…
spindle
…
spot
…
sqlite
Add sqlite 3.22.0 (#7335)
2018-03-06 18:09:09 +01:00
squid
…
sra-toolkit
…
sspace-longread
…
sspace-standard
…
sst-dumpi
…
sst-macro
…
stacks
…
staden-io-lib
…
star
…
star-ccm-plus
…
startup-notification
…
stat
…
stc
…
stow
stow: new package (#7235)
2018-02-14 09:42:05 +01:00
stream
…
strelka
…
stress
…
stringtie
stringtie: add version 1.3.4a (#7164)
2018-02-03 09:52:51 +01:00
structure
…
sublime-text
…
subread
…
subversion
…
suite-sparse
suite-sparse: add a package-specific 'libs' property (#7269)
2018-03-06 10:09:20 +01:00
sumaclust
…
sundials
sundials: add the 'headers' and 'libs' properties (#7282)
2018-02-19 22:11:04 -08:00
superlu
…
superlu-dist
…
superlu-mt
…
sw4lite
…
swarm
…
swfft
…
swiftsim
…
swig
…
symengine
…
sympol
…
sz
…
tabix
…
talloc
…
tantan
…
tar
…
targetp
…
task
…
taskd
…
tasmanian
…
tassel
…
tau
…
tcl
…
tclap
tclap: new package (#7390)
2018-03-05 14:53:42 +01:00
tcoffee
…
tcsh
…
tealeaf
…
tetgen
…
tethex
…
texinfo
…
texlive
…
the-platinum-searcher
…
the-silver-searcher
…
thrift
…
thrust
…
tig
…
tinyxml
…
tinyxml2
…
tioga
…
tk
…
tmalign
…
tmhmm
…
tmux
…
tmuxinator
…
tophat
…
tppred
…
transabyss
…
transdecoder
…
transposome
…
transset
…
trapproto
…
tree
…
trf
…
triangle
…
trilinos
…
trimgalore
…
trimmomatic
…
trnascan-se
trnascan-se: new package (#7351)
2018-03-06 09:58:05 +01:00
turbine
…
turbomole
…
tut
…
twm
…
tycho2
…
typhonio
…
uberftp
…
ucx
…
udunits2
…
ufo-core
…
ufo-filters
…
unblur
…
uncrustify
…
unibilium
…
unison
…
units
…
unixodbc
…
usearch
…
util-linux
…
util-macros
…
uuid
…
valgrind
…
vampirtrace
…
vardictjava
vardictjava: Adding version 1.4.4 (#7223)
2018-02-14 08:38:06 +01:00
varscan
…
vc
…
vcftools
…
vcsh
…
vdt
…
vecgeom
…
veclibfort
Changed keyword argument 'recurse' to 'recursive'
2018-02-13 02:18:28 -08:00
vegas2
…
velvet
…
verilator
add package verilator (#7332)
2018-02-27 23:46:02 -08:00
videoproto
…
viennarna
…
viewres
…
vim
…
virtualgl
…
visit
…
vizglow
…
vmatch
…
voropp
…
votca-csg
…
votca-ctp
…
votca-moo
…
votca-tools
…
votca-xtp
…
vpfft
…
vpic
…
vsearch
…
vtk
…
vtkh
…
vtkm
…
wannier90
…
wget
…
windowswmproto
…
wt
…
wx
…
wxpropgrid
…
x11perf
…
xapian-core
…
xauth
…
xbacklight
…
xbiff
…
xbitmaps
…
xbraid
xbraid: add libs method (#7233)
2018-02-14 10:40:56 +01:00
xcalc
…
xcb-demo
…
xcb-proto
…
xcb-util
…
xcb-util-cursor
…
xcb-util-errors
…
xcb-util-image
…
xcb-util-keysyms
…
xcb-util-renderutil
…
xcb-util-wm
…
xcb-util-xrm
…
xclip
…
xclipboard
…
xclock
…
xcmiscproto
…
xcmsdb
…
xcompmgr
…
xconsole
…
xcursor-themes
…
xcursorgen
…
xdbedizzy
…
xditview
…
xdm
…
xdpyinfo
…
xdriinfo
…
xedit
…
xerces-c
…
xev
…
xextproto
…
xeyes
…
xf86bigfontproto
…
xf86dga
…
xf86dgaproto
…
xf86driproto
…
xf86miscproto
…
xf86rushproto
…
xf86vidmodeproto
…
xfd
…
xfindproxy
…
xfontsel
…
xfs
…
xfsinfo
…
xfwp
…
xgamma
…
xgc
…
xhost
…
xineramaproto
…
xinit
…
xinput
…
xios
…
xkbcomp
…
xkbdata
…
xkbevd
…
xkbprint
…
xkbutils
…
xkeyboard-config
…
xkill
…
xload
…
xlogo
…
xlsatoms
…
xlsclients
…
xlsfonts
…
xmag
…
xman
…
xmessage
…
xmh
…
xmlf90
…
xmlto
…
xmodmap
…
xmore
…
xorg-cf-files
…
xorg-docs
…
xorg-gtest
…
xorg-server
…
xorg-sgml-doctools
…
xphelloworld
…
xplor-nih
…
xplsprinters
…
xpr
…
xprehashprinterlist
…
xprop
…
xproto
…
xproxymanagementprotocol
…
xqilla
…
xrandr
…
xrdb
…
xrefresh
…
xrootd
…
xrx
…
xsbench
…
xscope
…
xsdk
Added Nox for Trilinos installation by xSDK (#7219)
2018-02-13 02:20:59 -08:00
xsdktrilinos
…
xset
…
xsetmode
…
xsetpointer
…
xsetroot
…
xsimd
Xtensor 0.15.1 (#7215)
2018-02-11 17:56:08 +01:00
xsm
…
xstdcmap
…
xtensor
Xtensor 0.15.1 (#7215)
2018-02-11 17:56:08 +01:00
xtensor-python
xtensor-python (#7217)
2018-02-11 22:21:45 +01:00
xterm
…
xtl
Xtensor 0.15.1 (#7215)
2018-02-11 17:56:08 +01:00
xtrans
…
xtrap
…
xts
…
xvidtune
…
xvinfo
…
xwd
…
xwininfo
…
xwud
…
xz
…
yajl
…
yambo
yambo: added new package (#7301)
2018-02-22 12:11:51 +01:00
yaml-cpp
…
yasm
…
yorick
…
z3
…
zeromq
…
zfp
updating zfp version (#7304)
2018-02-27 21:49:04 +01:00
zip
…
zlib
Changed keyword argument 'recurse' to 'recursive'
2018-02-13 02:18:28 -08:00
zoltan
…
zsh
…
zstd
…