zhangyiss/spack
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0
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Code Issues Pull Requests Actions Packages Projects Releases Wiki Activity
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d6daa8fab5ff64006c281d31a7a3996e2697cb77
spack/var/spack/repos/builtin/packages
History
Justin Stanley d6daa8fab5 perl-dbd-sqlite: new package starting at 1.56 (#9338)
2018-09-28 14:08:14 -05:00
..
abinit
…
abyss
…
accfft
…
ack
…
activeharmony
…
adept-utils
…
adios
…
adios2
…
adlbx
…
adol-c
…
aegean
…
aida
New package: AIDA (#9094)
2018-09-03 21:02:06 -05:00
albany
…
albert
…
alglib
…
allinea-forge
…
allinea-reports
…
allpaths-lg
…
alquimia
…
alsa-lib
…
amg
AMG: update version (#9228)
2018-09-12 14:11:05 -06:00
amg2013
…
amp
…
ampliconnoise
…
amrex
…
amrvis
Updating amrvis to allow building with profiling support. (#9204)
2018-09-14 17:16:35 -07:00
andi
…
angsd
…
ant
…
antlr
…
ants
…
ape
…
aperture-photometry
aperture-photometry: new package (#9119)
2018-09-03 20:52:11 -05:00
apex
…
apple-libunwind
apple-libunwind: update path to library (#9265)
2018-09-18 18:48:53 -07:00
applewmproto
…
appres
…
apr
…
apr-util
…
aragorn
…
archer
…
argobots
argobots: new package starting at 1.0b1 (#9238)
2018-09-14 15:48:40 -07:00
argp-standalone
…
argtable
…
arlecore
…
armadillo
…
arpack-ng
arpack-ng: add version 3.6.3 (#9331)
2018-09-26 19:12:41 -07:00
arrow
…
ascent
…
asciidoc
…
aspa
…
aspcud
…
aspect
aspect: new version (#9146)
2018-09-03 20:35:45 -05:00
aspell
…
aspell6-de
…
aspell6-en
…
aspell6-es
…
aspera-cli
…
assimp
assimp: fix compile issues with intel compilers on knl/linux [a depen… (#9191)
2018-09-08 16:18:37 -05:00
astra
…
astral
…
astyle
…
at-spi2-atk
…
at-spi2-core
…
atk
…
atlas
…
atom-dft
…
atompaw
…
atop
…
augustus
…
autoconf
…
autodock-vina
…
autogen
…
automaded
…
automake
…
axel
…
axl
…
bamdst
Bamdst: a new package. (#9113)
2018-09-04 14:35:33 -05:00
bamtools
…
bamutil
…
barrnap
…
bash
…
bash-completion
…
bats
…
bazel
Bazel: update env handling, add versions (#9369)
2018-09-27 19:37:31 -07:00
bbcp
…
bbmap
…
bc
…
bcftools
…
bcl2fastq2
…
bdftopcf
…
bdw-gc
…
bear
…
beast1
…
beast2
…
bedops
…
bedtools2
…
beforelight
…
benchmark
…
berkeley-db
…
bertini
…
bib2xhtml
…
bigreqsproto
…
binutils
binutils: add variant 'nls' for native language support (#9124)
2018-08-29 20:32:41 -07:00
bioawk
…
biopieces
…
bismark
…
bison
…
bitmap
…
blasr
…
blasr-libcpp
…
blast-plus
…
blat
…
blaze
…
blis
…
bliss
…
blitz
…
bmake
…
bml
…
bohrium
…
bolt
bolt: new package starting at 1.0b1 (#9253)
2018-09-14 15:49:36 -07:00
bookleaf-cpp
…
boost
…
boostmplcartesianproduct
…
bowtie
…
bowtie2
…
boxlib
…
bpp-core
…
bpp-phyl
…
bpp-seq
…
bpp-suite
…
bracken
…
braker
…
branson
…
breakdancer
breakdancer: fix several issues (#9251)
2018-09-14 20:11:34 -07:00
breseq
…
brigand
…
bsseeker2
…
bucky
…
bumpversion
…
busco
…
butter
…
bwa
…
bwtool
…
byobu
…
bzip2
…
c-blosc
…
c-lime
…
caffe
…
cairo
…
cairomm
…
caliper
…
callpath
…
camellia
…
candle-benchmarks
Packages/candle benchmarks (#9266)
2018-09-18 13:02:03 -06:00
cantera
…
canu
…
cap3
…
cares
…
cask
…
casper
…
catalyst
…
catch
Catch2: 2.3.0+ (#9300)
2018-09-20 15:55:18 +02:00
cbench
…
cblas
…
cbtf
Update openspeedshop and cbtf version numbers (#9150)
2018-09-03 20:35:25 -05:00
cbtf-argonavis
Update openspeedshop and cbtf version numbers (#9150)
2018-09-03 20:35:25 -05:00
cbtf-argonavis-gui
…
cbtf-krell
Update openspeedshop and cbtf version numbers (#9150)
2018-09-03 20:35:25 -05:00
cbtf-lanl
Update openspeedshop and cbtf version numbers (#9150)
2018-09-03 20:35:25 -05:00
ccache
…
cctools
…
cdbfasta
…
cdd
…
cddlib
…
cdhit
…
cdo
…
ceed
…
cereal
…
ceres-solver
…
cfitsio
…
cgal
…
cgm
…
cgns
…
channelflow
…
charliecloud
…
charmpp
Charmpp: rename charm to charmpp according to ++ conventions (#9216)
2018-09-14 17:01:07 -07:00
chatterbug
…
check
…
chlorop
…
chombo
…
cistem
Fix version parsing for cistem package (#9260)
2018-09-18 19:29:18 -07:00
cityhash
…
clamr
…
clapack
…
cleaveland4
…
cleverleaf
…
clfft
…
clhep
…
clingo
…
cloc
…
cloog
…
cloverleaf
…
cloverleaf3d
…
clustalo
…
clustalw
…
cmake
cmake: add version 3.12.2 (#9248)
2018-09-14 09:36:39 -07:00
cmocka
…
cmor
…
cnmem
…
cnpy
…
cntk
…
cntk1bitsgd
…
codar-cheetah
…
codes
New package: CODES simulation framework (#9133)
2018-09-03 20:43:50 -05:00
coevp
…
cohmm
…
coinhsl
coinhsl: add @2015.06.23, explain versions, SHA256 (#9258)
2018-09-16 15:03:26 -05:00
colm
…
colordiff
…
comd
ecp-proxy-apps: update dependencies for release 1.0 and 1.1 (#9217)
2018-09-11 15:10:49 -06:00
commons-lang
…
commons-lang3
…
commons-logging
…
compiz
…
compositeproto
…
conduit
…
constype
…
converge
…
coreutils
…
corset
…
cosmomc
…
cosp2
…
cp2k
…
cppad
…
cppcheck
…
cppgsl
…
cpprestsdk
…
cppunit
…
cppzmq
…
cpu-features
…
cpuinfo
…
cram
…
cryptopp
…
cscope
…
csdp
…
ctffind
…
cub
…
cube
…
cubelib
…
cubew
…
cuda
Added Cuda 10 (#9310)
2018-09-27 13:33:53 -07:00
cuda-memtest
…
cudnn
…
cufflinks
…
cups
…
curl
…
cvs
…
czmq
…
dakota
…
daligner
…
damageproto
…
damselfly
…
darshan-runtime
…
darshan-util
…
dash
…
datamash
…
dataspaces
…
davix
…
dbus
…
dealii
xsdk: add dealii (#7529)
2018-09-06 19:22:17 -05:00
dealii-parameter-gui
…
deconseq-standalone
…
dejagnu
…
delly2
…
denovogear
…
dia
…
dialign-tx
…
diamond
…
diffsplice
…
direnv
…
discovar
…
discovardenovo
…
dislin
…
dlpack
…
dmd
Pack dlang's stdlib into dmd. (#9131)
2018-09-04 14:49:28 -05:00
dmlc-core
…
dmtcp
…
dmxproto
…
docbook-xml
…
docbook-xsl
…
dos2unix
…
dotnet-core-sdk
changed to new install_tree formalism (#9181)
2018-09-15 09:40:50 -05:00
double-conversion
…
doxygen
…
dri2proto
…
dri3proto
…
dsdp
…
dsrc
…
dtcmp
…
dyninst
…
ea-utils
…
easybuild
…
ebms
…
eccodes
…
eclipse-gcj-parser
…
ecp-proxy-apps
Packages/candle benchmarks (#9266)
2018-09-18 13:02:03 -06:00
ed
…
editres
…
eigen
add eigen@3.3.5 (#9212)
2018-09-14 17:14:46 -07:00
elasticsearch
Added Kibana package, added Elasticsearch to 6.4.0 (#9239)
2018-09-14 10:50:20 -07:00
elemental
…
elfutils
…
elk
…
elpa
…
emacs
…
ember
ember: put all READMEs into docs and add executables in bin (#9362)
2018-09-27 05:49:15 -06:00
emboss
…
encodings
…
environment-modules
…
eospac
…
er
…
es
…
esmf
…
essl
…
ethminer
…
etsf-io
…
everytrace
…
everytrace-example
…
evieext
…
exabayes
…
examinimd
…
exampm
…
exasp2
…
exmcutils
…
exodusii
…
exonerate
…
expat
…
expect
…
express
…
extrae
…
exuberant-ctags
…
f90cache
…
fabtests
…
falcon
…
farmhash
…
fast-gbs
…
fast-global-file-status
…
fasta
…
fastjar
…
fastmath
…
fastme
…
fastphase
…
fastq-screen
…
fastqc
…
fastqvalidator
…
fasttree
…
fastx-toolkit
…
fenics
…
fermi
…
fermikit
…
fermisciencetools
…
ferret
…
ffmpeg
…
fftw
…
fimpute
…
findutils
…
fio
…
fish
…
fixesproto
…
flac
…
flang
…
flann
patch flann // gcc // cmake@3.11+ (#9214)
2018-09-14 17:01:58 -07:00
flash
…
flatbuffers
…
flecsale
…
flecsi
…
flex
…
flint
…
flit
…
fltk
…
flux-core
…
flux-sched
…
fluxbox
…
fmt
…
foam-extend
…
folly
…
font-adobe-75dpi
…
font-adobe-100dpi
…
font-adobe-utopia-75dpi
…
font-adobe-utopia-100dpi
…
font-adobe-utopia-type1
…
font-alias
…
font-arabic-misc
…
font-bh-75dpi
…
font-bh-100dpi
…
font-bh-lucidatypewriter-75dpi
…
font-bh-lucidatypewriter-100dpi
…
font-bh-ttf
…
font-bh-type1
…
font-bitstream-75dpi
…
font-bitstream-100dpi
…
font-bitstream-speedo
…
font-bitstream-type1
…
font-cronyx-cyrillic
…
font-cursor-misc
…
font-daewoo-misc
…
font-dec-misc
…
font-ibm-type1
…
font-isas-misc
…
font-jis-misc
…
font-micro-misc
…
font-misc-cyrillic
…
font-misc-ethiopic
…
font-misc-meltho
…
font-misc-misc
…
font-mutt-misc
…
font-schumacher-misc
…
font-screen-cyrillic
…
font-sony-misc
…
font-sun-misc
…
font-util
…
font-winitzki-cyrillic
…
font-xfree86-type1
…
fontcacheproto
…
fontconfig
…
fontsproto
…
fonttosfnt
…
fp16
…
fpc
…
fr-hit
…
freebayes
…
freeglut
…
freetype
…
fseq
…
fsl
…
fslsfonts
…
fstobdf
…
ftgl
…
funhpc
…
fyba
…
gapbs
…
gapcloser
…
gapfiller
…
gasnet
…
gatk
gatk: new version (#9202)
2018-09-14 13:55:52 -07:00
gaussian
…
gawk
…
gblocks
…
gcc
…
gccmakedep
…
gccxml
…
gconf
…
gcta
…
gdal
GDAL: add version 2.3.1 (#9156)
2018-09-01 07:32:24 -05:00
gdb
gdb: add lzma support by default (#9247)
2018-09-15 09:06:16 -05:00
gdbm
…
gdk-pixbuf
…
gdl
…
geant4
…
gearshifft
…
gemmlowp
…
genemark-et
…
genomefinisher
…
genometools
…
geopm
…
geos
…
gettext
…
gflags
…
ghost
…
ghostscript
…
ghostscript-fonts
…
giflib
…
git
…
git-imerge
…
git-lfs
…
gl2ps
…
glew
…
glfmultiples
…
glib
…
glibmm
…
glimmer
…
glm
…
global
…
globalarrays
…
globus-toolkit
…
glog
…
gloo
…
glpk
…
glproto
…
glvis
…
gmake
…
gmap-gsnap
gmap-gsnap: set default value for simd variant (#9366)
2018-09-28 10:41:41 -07:00
gmime
…
gmodel
gmodel: new package starting at 2.1.0 (#9170)
2018-09-06 10:48:08 +02:00
gmp
…
gmsh
gmsh: add git master and 4.0.0 versions (#9172)
2018-09-06 10:42:40 +02:00
gnat
…
gnu-prolog
…
gnupg
…
gnuplot
…
gnutls
…
go
…
go-bootstrap
…
gobject-introspection
…
googletest
…
gotcha
…
gource
…
gperf
…
gperftools
…
gplates
…
grackle
…
gradle
…
grandr
…
graph500
…
graphicsmagick
…
graphlib
…
graphmap
…
graphviz
…
grass
…
grib-api
…
grnboost
…
groff
…
gromacs
…
gsl
…
gslib
…
gtkmm
…
gtkorvo-atl
…
gtkorvo-cercs-env
…
gtkorvo-dill
…
gtkorvo-enet
…
gtkplus
…
gts
…
guidance
…
guile
…
gurobi
…
h5hut
…
h5part
…
h5utils
…
h5z-zfp
…
hacckernels
…
hadoop
hadoop package: fix url and checksum (#9263)
2018-09-18 18:49:52 -07:00
halc
…
hapcut2
…
hapdip
…
haploview
…
harfbuzz
…
harminv
…
hdf
…
hdf5
…
hdf5-blosc
…
help2man
…
hepmc
…
heppdt
…
hic-pro
…
highfive
…
highwayhash
…
hiop
…
hisat2
…
hisea
…
hmmer
…
hoomd-blue
…
hpccg
…
hpctoolkit
…
hpctoolkit-externals
…
hpgmg
…
hpl
…
hpx
…
hpx5
…
hsakmt
…
hstr
…
htop
…
htslib
…
httpie
…
hub
…
hunspell
…
hwloc
Hwloc add update 2.0.2 (#9244)
2018-09-14 10:48:38 -07:00
hybpiper
…
hydra
…
hydrogen
…
hypre
hypre: patch +shared@2.13.0: on darwin (#9220)
2018-09-14 17:14:30 -07:00
i3
…
ibmisc
…
iceauth
…
icedtea
…
icet
…
ico
…
icu4c
…
id3lib
…
idba
…
igraph
…
igv
…
igvtools
…
ilmbase
…
image-magick
…
imake
…
imp
…
impute2
…
infernal
…
inputproto
…
intel
Intel prefixes (#7469)
2018-08-29 21:09:34 -07:00
intel-daal
intel: add 2019.0 (#9328)
2018-09-24 21:27:43 -05:00
intel-gpu-tools
…
intel-ipp
intel: add 2019.0 (#9328)
2018-09-24 21:27:43 -05:00
intel-mkl
intel: add 2019.0 (#9328)
2018-09-24 21:27:43 -05:00
intel-mkl-dnn
…
intel-mpi
intel: add 2019.0 (#9328)
2018-09-24 21:27:43 -05:00
intel-parallel-studio
Intel prefixes (#7469)
2018-08-29 21:09:34 -07:00
intel-tbb
intel: add 2019.0 (#9328)
2018-09-24 21:27:43 -05:00
intel-xed
…
intltool
…
ior
…
iozone
…
iperf2
…
iperf3
…
ipopt
ipopt: add debug variant (#9223)
2018-09-14 15:53:25 -07:00
isaac
…
isaac-server
…
isl
…
itstool
…
itsx
…
jackcess
…
jags
…
jansson
…
jasper
…
jbigkit
…
jchronoss
…
jdk
jdk: added 10.0.2_13 (#9203)
2018-09-14 17:17:32 -07:00
jellyfish
…
jemalloc
…
jmol
…
jq
…
json-c
…
json-cwx
…
json-glib
…
jsoncpp
…
judy
…
julia
…
k8
…
kahip
…
kaiju
…
kaks-calculator
…
kaldi
…
kallisto
…
kbproto
…
kdiff3
…
kealib
…
kentutils
…
kibana
Added Kibana package, added Elasticsearch to 6.4.0 (#9239)
2018-09-14 10:50:20 -07:00
kim-api
…
kmergenie
…
kokkos
…
kraken
…
krb5
…
krims
…
kripke
…
kvasir-mpl
…
kvtree
…
laghos
update URLs for Laghos and MACSio (#9351)
2018-09-26 17:22:05 -06:00
lammps
…
last
…
latte
…
launchmon
…
lazyten
…
lbann
…
lbxproxy
…
lcals
…
lcms
…
ldc
…
ldc-bootstrap
…
legion
…
leveldb
…
lftp
…
libaec
…
libaio
…
libapplewm
…
libarchive
…
libassuan
…
libatomic-ops
…
libbeagle
…
libbeato
…
libbsd
…
libbson
…
libcanberra
…
libcap
…
libceed
…
libcerf
…
libcheck
…
libcint
…
libcircle
…
libconfig
…
libcroco
…
libctl
…
libdivsufsort
…
libdmx
…
libdrm
…
libdwarf
…
libedit
…
libelf
…
libemos
…
libepoxy
…
libev
…
libevent
…
libevpath
…
libfabric
…
libffi
Build Python 3.7 with external libffi. (#9245)
2018-09-14 17:07:13 -07:00
libffs
…
libfontenc
…
libfs
…
libgcrypt
…
libgd
…
libgeotiff
…
libgit2
…
libgpg-error
…
libgpuarray
…
libgridxc
…
libgtextutils
…
libharu
…
libhio
libhio: add patch for 1.4.1.2 release (#9270)
2018-09-18 17:26:34 -06:00
libiberty
…
libice
…
libiconv
…
libint
…
libjpeg
…
libjpeg-turbo
…
libksba
…
liblbxutil
…
liblockfile
…
libmatheval
…
libmaxminddb
…
libmesh
libMesh: New variant and updated recent versions. (#9186)
2018-09-07 21:13:34 -07:00
libmng
…
libmongoc
…
libmonitor
…
libnbc
…
libnl
…
libnova
…
libogg
…
liboldx
…
libpcap
…
libpciaccess
…
libpfm4
libpfm4: add version and compiler flags (#9291)
2018-09-28 10:36:27 -07:00
libpipeline
…
libpng
libpng package: add version (#9142)
2018-08-31 10:26:13 -07:00
libpsl
…
libpthread-stubs
…
libquo
…
librom
…
libshm
…
libsigcpp
…
libsigsegv
…
libsm
…
libsodium
…
libspatialindex
…
libsplash
…
libssh
…
libssh2
…
libsvm
…
libszip
…
libtermkey
…
libtiff
…
libtool
…
libunistring
…
libunwind
…
libuuid
…
libuv
…
libvorbis
…
libvterm
…
libwebsockets
…
libwindowswm
…
libx11
…
libxau
…
libxaw
…
libxaw3d
…
libxc
…
libxcb
…
libxcomposite
…
libxcursor
…
libxdamage
…
libxdmcp
…
libxevie
…
libxext
…
libxfixes
…
libxfont
…
libxfont2
…
libxfontcache
…
libxft
…
libxi
…
libxinerama
…
libxkbcommon
…
libxkbfile
…
libxkbui
…
libxml2
…
libxmu
…
libxp
…
libxpm
…
libxpresent
…
libxprintapputil
…
libxprintutil
…
libxrandr
…
libxrender
…
libxres
…
libxscrnsaver
…
libxshmfence
…
libxslt
…
libxsmm
…
libxstream
…
libxt
…
libxtrap
…
libxtst
…
libxv
…
libxvmc
…
libxxf86dga
…
libxxf86misc
…
libxxf86vm
…
libyogrt
…
libzip
…
lighttpd
lighttpd: new package starting at 1.4.50 (#9325)
2018-09-24 21:33:39 -05:00
likwid
…
linkphase3
…
linux-headers
…
listres
…
llvm
Added llvm 7.0.0 (#9296)
2018-09-20 17:21:42 +02:00
llvm-openmp-ompt
…
lmdb
…
lmod
…
lndir
…
log4cplus
…
log4cxx
…
loki
…
lordec
…
lrslib
…
lrzip
…
lsof
…
ltrace
…
lua
…
lua-bitlib
…
lua-jit
…
lua-lpeg
…
lua-luafilesystem
…
lua-luaposix
…
lua-mpack
…
luit
…
lulesh
…
lumpy-sv
…
lwgrp
…
lwm2
…
lz4
…
lzma
…
lzo
…
m4
…
macsio
update URLs for Laghos and MACSio (#9351)
2018-09-26 17:22:05 -06:00
mad-numdiff
…
mafft
…
magics
…
magma
…
makedepend
…
mallocmc
…
man-db
…
manta
…
maq
…
mariadb
…
masa
…
masurca
…
matio
…
matlab
…
maven
…
maverick
…
mawk
…
mbedtls
…
mc
…
mcl
…
mdtest
…
med
…
meep
…
mefit
…
megahit
…
memaxes
…
meme
…
memkind
…
meraculous
…
mercurial
…
mesa
…
mesa-glu
…
meshkit
…
meson
…
mesquite
…
metabat
…
metaphysicl
…
metasv
metasv: add required dependencies (#9254)
2018-09-14 15:49:11 -07:00
metis
…
mfem
…
microbiomeutil
…
minced
…
mindthegap
…
miniaero
…
miniamr
miniamr: added v1.4.1 (#9225)
2018-09-14 16:56:59 -07:00
miniasm
…
miniconda2
…
miniconda3
…
minife
…
minighost
…
minigmg
…
minimap2
…
minimd
…
miniqmc
miniQMC: add newer releases and ecp-proxy-app tag (#9233)
2018-09-14 15:54:21 -07:00
minisign
…
minismac2d
…
minitri
…
minivite
miniVite: new package (#9348)
2018-09-26 19:48:34 -06:00
minixyce
…
minuit
…
mira
…
mirdeep2
…
mitofates
…
mitos
…
mkfontdir
…
mkfontscale
…
mlhka
…
moab
…
modern-wheel
…
mofem-cephas
…
mofem-fracture-module
…
mofem-minimal-surface-equation
…
mofem-users-modules
…
molcas
…
mono
…
mosh
…
mothur
…
motif
…
motioncor2
motioncor2 - added version 1.1.0 and removed old, unlisted versions (#9229)
2018-09-14 13:57:22 -07:00
mount-point-attributes
…
mozjs
…
mpark-variant
…
mpc
…
mpe2
…
mpest
…
mpfr
…
mpibash
…
mpiblast
…
mpich
mpich: fix 3.2 patch (#9330)
2018-09-28 08:18:55 -05:00
mpifileutils
mpifileutils: add v0.8 (#9152)
2018-09-03 20:34:07 -05:00
mpilander
…
mpileaks
…
mpip
…
mpir
…
mpix-launch-swift
…
mrbayes
…
mrnet
…
mrtrix3
…
mscgen
…
msgpack-c
msgpack-c, snappy: explicitly depend on googletest (#9167)
2018-09-03 20:25:17 -05:00
mshadow
…
multitail
…
multiverso
…
mummer
…
mumps
…
munge
…
muparser
…
muscle
…
muse
…
muster
…
mvapich2
…
mxml
…
mxnet
mxnet: added 1.3.0 (#9236)
2018-09-14 11:01:30 -07:00
nag
…
nalu
…
nalu-wind
…
namd
Charmpp: rename charm to charmpp according to ++ conventions (#9216)
2018-09-14 17:01:07 -07:00
nano
…
nanoflann
…
nanopb
…
nasm
…
nauty
…
ncbi-magicblast
…
ncbi-rmblastn
…
ncbi-toolkit
…
nccl
…
nccmp
…
ncdu
…
ncftp
…
ncl
…
nco
…
ncurses
…
ncview
…
ndiff
…
nek5000
…
nekbone
…
nekcem
…
nektar
…
neovim
…
nest
…
netcdf
…
netcdf-cxx
…
netcdf-cxx4
…
netcdf-fortran
…
netgauge
…
netgen
…
netlib-lapack
…
netlib-scalapack
…
netlib-xblas
…
nettle
…
neuron
…
nextflow
…
nfft
…
nghttp2
…
nginx
…
ngmlr
…
ninja
…
ninja-fortran
…
nlohmann-json
…
nlopt
nlopt: Only support release>=2.5.0, since earlier release tarballs were actually AutoTools, not CMake. (#9110)
2018-09-03 20:56:48 -05:00
nmap
…
nnvm
…
node-js
…
notmuch
…
npb
…
npm
…
npth
…
nspr
…
numactl
…
numdiff
…
nut
…
nwchem
NWChem 6.8.1 (#9140)
2018-09-03 20:36:49 -05:00
ocaml
…
occa
…
oce
…
oclint
…
oclock
…
octave
…
octave-optim
…
octave-splines
…
octave-struct
…
octopus
…
of-adios-write
…
of-precice
…
omega-h
omega-h: add versions and variants (#9169)
2018-09-05 11:01:45 -07:00
ompss
…
ompt-openmp
…
oniguruma
…
ont-albacore
…
opa-psm2
…
opam
…
opari2
…
openbabel
…
openblas
openblas: add @0.3.1, patch CMake export bug in @0.3.1:0.3.2 (#9123)
2018-09-03 20:49:45 -05:00
opencoarrays
OpenCoarrays: update v2.2.0 (#9215)
2018-09-14 16:59:19 -07:00
opencv
add opencv@3.4.3 (#9213)
2018-09-14 17:05:05 -07:00
openexr
…
openfast
…
openfoam-com
…
openfoam-org
…
openfst
…
opengl
…
openglu
…
openjpeg
…
openmc
…
openmpi
Added legacylaunchers variant to openmpi (#9336)
2018-09-27 19:29:15 -07:00
opennurbs
…
openpmd-api
Catch2: 2.3.0+ (#9300)
2018-09-20 15:55:18 +02:00
openscenegraph
…
openslide
…
openspeedshop
Update openspeedshop and cbtf version numbers (#9150)
2018-09-03 20:35:25 -05:00
openspeedshop-utils
Update openspeedshop and cbtf version numbers (#9150)
2018-09-03 20:35:25 -05:00
openssh
…
openssl
Build Python 3.7 with external libffi. (#9245)
2018-09-14 17:07:13 -07:00
opium
…
optional-lite
…
opus
…
orfm
…
orthofinder
…
orthomcl
…
osu-micro-benchmarks
…
otf
…
otf2
…
p4est
…
p7zip
…
pacbio-daligner
…
pacbio-damasker
…
pacbio-dazz-db
…
pacbio-dextractor
…
pagit
…
pagmo
…
paml
paml: remove old version, added 4.9h (#9360)
2018-09-26 19:03:35 -07:00
panda
…
pandaseq
…
pango
…
pangomm
…
papi
…
papyrus
…
paradiseo
…
parallel
…
parallel-netcdf
…
paraver
…
paraview
…
parmetis
…
parmgridgen
…
parquet
…
parsimonator
…
parsplice
…
partitionfinder
…
patch
…
patchelf
…
pathfinder
…
pax-utils
…
pbbam
…
pbmpi
…
pcma
…
pcre
…
pcre2
…
pdf2svg
…
pdftk
…
pdsh
…
pdt
…
pegtl
…
pennant
…
percept
…
perl
…
perl-algorithm-diff
…
perl-app-cmd
…
perl-array-utils
…
perl-b-hooks-endofscope
…
perl-bio-perl
…
perl-bit-vector
…
perl-cairo
…
perl-capture-tiny
…
perl-carp-clan
…
perl-cgi
perl-cgi: new package starting at 4.37 (#9339)
2018-09-28 13:53:40 -05:00
perl-class-data-inheritable
…
perl-class-inspector
…
perl-class-load
…
perl-class-load-xs
…
perl-compress-raw-bzip2
…
perl-compress-raw-zlib
…
perl-contextual-return
…
perl-cpan-meta-check
…
perl-data-optlist
…
perl-data-stag
…
perl-dbd-mysql
…
perl-dbd-sqlite
perl-dbd-sqlite: new package starting at 1.56 (#9338)
2018-09-28 14:08:14 -05:00
perl-dbfile
…
perl-dbi
…
perl-devel-cycle
…
perl-devel-globaldestruction
…
perl-devel-overloadinfo
…
perl-devel-stacktrace
…
perl-digest-md5
…
perl-dist-checkconflicts
…
perl-encode-locale
…
perl-eval-closure
…
perl-exception-class
…
perl-exporter-tiny
…
perl-extutils-depends
…
perl-extutils-makemaker
…
perl-extutils-pkgconfig
…
perl-file-copy-recursive
…
perl-file-listing
…
perl-file-pushd
…
perl-file-sharedir-install
…
perl-file-slurp-tiny
…
perl-file-slurper
…
perl-file-which
…
perl-font-ttf
…
perl-gd
…
perl-gd-graph
…
perl-gd-text
…
perl-gdgraph-histogram
perl-gdgraph-histogram: new package (#9250)
2018-09-14 15:50:18 -07:00
perl-graph
…
perl-graph-readwrite
…
perl-html-parser
…
perl-html-tagset
…
perl-http-cookies
…
perl-http-daemon
…
perl-http-date
…
perl-http-message
…
perl-http-negotiate
…
perl-inline
…
perl-inline-c
…
perl-intervaltree
…
perl-io-compress
…
perl-io-html
…
perl-io-sessiondata
…
perl-io-socket-ssl
…
perl-io-string
…
perl-json
…
perl-libwww-perl
…
perl-list-moreutils
…
perl-log-log4perl
…
perl-lwp
…
perl-lwp-mediatypes
…
perl-lwp-protocol-https
…
perl-math-cdf
…
perl-math-cephes
…
perl-math-matrixreal
…
perl-module-build
…
perl-module-implementation
…
perl-module-runtime
…
perl-module-runtime-conflicts
…
perl-moose
…
perl-mozilla-ca
…
perl-mro-compat
…
perl-namespace-clean
…
perl-net-http
…
perl-net-scp-expect
…
perl-net-ssleay
…
perl-package-deprecationmanager
…
perl-package-stash
…
perl-package-stash-xs
…
perl-padwalker
…
perl-parallel-forkmanager
…
perl-params-util
…
perl-parse-recdescent
…
perl-pdf-api2
…
perl-pegex
…
perl-perl6-slurp
…
perl-perlio-gzip
…
perl-perlio-utf8-strict
…
perl-soap-lite
…
perl-star-fusion
…
perl-statistics-descriptive
…
perl-statistics-pca
…
perl-sub-exporter
…
perl-sub-exporter-progressive
…
perl-sub-identify
…
perl-sub-install
…
perl-sub-name
…
perl-sub-uplevel
…
perl-svg
…
perl-swissknife
…
perl-task-weaken
…
perl-term-readkey
…
perl-test-cleannamespaces
…
perl-test-deep
…
perl-test-differences
…
perl-test-exception
…
perl-test-fatal
…
perl-test-memory-cycle
…
perl-test-most
…
perl-test-needs
…
perl-test-requires
…
perl-test-requiresinternet
…
perl-test-warn
…
perl-test-warnings
…
perl-text-csv
…
perl-text-diff
…
perl-text-simpletable
…
perl-text-soundex
…
perl-text-unidecode
…
perl-time-hires
…
perl-time-piece
…
perl-try-tiny
…
perl-uri
…
perl-uri-escape
…
perl-version
…
perl-want
…
perl-www-robotrules
…
perl-xml-libxml
…
perl-xml-parser
…
perl-xml-parser-lite
…
perl-xml-simple
…
perl-yaml-libyaml
…
petsc
Add PETSc 3.10.1 to PETSc's spackage file (#9382)
2018-09-28 10:46:21 -07:00
pexsi
…
pfft
…
pflotran
…
pfunit
…
pgdspider
…
pgi
…
pgmath
…
phantompeakqualtools
…
phast
…
phasta
…
phist
…
phylip
…
picard
…
picsarlite
Spack package for PICSARlite (#9288)
2018-09-24 11:12:01 -06:00
pidx
…
pigz
…
pilon
…
pindel
…
piranha
…
pism
…
pixman
…
pkg-config
…
pkgconf
…
planck-likelihood
…
plasma
…
platypus
…
plink
…
plplot
…
plumed
plumed: updating plumed to latest version (#9227)
2018-09-14 17:13:22 -07:00
pmgr-collective
…
pmix
…
pnfft
…
pngwriter
…
pnmpi
…
poamsa
…
pocl
…
polymake
…
poppler
…
poppler-data
…
porta
…
portage
…
portcullis
portcullis: new package starting at 1.1.2 (#9218)
2018-09-14 15:55:58 -07:00
postgresql
…
ppl
…
prank
…
precice
…
presentproto
…
preseq
…
price
…
primer3
…
prinseq-lite
…
printproto
…
prng
…
probconsrna
…
prodigal
…
proj
…
protobuf
…
proxymngr
…
pruners-ninja
…
ps-lite
…
psi4
…
pslib
…
psm
…
psmc
…
pstreams
…
pugixml
…
pumi
…
pv
…
pvm
…
pxz
…
py-3to2
…
py-4suite-xml
…
py-abipy
…
py-adios
…
py-affine
…
py-alabaster
…
py-apache-libcloud
…
py-apipkg
…
py-appdirs
…
py-appnope
…
py-apscheduler
…
py-argcomplete
…
py-argparse
…
py-ase
…
py-asn1crypto
…
py-astroid
…
py-astropy
…
py-atomicwrites
…
py-attrs
…
py-autopep8
…
py-avro
…
py-avro-json-serializer
…
py-babel
…
py-backcall
…
py-backports-abc
…
py-backports-functools-lru-cache
…
py-backports-shutil-get-terminal-size
…
py-backports-ssl-match-hostname
…
py-basemap
…
py-bcbio-gff
…
py-beautifulsoup4
…
py-binwalk
…
py-biom-format
…
py-biopython
…
py-bitarray
…
py-bitstring
…
py-bleach
…
py-blessings
…
py-bokeh
…
py-boltons
…
py-bottleneck
…
py-breakseq2
…
py-brian
…
py-brian2
…
py-bsddb3
…
py-bx-python
…
py-cartopy
…
py-cclib
…
py-cdat-lite
…
py-cdo
…
py-certifi
…
py-cffi
…
py-chardet
…
py-checkm-genome
…
py-cheetah
…
py-click
…
py-cligj
…
py-cloudpickle
…
py-cnvkit
…
py-cogent
Feature/py pycogent New-Version (#9095)
2018-09-04 14:34:18 -05:00
py-colorama
…
py-colormath
py-colormath: new version, requires newer networkx (#9237)
2018-09-14 10:35:45 -07:00
py-configparser
…
py-counter
…
py-coverage
…
py-cpuinfo
…
py-crispresso
…
py-crossmap
…
py-cryptography
…
py-csvkit
…
py-current
…
py-cutadapt
…
py-cvxopt
…
py-cycler
…
py-cython
…
py-dask
…
py-dateutil
…
py-dbf
…
py-decorator
py-decorator: new version (#9240)
2018-09-14 15:51:43 -07:00
py-deeptools
…
py-dendropy
…
py-dill
…
py-discover
…
py-dlcpar
…
py-docopt
…
py-docutils
…
py-doxypy
…
py-doxypypy
…
py-dryscrape
…
py-dxchange
…
py-dxfile
…
py-easybuild-easyblocks
…
py-easybuild-easyconfigs
…
py-easybuild-framework
…
py-edffile
…
py-editdistance
…
py-elasticsearch
…
py-elephant
…
py-emcee
…
py-entrypoints
…
py-enum34
…
py-epydoc
…
py-espresso
py-espresso: apply patch to v4.0.0 only (#9196)
2018-09-13 10:00:21 +00:00
py-espressopp
…
py-et-xmlfile
…
py-eventlet
…
py-execnet
…
py-fastaindex
…
py-fasteners
…
py-faststructure
…
py-filelock
py-filelock: new package (#9136)
2018-08-31 11:21:55 -07:00
py-fiscalyear
…
py-flake8
…
py-flake8-polyfill
…
py-flask
…
py-flask-compress
…
py-flask-socketio
…
py-flexx
…
py-fn
…
py-fparser
…
py-funcsigs
…
py-functools32
…
py-future
…
py-futures
…
py-gdbgui
…
py-genders
…
py-genshi
…
py-gevent
…
py-git2
…
py-git-review
…
py-gnuplot
…
py-goatools
…
py-gpaw
…
py-greenlet
…
py-griddataformats
…
py-guidata
…
py-guiqwt
…
py-h5py
py-h5py: add version 2.8.0 (#9231)
2018-09-14 15:56:44 -07:00
py-html2text
…
py-html5lib
…
py-htseq
…
py-httpbin
…
py-hypothesis
…
py-idna
…
py-igraph
…
py-illumina-utils
…
py-imageio
…
py-imagesize
…
py-iminuit
…
py-importlib
…
py-ipaddress
…
py-ipdb
…
py-ipykernel
…
py-ipython
…
py-ipython-genutils
…
py-ipywidgets
…
py-isort
…
py-itsdangerous
…
py-jdcal
…
py-jedi
…
py-jinja2
…
py-joblib
…
py-jpype
…
py-jsonschema
…
py-junit-xml
…
py-jupyter-client
…
py-jupyter-console
…
py-jupyter-core
…
py-jupyter-notebook
…
py-keras
…
py-kiwisolver
…
py-lark-parser
…
py-latexcodec
…
py-lazy
…
py-lazy-object-proxy
…
py-lazy-property
…
py-lazyarray
…
py-libconf
…
py-libensemble
Update py-libensemble package to v0.3.0 (#9210)
2018-09-14 17:15:31 -07:00
py-line-profiler
…
py-linecache2
…
py-lit
…
py-llvmlite
…
py-lmfit
…
py-localcider
…
py-locket
…
py-lockfile
…
py-logilab-common
…
py-lrudict
…
py-lxml
…
py-lzstring
…
py-macholib
…
py-machotools
…
py-macs2
…
py-maestrowf
py-maestrowf: Addition of new releases. (#9135)
2018-09-04 14:33:55 -05:00
py-mako
…
py-mappy
…
py-markdown
py-markdown: fix url and hashes (#9235)
2018-09-14 15:51:20 -07:00
py-markupsafe
…
py-matplotlib
py-matplotlib: incorporate 8532 w/ version range (#9151)
2018-09-03 20:34:41 -05:00
py-mccabe
…
py-mdanalysis
…
py-meep
…
py-memory-profiler
…
py-methylcode
…
py-mg-rast-tools
…
py-misopy
…
py-mistune
…
py-mock
…
py-moltemplate
…
py-mongo
…
py-monotonic
…
py-monty
…
py-more-itertools
…
py-mpi4py
…
py-mpmath
…
py-multiprocess
…
py-multiqc
py-multiqc: needs newer py-spectra (#9226)
2018-09-14 15:52:29 -07:00
py-mx
…
py-mxnet
…
py-myhdl
…
py-mysqldb1
…
py-natsort
…
py-nbconvert
…
py-nbformat
…
py-neo
…
py-nestle
…
py-netcdf4
…
py-netifaces
…
py-networkx
py-networkx: new version (#9241)
2018-09-14 15:52:02 -07:00
py-nose
…
py-nosexcover
…
py-numba
…
py-numexpr
…
py-numexpr3
…
py-numpy
…
py-numpydoc
…
py-olefile
…
py-ont-fast5-api
…
py-openpmd-validator
…
py-openpyxl
…
py-openslide-python
…
py-opentuner
…
py-ordereddict
…
py-oset
…
py-owslib
…
py-packaging
…
py-palettable
…
py-pandas
…
py-paramiko
…
py-partd
…
py-pathlib2
…
py-pathos
…
py-pathspec
…
py-patsy
…
py-pbr
…
py-pep8-naming
…
py-perf
…
py-performance
…
py-periodictable
…
py-petsc4py
…
py-pexpect
…
py-phonopy
…
py-pickleshare
…
py-picrust
Feature/py picrust (#9184)
2018-09-14 17:24:17 -07:00
py-pil
…
py-pillow
…
py-pip
…
py-pipits
…
py-pkgconfig
…
py-plotly
…
py-pluggy
…
py-ply
…
py-pmw
…
py-poster
…
py-pox
…
py-ppft
…
py-prettytable
…
py-proj
…
py-projectq
…
py-prompt-toolkit
…
py-protobuf
…
py-psutil
…
py-psyclone
…
py-ptyprocess
…
py-pudb
…
py-py
…
py-py2bit
…
py-py2cairo
…
py-py2neo
…
py-py4j
…
py-pyani
…
py-pyasn1
…
py-pybedtools
…
py-pybigwig
…
py-pybind11
py-pybind11: add version 2.2.4 (#9355)
2018-09-26 19:19:46 -07:00
py-pybtex
…
py-pybtex-docutils
…
py-pychecker
…
py-pycodestyle
…
py-pycparser
…
py-pycrypto
…
py-pycurl
…
py-pydatalog
…
py-pydispatcher
…
py-pydot
…
py-pyelftools
…
py-pyepsg
…
py-pyfaidx
…
py-pyfasta
…
py-pyfftw
…
py-pyflakes
…
py-pygdbmi
…
py-pygments
…
py-pygobject
…
py-pygpu
…
py-pygtk
…
py-pylint
…
py-pymatgen
…
py-pyminifier
…
py-pymol
…
py-pympler
…
py-pymysql
py-pymysql: new package (#9122)
2018-09-03 20:50:39 -05:00
py-pynn
…
py-pypar
…
py-pyparsing
…
py-pypeflow
…
py-pyprof2html
…
py-pyqi
…
py-pyqt
…
py-pyrad
…
py-pysam
…
py-pyscaf
…
py-pyserial
…
py-pyshp
…
py-pyside
…
py-pysocks
…
py-pysqlite
…
py-pytables
…
py-pytest
…
py-pytest-cov
…
py-pytest-flake8
…
py-pytest-httpbin
…
py-pytest-mock
…
py-pytest-runner
…
py-pytest-xdist
…
py-python-daemon
…
py-python-engineio
…
py-python-gitlab
…
py-python-levenshtein
…
py-python-socketio
…
py-pythonqwt
…
py-pytorch
…
py-pytz
…
py-pyutilib
…
py-pyvcf
…
py-pywavelets
…
py-pyyaml
added version for kull support (#9141)
2018-09-03 20:36:15 -05:00
py-qtawesome
…
py-qtconsole
…
py-qtpy
…
py-quantities
…
py-quast
…
py-radical-utils
…
py-ranger
…
py-rasterio
…
py-readme-renderer
…
py-regex
…
py-reportlab
…
py-requests
…
py-requests-toolbelt
…
py-restview
…
py-rope
…
py-rpy2
…
py-rsa
…
py-rseqc
…
py-rtree
…
py-saga-python
…
py-scandir
…
py-scientificpython
…
py-scikit-image
…
py-scikit-learn
…
py-scipy
…
py-seaborn
…
py-setuptools
…
py-setuptools-git
…
py-setuptools-scm
…
py-sfepy
…
py-sh
…
py-shapely
…
py-shiboken
…
py-simplegeneric
…
py-simplejson
…
py-singledispatch
…
py-sip
…
py-six
…
py-slepc4py
…
py-slurm-pipeline
…
py-sncosmo
…
py-snowballstemmer
…
py-snuggs
…
py-spectra
py-spectra: new version (#9224)
2018-09-14 16:59:50 -07:00
py-spefile
…
py-spglib
…
py-sphinx
…
py-sphinx-bootstrap-theme
…
py-sphinx-rtd-theme
…
py-sphinxcontrib-bibtex
…
py-sphinxcontrib-programoutput
…
py-sphinxcontrib-websupport
…
py-spyder
…
py-spykeutils
…
py-sqlalchemy
…
py-statsmodels
…
py-stevedore
…
py-storm
…
py-subprocess32
…
py-symengine
…
py-symfit
…
py-sympy
…
py-tabulate
…
py-tappy
…
py-terminado
…
py-testinfra
…
py-tetoolkit
…
py-theano
…
py-tifffile
…
py-toml
…
py-tomopy
…
py-toolz
…
py-tornado
…
py-tqdm
…
py-traceback2
…
py-traitlets
…
py-tuiview
…
py-twisted
…
py-typing
…
py-tzlocal
…
py-udunits
…
py-umi-tools
…
py-unittest2
…
py-unittest2py3k
…
py-urllib3
…
py-urwid
…
py-vcversioner
…
py-virtualenv
…
py-virtualenv-clone
…
py-virtualenvwrapper
…
py-vmd-python
…
py-vsc-base
…
py-vsc-install
…
py-wcsaxes
…
py-wcwidth
…
py-webkit-server
…
py-weblogo
…
py-werkzeug
…
py-wheel
…
py-widgetsnbextension
…
py-wrapt
…
py-xarray
…
py-xattr
…
py-xlrd
…
py-xlsxwriter
…
py-xmlrunner
…
py-xopen
…
py-xpyb
…
py-xvfbwrapper
…
py-yamlreader
…
py-yapf
…
py-yt
…
py-zmq
…
py-zope-event
…
py-zope-interface
…
python
Build Python 3.7 with external libffi. (#9245)
2018-09-14 17:07:13 -07:00
qbank
…
qbox
…
qhull
…
qmcpack
…
qmd-progress
…
qorts
…
qrupdate
…
qt
qt: fix dbus builds (#9315)
2018-09-25 11:33:19 -05:00
qt-creator
…
qtgraph
…
qthreads
…
quantum-espresso
…
quinoa
Charmpp: rename charm to charmpp according to ++ conventions (#9216)
2018-09-14 17:01:07 -07:00
qwt
…
r
…
r-a4
…
r-a4base
…
r-a4classif
…
r-a4core
…
r-a4preproc
…
r-a4reporting
…
r-abadata
…
r-abaenrichment
…
r-abind
…
r-absseq
…
r-acde
…
r-acepack
…
r-acgh
…
r-acme
…
r-ada
…
r-adabag
…
r-ade4
…
r-adegenet
…
r-adsplit
…
r-aer
…
r-affxparser
…
r-affy
…
r-affycomp
…
r-affycompatible
…
r-affycontam
…
r-affycoretools
…
r-affydata
…
r-affyexpress
…
r-affyilm
…
r-affyio
…
r-affypdnn
…
r-affyplm
…
r-affyqcreport
…
r-affyrnadegradation
…
r-agdex
…
r-agilp
…
r-agimicrorna
…
r-aims
…
r-aldex2
…
r-allelicimbalance
…
r-alpine
…
r-als
…
r-alsace
…
r-altcdfenvs
…
r-amap
…
r-ampliqueso
…
r-analysispageserver
…
r-anaquin
…
r-aneufinder
…
r-aneufinderdata
…
r-animation
New package: r-animation (#9314)
2018-09-24 11:28:05 -07:00
r-annaffy
…
r-annotate
…
r-annotationdbi
…
r-annotationfilter
…
r-annotationforge
…
r-annotationhub
…
r-ape
…
r-argparse
…
r-assertthat
…
r-backports
…
r-bamsignals
…
r-base64
…
r-base64enc
…
r-bbmisc
…
r-beanplot
…
r-bh
…
r-biasedurn
…
r-bindr
…
r-bindrcpp
…
r-biobase
…
r-biocgenerics
…
r-biocinstaller
…
r-biocparallel
r-biocparallel: new link dependency added in last version (#9274)
2018-09-28 13:56:46 -05:00
r-biocstyle
…
r-biom-utils
…
r-biomart
r-biomart: new version; (#9058)
2018-09-03 21:03:47 -05:00
r-biomformat
…
r-biostrings
…
r-biovizbase
…
r-bit
…
r-bit64
…
r-bitops
…
r-blob
…
r-bookdown
…
r-boot
…
r-brew
…
r-broom
…
r-bsgenome
…
r-bumphunter
…
r-c50
…
r-callr
…
r-car
…
r-caret
…
r-category
…
r-catools
…
r-cdcfluview
…
r-cellranger
…
r-cghflasso
…
r-checkmate
…
r-checkpoint
…
r-chemometrics
Tanim (#9158)
2018-09-07 16:00:52 -05:00
r-chron
…
r-circlize
…
r-class
…
r-classint
…
r-cli
…
r-clipr
…
r-cluster
…
r-clusterprofiler
…
r-cner
…
r-coda
…
r-codetools
…
r-coin
…
r-colorspace
…
r-complexheatmap
…
r-corpcor
…
r-corrplot
…
r-covr
…
r-cowplot
…
r-crayon
…
r-crosstalk
…
r-ctc
…
r-cubature
…
r-cubist
…
r-curl
…
r-data-table
…
r-dbi
…
r-dbplyr
…
r-delayedarray
…
r-deldir
…
r-dendextend
…
r-deoptim
…
r-deoptimr
…
r-deseq
…
r-deseq2
r-deseq2: new version (#9062)
2018-09-03 21:03:08 -05:00
r-desolve
…
r-devtools
…
r-diagrammer
…
r-dicekriging
…
r-dichromat
…
r-diffusionmap
…
r-digest
…
r-diptest
…
r-dirichletmultinomial
…
r-dismo
…
r-dnacopy
…
r-do-db
…
r-domc
…
r-doparallel
…
r-dorng
…
r-dose
…
r-downloader
…
r-dplyr
new versions of r-dplyr,r-plogr,r-rlang (#9313)
2018-09-24 11:22:04 -07:00
r-dt
…
r-dtw
…
r-dygraphs
…
r-e1071
…
r-edger
…
r-ellipse
…
r-ensembldb
…
r-ergm
…
r-evaluate
…
r-expm
…
r-factoextra
…
r-factominer
…
r-fastcluster
…
r-fastmatch
…
r-ff
…
r-fftwtools
…
r-fgsea
…
r-filehash
…
r-findpython
…
r-fit-models
…
r-flashclust
…
r-flexclust
…
r-flexmix
…
r-fnn
Tanim (#9158)
2018-09-07 16:00:52 -05:00
r-forcats
…
r-foreach
…
r-forecast
…
r-foreign
…
r-formatr
…
r-formula
…
r-fpc
…
r-fracdiff
…
r-futile-logger
…
r-futile-options
…
r-gbm
…
r-gcrma
…
r-gdata
…
r-gdsfmt
…
r-geiger
…
r-genefilter
…
r-genelendatabase
…
r-geneplotter
…
r-genie3
…
r-genomeinfodb
…
r-genomeinfodbdata
…
r-genomicalignments
r-genomicalignments: new version (#9055)
2018-09-03 21:04:22 -05:00
r-genomicfeatures
…
r-genomicranges
…
r-geomorph
…
r-geoquery
…
r-geosphere
…
r-getopt
…
r-getoptlong
…
r-ggally
…
r-ggbio
…
r-ggdendro
…
r-ggjoy
…
r-ggmap
…
r-ggplot2
…
r-ggpubr
…
r-ggrepel
…
r-ggridges
…
r-ggsci
…
r-ggvis
…
r-gistr
…
r-git2r
…
r-glimma
…
r-glmnet
…
r-globaloptions
…
r-glue
…
r-gmodels
…
r-gmp
…
r-go-db
…
r-googlevis
…
r-goplot
…
r-gosemsim
…
r-goseq
…
r-gostats
…
r-gplots
…
r-graph
…
r-gridbase
…
r-gridextra
…
r-gseabase
…
r-gss
…
r-gsubfn
…
r-gtable
…
r-gtools
…
r-gtrellis
…
r-gviz
…
r-haven
…
r-hexbin
…
r-highr
…
r-hmisc
…
r-hms
…
r-htmltable
…
r-htmltools
…
r-htmlwidgets
…
r-httpuv
…
r-httr
…
r-hwriter
…
r-hypergraph
…
r-ica
…
r-igraph
…
r-illuminaio
…
r-impute
…
r-influencer
…
r-inline
…
r-interactivedisplaybase
…
r-ipred
…
r-iranges
…
r-irdisplay
…
r-irkernel
…
r-irlba
…
r-iso
…
r-iterators
…
r-janitor
…
r-jaspar2018
…
r-jomo
…
r-jpeg
…
r-jsonlite
…
r-kegg-db
…
r-kegggraph
…
r-keggrest
…
r-kernlab
…
r-kernsmooth
…
r-kknn
…
r-knitr
…
r-ks
Tanim (#9158)
2018-09-07 16:00:52 -05:00
r-labeling
…
r-lambda-r
…
r-laplacesdemon
…
r-lars
Tanim (#9158)
2018-09-07 16:00:52 -05:00
r-lattice
…
r-latticeextra
…
r-lava
…
r-lazyeval
…
r-leaflet
…
r-leaps
…
r-learnbayes
…
r-lhs
…
r-limma
…
r-lme4
…
r-lmtest
…
r-locfit
…
r-log4r
…
r-lpsolve
…
r-lsei
…
r-lubridate
…
r-magic
…
r-magrittr
…
r-makecdfenv
…
r-maldiquant
…
r-mapproj
…
r-maps
…
r-maptools
…
r-markdown
…
r-mass
…
r-matr
…
r-matrix
…
r-matrixmodels
…
r-matrixstats
…
r-mclust
…
r-mcmcglmm
…
r-mco
…
r-mda
…
r-memoise
…
r-mergemaid
…
r-methodss3
…
r-mgcv
…
r-mgraster
…
r-mice
…
r-mime
…
r-minfi
…
r-minqa
…
r-misc3d
r-misc3d: add a real homepage (#9283)
2018-09-28 13:54:50 -05:00
r-mitml
…
r-mixtools
…
r-mlbench
…
r-mlinterfaces
…
r-mlr
…
r-mlrmbo
…
r-mmwrweek
…
r-mnormt
…
r-modelmetrics
…
r-modelr
…
r-modeltools
…
r-mpm
…
r-msnbase
…
r-multcomp
…
r-multicool
Tanim (#9158)
2018-09-07 16:00:52 -05:00
r-multtest
…
r-munsell
…
r-mvtnorm
…
r-mzid
…
r-mzr
…
r-nanotime
…
r-ncbit
…
r-ncdf4
…
r-network
…
r-networkd3
…
r-nlme
…
r-nloptr
r-nloptr: Explicit depends_on(nlopt). Previously there was a hidden d… (#9176)
2018-09-14 08:11:16 -05:00
r-nmf
…
r-nnet
…
r-nnls
…
r-nor1mix
…
r-np
…
r-numderiv
…
r-oligoclasses
…
r-oo
…
r-openssl
…
r-org-hs-eg-db
…
r-organismdbi
…
r-packrat
…
r-pacman
…
r-pamr
…
r-pan
…
r-parallelmap
…
r-paramhelpers
…
r-party
…
r-partykit
…
r-pathview
…
r-pbapply
…
r-pbdzmq
…
r-pbkrtest
…
r-pcamethods
…
r-pcapp
Tanim (#9158)
2018-09-07 16:00:52 -05:00
r-permute
…
r-pfam-db
…
r-phangorn
…
r-phantompeakqualtools
…
r-phyloseq
…
r-picante
…
r-pkgconfig
…
r-pkgmaker
…
r-plogr
new versions of r-dplyr,r-plogr,r-rlang (#9313)
2018-09-24 11:22:04 -07:00
r-plot3d
…
r-plotly
…
r-plotrix
…
r-pls
…
r-plyr
…
r-pmcmr
…
r-png
…
r-powerlaw
…
r-prabclus
…
r-praise
…
r-preprocesscore
…
r-prettyunits
…
r-proc
…
r-processx
new package: r-processx (#9342)
2018-09-26 19:12:06 -07:00
r-prodlim
…
r-progress
…
r-protgenerics
…
r-proto
…
r-proxy
…
r-pryr
…
r-ps
new package: r-ps (#9341)
2018-09-26 19:08:55 -07:00
r-psych
…
r-ptw
…
r-purrr
…
r-quadprog
…
r-quantmod
…
r-quantreg
…
r-quantro
…
r-qvalue
…
r-r6
…
r-randomforest
…
r-ranger
…
r-rappdirs
…
r-raster
…
r-rbgl
…
r-rbokeh
…
r-rcolorbrewer
…
r-rcpp
…
r-rcpparmadillo
…
r-rcppblaze
…
r-rcppcctz
…
r-rcppcnpy
…
r-rcppeigen
…
r-rcppprogress
…
r-rcurl
…
r-rda
…
r-readr
…
r-readxl
…
r-registry
…
r-rematch
…
r-reordercluster
…
r-reportingtools
…
r-repr
…
r-reprex
…
r-reshape
…
r-reshape2
…
r-rex
…
r-rgdal
…
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…
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…
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…
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…
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…
r-rhdf5
…
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…
r-rinside
…
r-rjags
…
r-rjava
…
r-rjson
…
r-rjsonio
…
r-rlang
new versions of r-dplyr,r-plogr,r-rlang (#9313)
2018-09-24 11:22:04 -07:00
r-rmarkdown
…
r-rminer
…
r-rmpfr
…
r-rmpi
…
r-rmysql
…
r-rngtools
…
r-robustbase
…
r-rocr
…
r-rodbc
…
r-rots
r-rots: fix package type (#9344)
2018-09-28 13:11:09 -05:00
r-roxygen2
…
r-rpart
…
r-rpart-plot
…
r-rpostgresql
…
r-rprojroot
…
r-rsamtools
…
r-rsnns
…
r-rsolnp
…
r-rsqlite
…
r-rstan
…
r-rstudioapi
…
r-rtracklayer
…
r-rtsne
…
r-rvcheck
…
r-rvest
…
r-rzmq
…
r-s4vectors
…
r-samr
…
r-sandwich
…
r-scales
…
r-scatterplot3d
…
r-sdmtools
…
r-segmented
…
r-selectr
…
r-seqinr
…
r-seqlogo
…
r-seurat
…
r-sf
…
r-sfsmisc
…
r-shape
…
r-shiny
…
r-shinydashboard
…
r-shortread
…
r-siggenes
…
r-simpleaffy
…
r-sm
…
r-smoof
…
r-sn
…
r-snow
…
r-snowfall
…
r-snprelate
…
r-som
Tanim (#9158)
2018-09-07 16:00:52 -05:00
r-somaticsignatures
…
r-sourcetools
…
r-sp
…
r-sparsem
…
r-spatial
…
r-spdep
…
r-speedglm
…
r-spem
…
r-splitstackshape
…
r-sqldf
…
r-squash
…
r-stanheaders
…
r-statmod
…
r-statnet-common
…
r-stringi
…
r-stringr
…
r-strucchange
…
r-subplex
…
r-summarizedexperiment
r-summarizedexperiment: new version (#9054)
2018-09-04 14:34:45 -05:00
r-survey
…
r-survival
…
r-sva
…
r-tarifx
…
r-tclust
…
r-tensora
…
r-testit
…
r-testthat
…
r-tfbstools
…
r-tfmpvalue
…
r-th-data
…
r-threejs
…
r-tibble
…
r-tidycensus
…
r-tidyr
…
r-tidyselect
…
r-tidyverse
…
r-tiff
…
r-tigris
…
r-timedate
…
r-tmixclust
…
r-topgo
…
r-trimcluster
…
r-truncnorm
…
r-trust
…
r-tseries
…
r-tsne
…
r-ttr
…
r-udunits2
…
r-units
…
r-utf8
…
r-utils
…
r-uuid
…
r-variantannotation
…
r-varselrf
…
r-vcd
…
r-vegan
…
r-vgam
…
r-vipor
…
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…
r-viridislite
…
r-visnetwork
…
r-vsn
…
r-whisker
…
r-withr
…
r-xde
…
r-xgboost
…
r-xlconnect
…
r-xlconnectjars
…
r-xlsx
…
r-xlsxjars
…
r-xmapbridge
…
r-xml
…
r-xml2
…
r-xtable
…
r-xts
…
r-xvector
…
r-yaml
…
r-yapsa
…
r-yaqcaffy
…
r-yarn
…
r-zlibbioc
…
r-zoo
…
racon
…
raft
…
ragel
…
raja
…
randfold
…
random123
…
randrproto
…
range-v3
…
rankstr
…
rapidjson
…
ravel
…
raxml
…
ray
…
rclone
new package: rclone (#9268)
2018-09-18 18:39:07 -07:00
rdma-core
Update rdma-core : new version and conflict with intel (#9255)
2018-09-15 19:42:45 -05:00
rdp-classifier
…
re2c
…
readfq
…
readline
…
recordproto
…
redset
…
redundans
…
relion
…
rempi
…
rename
…
rendercheck
…
renderproto
…
repeatmasker
…
resourceproto
…
revbayes
…
rgb
…
rhash
…
rlwrap
…
rmats
rmats: new package starting at 4.0.2 (#9243)
2018-09-14 14:54:26 -07:00
rmlab
…
rna-seqc
…
rngstreams
…
rockstar
…
root
…
rose
…
ross
…
rr
…
rsbench
…
rsem
…
rstart
…
rsync
…
rtags
…
rtax
…
ruby
…
ruby-gnuplot
…
ruby-narray
…
ruby-ronn
…
ruby-rubyinline
…
ruby-svn2git
…
ruby-terminal-table
…
rust
…
rust-bindgen
…
sabre
…
sailfish
…
salmon
…
sambamba
…
samblaster
…
samrai
…
samtools
…
sandbox
…
sas
…
satsuma2
…
savanna
…
saws
…
sbt
…
scala
…
scalasca
…
scalpel
…
scan-for-matches
…
scons
…
scorec-core
…
scorep
…
scotch
…
scr
…
screen
…
scripts
…
scrnsaverproto
…
sctk
…
sdl2
…
sdl2-image
…
sed
…
seqan
…
seqprep
…
seqtk
…
serf
…
sessreg
…
setxkbmap
…
sga
…
shapeit
…
shared-mime-info
…
shiny-server
…
shocklibs
…
shoremap
…
shortbred
…
shortstack
…
showfont
…
shuffile
…
sickle
…
siesta
…
signalp
…
signify
…
silo
Fix two dependencies with silo. (#9153)
2018-09-03 16:43:00 +02:00
simplemoc
…
simul
…
simulationio
…
singularity
singularity: new version
2018-08-31 08:47:24 -07:00
skilion-onedrive
Onedrive: a new package. (#9130)
2018-09-04 14:35:49 -05:00
sleef
…
slepc
petsc: add new versions 3.9.4 and 3.10.0 (#9319)
2018-09-24 23:57:38 -05:00
slurm
Added slurm 17.11 and 18.08 (#9345)
2018-09-27 13:34:41 -07:00
smalt
…
smproxy
…
snakemake
…
snap
…
snap-berkeley
…
snap-korf
…
snappy
msgpack-c, snappy: explicitly depend on googletest (#9167)
2018-09-03 20:25:17 -05:00
snbone
…
sniffles
…
snpeff
…
snphylo
…
snptest
…
soap2
…
soapdenovo2
…
soapdenovo-trans
…
soapindel
…
soapsnp
…
sofa-c
…
somatic-sniper
…
sortmerna
…
sosflow
…
sowing
…
sox
…
spades
…
span-lite
…
spark
…
sparsehash
…
sparta
…
spdlog
Add newer versions of spdlog (#9290)
2018-09-20 17:53:15 +02:00
spectrum-mpi
…
speex
…
spglib
…
sph2pipe
…
spherepack
…
spindle
…
spot
…
sqlite
Build Python 3.7 with external libffi. (#9245)
2018-09-14 17:07:13 -07:00
sqlitebrowser
…
squid
…
sra-toolkit
…
sspace-longread
…
sspace-standard
…
sst-dumpi
…
sst-macro
sst-macro package: add versions and variants (#9271)
2018-09-18 19:06:13 -07:00
stacks
…
staden-io-lib
…
star
star - added latest versions with shasum (#9257)
2018-09-16 15:44:33 -05:00
star-ccm-plus
…
startup-notification
…
stat
…
stc
…
steps
steps: new package starting at 3.3 (#9173)
2018-09-11 14:43:15 +02:00
stow
…
strace
…
stream
…
strelka
…
stress
…
string-view-lite
…
stringtie
…
structure
…
sublime-text
…
subread
…
subversion
…
suite-sparse
…
sumaclust
…
sundials
SUNDIALS: add new versions, update hashes, and apply clang fix (#9115)
2018-08-31 12:14:15 -07:00
superlu
…
superlu-dist
superlu_dist: (master) has cxx11 sources - so update make.inc to list cxx11 compilers (#9316)
2018-09-24 21:53:14 -05:00
superlu-mt
…
supernova
…
sw4lite
sw4lite: add v1.1 (#9289)
2018-09-19 13:30:28 -06:00
swap-assembler
…
swarm
…
swfft
…
swiftsim
…
swig
…
symengine
…
sympol
…
sz
…
tabix
…
talass
new package: TALASS (#9326)
2018-09-26 18:15:47 -07:00
talloc
…
tantan
…
tar
…
targetp
…
task
…
taskd
…
tasmanian
…
tassel
…
tau
…
tcl
Set libs property for tcl and tk (#9372)
2018-09-27 19:34:18 -07:00
tcl-itcl
…
tcl-tcllib
…
tcl-tclxml
…
tclap
…
tcoffee
…
tcptrace
…
tcsh
…
tealeaf
…
templight
…
templight-tools
…
tetgen
…
tethex
…
texinfo
…
texlive
…
the-platinum-searcher
…
the-silver-searcher
…
thrift
…
thrust
…
tig
…
tinyxml
…
tinyxml2
…
tioga
…
tk
Set libs property for tcl and tk (#9372)
2018-09-27 19:34:18 -07:00
tmalign
…
tmhmm
…
tmux
…
tmuxinator
…
tophat
…
tppred
…
transabyss
…
transdecoder
…
transposome
…
transset
…
trapproto
…
tree
…
trf
…
triangle
…
trilinos
trilinos: disable xlf_tpetra.patch for trilinos@develop (#9193)
2018-09-08 23:51:16 -05:00
trimgalore
…
trimmomatic
…
trinity
trinity: full dependencies (#9064)
2018-09-04 14:35:06 -05:00
trnascan-se
…
turbine
…
turbomole
…
tut
…
twm
…
tycho2
…
typhon
…
typhonio
…
uberftp
…
ucx
new package versions: ucx, libhio, and hwloc (#9365)
2018-09-26 18:53:54 -07:00
udunits2
…
ufo-core
…
ufo-filters
…
umpire
…
unblur
…
uncrustify
…
unibilium
…
unison
…
units
…
unixodbc
…
unuran
…
unzip
…
usearch
…
util-linux
…
util-macros
…
uuid
…
valgrind
…
vampirtrace
…
vardictjava
…
varscan
…
vc
…
vcftools
…
vcsh
…
vdt
…
vecgeom
…
veclibfort
…
vegas2
…
veloc
…
velvet
…
verilator
…
verrou
…
videoproto
…
viennarna
…
viewres
…
vim
Vim: add version 8.1.0338 (#9155)
2018-09-01 08:12:14 -05:00
virtualgl
…
visit
…
vizglow
…
vmatch
…
voropp
…
votca-csg
…
votca-ctp
…
votca-tools
…
votca-xtp
…
vpfft
…
vpic
…
vsearch
…
vt
…
vtk
VTK package: don't require "+llvm" for mesa dependency (#9256)
2018-09-26 11:20:01 -07:00
vtkh
…
vtkm
…
wannier90
…
wcslib
…
wget
…
wgsim
…
windowswmproto
…
wireshark
…
workrave
…
wt
…
wx
…
wxpropgrid
…
x11perf
…
xapian-core
…
xauth
…
xbacklight
…
xbiff
…
xbitmaps
…
xbraid
…
xcalc
…
xcb-demo
…
xcb-proto
…
xcb-util
…
xcb-util-cursor
…
xcb-util-errors
…
xcb-util-image
…
xcb-util-keysyms
…
xcb-util-renderutil
…
xcb-util-wm
…
xcb-util-xrm
…
xclip
…
xclipboard
…
xclock
…
xcmiscproto
…
xcmsdb
…
xcompmgr
…
xconsole
…
xcursor-themes
…
xcursorgen
…
xdbedizzy
…
xditview
…
xdm
…
xdpyinfo
…
xdriinfo
…
xedit
…
xerces-c
…
xev
…
xextproto
…
xeyes
…
xf86bigfontproto
…
xf86dga
…
xf86dgaproto
…
xf86driproto
…
xf86miscproto
…
xf86rushproto
…
xf86vidmodeproto
…
xfd
…
xfindproxy
…
xfontsel
…
xfs
…
xfsinfo
…
xfwp
…
xgamma
…
xgc
…
xhmm
…
xhost
…
xineramaproto
…
xinit
…
xinput
…
xios
…
xkbcomp
…
xkbdata
…
xkbevd
…
xkbprint
…
xkbutils
…
xkeyboard-config
…
xkill
…
xload
…
xlogo
…
xlsatoms
…
xlsclients
…
xlsfonts
…
xmag
…
xman
…
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…
xmh
…
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…
xmlto
…
xmodmap
…
xmore
…
xorg-cf-files
…
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…
xorg-gtest
…
xorg-server
…
xorg-sgml-doctools
…
xphelloworld
…
xplor-nih
…
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…
xpr
…
xprehashprinterlist
…
xprop
…
xproto
…
xproxymanagementprotocol
…
xqilla
…
xrandr
…
xrdb
…
xrefresh
…
xrootd
…
xrx
…
xsbench
fix build errors, make mpi variant default and add openmp variant (#9364)
2018-09-26 19:47:51 -06:00
xscope
…
xsd
…
xsdk
xsdk: disable assimp in deal.II (#9190)
2018-09-08 16:07:37 -05:00
xsdktrilinos
…
xset
…
xsetmode
…
xsetpointer
…
xsetroot
…
xsimd
…
xsm
…
xstdcmap
…
xtensor
…
xtensor-python
…
xterm
…
xtl
…
xtrans
…
xtrap
…
xts
…
xvidtune
…
xvinfo
…
xwd
…
xwininfo
…
xwud
…
xxhash
…
xz
…
yajl
…
yambo
…
yaml-cpp
yaml-cpp: conflict with gcc 4.7 instead of 4.8 (#9371)
2018-09-27 13:37:36 -07:00
yasm
…
yorick
…
z3
…
zeromq
…
zfp
…
zip
…
zlib
…
zoltan
…
zsh
…
zstd
…